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繁殖に伴い倍数性構造が生じる生物集団における進化と共存についての数理的研究

研究課題

研究課題/領域番号 22K06407
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分45040:生態学および環境学関連
研究機関埼玉医科大学

研究代表者

別所 和博  埼玉医科大学, 医学部, 助教 (00792227)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2026年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2025年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2024年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2023年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワード数理生物学 / 理論生物学 / 進化生態学 / 集団遺伝学 / メタ個体群 / 倍数性 / 藻類学 / 応用数学 / 配偶体 / 胞子体 / 生活環 / 世代交代 / Fst / 倍数性構造
研究開始時の研究の概要

haploidとdiploidの世代交代や、倍数性を示す生物など、異なるゲノム数と表現型をもつ個体が混じり合う(倍数性構造を示す)生物集団について、それが空間構造と相似であるという視点から、自然選択と遺伝的浮動がいかなる進化動態を引き起こし、それを野外で収集された遺伝・生態情報を用いていかに検証すればいいのかを数理モデルで明らかにする。さらに、異なるゲノム数をもつ個体の共存がいかにして実現され、多様な繁殖システムが進化・維持されるのかを、自然選択によるニッチ分化や遺伝的浮動に伴うクラス間の遺伝的分化などの視点から明らかにする。

研究実績の概要

個体が持つ染色体セット数で特徴づけられる倍数性(や核相)が個体群にもたらす構造を、それが空間構造と相似であるという視点から数理的に解析する研究を実施した。本年度は自身がこれまで取り組んできたhaploidと配偶体とdiploidの胞子体が世代交代する大型藻類の生態と進化について多くの成果を得た。まず、大型藻類で観察されるhaploid-diploid生活環についてこれまで取り組まれてきた研究を、主に数理的視点から総括し、そのまとめを和文論文として発表した。次に、haploid-diploid生活環を示す生物の個体群動態とその存続、配偶体と胞子体の存在比についての数理的解析を英文論文として発表した。さらに、haploid-diploid生活環を示す生物についての興味深い生物現象である配偶体からの胞子体への栄養供給の進化についての研究結果を英文論文として発表した。最後に、haploid配偶体とdiploid胞子体が入り交じる集団に対して、空間構造を定量する統計量として研究されてきたFstを定義し、その性質を調べるという研究を進め、その成果を論文雑誌に投稿した。年度末には日本生態学会第71回全国大会(2024年3月21日、横浜)にてシンポジウム「倍数性構造集団における生態・進化」を開催し、配偶体と胞子体の世代交代や倍数性に関する研究者らを招聘し、最新の情報を共有した。核相で特徴づけられる世代交代と倍数性は共に染色体セット数で特徴づけられるという意味では良く似た概念だが、厳密には異なる。今後、これらの分野における用語や概念等を整理し、二つの分野を統一的に扱える理論的なフレームワークを整備していきたい。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

2023年度は大型藻類について多くの成果が得られた。特に、haploid-diploid生活環についての和文による総説、haploid-diploid生活環を示す生物の個体群動態についての論文、haploid-diploid生活環を示す生物の進化に関する論文の3報が出版された。さらに、haploid-diploid集団について定義されるFstに関する論文も投稿され、現在査読中である。また、倍数性に関するシンポジウムを開催し、メタ個体群(空間構造)と藻類の進化生態学について多くの進展が得られた。

今後の研究の推進方策

引き続き、倍数性構造集団における生態と進化についての理論研究を進める。倍数性構造とのアナロジーが成立する空間構造下での生物の生態・進化についての理論は、倍数性構造を示す生物に限らず応用上重要な生物も含む、多くの生物を理解するにあたり重要な知見であり、引き続き注力する。また、核相に基づく世代交代と倍数性は強い関連性を持つが、厳密には異なる概念なので、そういった染色体セット数が変化する生命現象についての用語や概念等を整理することが、今後、これらを統一的に理解するために必要となると考えており、そこにも取り組みたい。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (6件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] The University of British Columbia(カナダ)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] ブリティッシュコロンビア大学(カナダ)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Evolution of parental care in haploid?diploid plants2024

    • 著者名/発表者名
      Bessho Kazuhiro、Sasaki Akira
    • 雑誌名

      Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences

      巻: 291 号: 2016 ページ: 20232351-20232351

    • DOI

      10.1098/rspb.2023.2351

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stable demographic ratios of haploid gametophyte to diploid sporophyte abundance in macroalgal populations2024

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Bessho
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 19 号: 3 ページ: e0295409-e0295409

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0295409

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 藻類に見られる haploid-diploid 生活環の進化とその数理2023

    • 著者名/発表者名
      別所和博
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 73 号: 2 ページ: 33-47

    • DOI

      10.18960/seitai.73.2_33

    • ISSN
      0021-5007, 2424-127X
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 配偶体と胞子体が混在する集団におけるFst2024

    • 著者名/発表者名
      別所和博、Sarah P. Otto
    • 学会等名
      日本生態学会第71回全国大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 大型藻類の繁殖システムはF統計量から推定できるのか?2024

    • 著者名/発表者名
      別所和博、Sarah P. Otto
    • 学会等名
      日本藻類学会第48回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 空き地を伴う有 限集団における固定確率 - 低出生率低死亡率 戦略の有利性2023

    • 著者名/発表者名
      別所和博、佐藤一憲、佐々木顕
    • 学会等名
      2023年数理生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 格子モデル上での大型藻類生活環の進化2023

    • 著者名/発表者名
      別所和博、Sarah P. Otto
    • 学会等名
      第70回日本生態学会大会(2023年3月17日、オンライン)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 空間構造下での藻類生活環進化に関する理論的研究2023

    • 著者名/発表者名
      別所和博、Sarah P. Otto
    • 学会等名
      日本藻類学会第47回大会(2023年3月21日、オンライン)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] haploid-diploid生物における配偶体による胞子体の養育についての数理モデル2022

    • 著者名/発表者名
      別所和博、佐々木顕
    • 学会等名
      2022年度日本数理生物学会年会(2022年9月7日、オンライン)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 埼玉医科大学プレスリリース(2024年3月11日)

    • URL

      https://www.saitama-med.ac.jp/new/pressrelease_240311.pdf

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 埼玉医科大学プレスリリース(2024年3月26日)

    • URL

      https://www.saitama-med.ac.jp/new/pressrelease_240325.pdf

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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