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局所的なRNAの量的制御による熱応答性核内構造体の形成維持機構と生理的意義の解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K06578
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47030:薬系衛生および生物化学関連
研究機関東京大学

研究代表者

小野口 玲菜  東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード熱ストレス応答 / 非コードRNA / 核内構造体 / 熱ストレス
研究開始時の研究の概要

申請者は、長鎖非コードRNA, MALAT1が熱ストレスに応答して新規核内構造体 HiNoCo bodyを形成することを発見した。 HiNoCo bodyの形成は細胞の増殖に必須であるが、HiNoCo bodyがどのように形成・維持されるのかは十分明らかではない。本研究では、HiNoCo bodyの形成・維持機構およびHiNoCo body依存的な熱応答性遺伝子発現機構を解明することを目的とする。

研究実績の概要

申請者はこれまでに「通常は核スペックルと呼ばれる核内構造体に局在する非コードRNA, MALAT1が熱ストレスに応答して核スペックルから離脱し、新規核内構造体(Heat-inducible Noncoding RNA body; HiNoCo bodyと命名)を形成する」という新しい現象を発見している。本研究計画では長鎖非コードRNA, MALAT1が形成する熱ストレス応答性の核内構造体, HiNoCo bodyの形成・維持機構およびHiNoCo body依存的な熱応答性の遺伝子発現制御機構を解明することを目的としている。
申請者は, 転写阻害剤を添加することによりHiNoCo bodyの形成が阻害されることを見出した。また、これまでに特定のRNAと相互作用するゲノムDNA領域を網羅的に特定する手法, ChIRP-DNAseq法を用いて熱ストレス時にMALAT1と相互作用する標的ゲノムDNA領域を同定している。該当遺伝子の遺伝子発現について解析を行った結果、MALAT1/HiNoCo bodyが該当遺伝子の転写制御に関与する可能性を示唆する結果を得た。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初計画していた, 転写制御に関する実験の結果を得ることができたため。

今後の研究の推進方策

これまでに得られた結果を元に, MALAT1/HiNoCo bodyによる熱ストレス応答遺伝子の発現制御機構の詳細について解析していく予定である。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Techniques for Analyzing Genome-wide Expression of Non-coding RNA2023

    • 著者名/発表者名
      Rena Onoguchi-Mizutani, Kenzui Taniue, Kentaro Kawata, Toshimichi Yamada, Nobuyoshi Akimitsu
    • 雑誌名

      Handbook of Epigenetics

      巻: - ページ: 163-184

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ノンコーディングRNAが形成する新規核内構造体による熱ストレス応答の研究2023

    • 著者名/発表者名
      小野口 玲菜, 小野口 真広, 浜田 道昭, 秋光 信佳
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Heat shock stress response through HiNoCo-body, a novel noncoding RNA containing nuclear body2022

    • 著者名/発表者名
      Rena Onoguchi-Mizutani, Takeshi Kawamura, Nobuyoshi Akimitsu.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia “RNA Biology”
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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