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noncoding RNAによるSECIS制御メカニズムの解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K06606
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47030:薬系衛生および生物化学関連
研究機関同志社大学

研究代表者

三田 雄一郎  同志社大学, 生命医科学部, 准教授 (70609122)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードSelenoprotein P / SECIS / noncoding NRA / 翻訳 / noncoding RNA / Se含有タンパク質
研究開始時の研究の概要

Seは、CysのSがSeに置き換わったセレノシステイン(Sec)という形でタンパク質中に含まれている。Se含有タンパク質のmRNAの3’UTRには、Sec挿入配列(SECIS)が存在することで、UGAにSecが挿入される。我々は、セレノプロテイン P (SeP)の3’UTRと相補的な配列を持つncRNAの L-ISTを同定し、SePタンパク質量をmRNA量非依存的に減少させることを明らかにした。
本研究では、ncRNAによるSECIS制御メカニズムの解明を目的とし、L-ISTの機能性領域配列の同定、機能配列を利用したSe含有タンパク質の翻訳制御の検討、ncRNAを利用した疾患治療法の開発を行う。

研究実績の概要

Se含有タンパク質はタンパク質中にCysの硫黄がセレンに置き換わったセレノシステイン(Sec)の形でセレンを含んでおり、ヒトでは25種類存在している。Secは通常は終始コドンとして認識されるUGAコドンにコードされており、mRNAの3'非翻訳領域中にSec挿入配列(SECIS)と呼ばれる特殊なヘアピン構造を形成する配列が存在する場合にのみ、Secをタンパク質中に挿入するコドンとして利用されている。
Se含有タンパク質のひとつ、Selenoprotein P(SeP)のSECIS領域を含む3'非翻訳領域には、相補的な配列を持つnon codig RNAであるNon-coding RNA-Inhibitor of Selenoprotein P Translation(L-IST)遺伝子が存在し、L-ISTによってSeP mRNAからタンパク質への翻訳が阻害される。しかし、L-ISTによる翻訳抑制に必要な機能配列はいまだ明らかになっていない。本研究課題では、L-ISTの機能配列の同定を試みている。
これまでの解析の結果、L-ISTの機能領域には、SeP mRNAとの非相動性領域が関与していることが明らかになり、5'非相動性領域においては末端から500塩基から600塩基の間に必要領域が存在することが明らかになっている。2023年度は、3'非相動性領域に含まれる機能配列の同定を行った。その結果、3'末端側から500塩基~600塩基に必要配列が存在すること、特に、560塩基~600塩基の間の40塩基がSeP mRNAの翻訳を抑制するための必要な配列であることが明らかになった。
現在、SeP mRNAとL-ISTの相動性配列内にも必要領域があるのではないかと仮説を立て、必要配列の同定を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

3'非相動性領域の欠損変異体を用いた解析において、タンパク質のローディングコントロールとして用いていたACTINやGAPDHが減少するという予定外の事態に遭遇した。
最終的にCBB染色を用いることでタンパク質量がそろっていることを証明できるようになったが、条件検討やコントロールの減少メカニズムの探索に時間を要してしまい、予定よりも実験を進めることができなかった。、

今後の研究の推進方策

2024年度は、L-ISTとSeP mRNAの非相補的な配列に含まれている機能性配列ではなく、相動性配列中に含まれる必要配列の同定を行う。
相動性配列中の機能性配列が同定された後には、他のセレン含有タンパク質をコードするmRNA中に存在する該当配列の相動性配列を組み込んだL-IST変異体を作製することで、L-ISTによるSeP翻訳抑制メカニズムが、SeP mRNA特異的なメカニズムなのか、Se含有タンパク質で一般的に起こる現象なのかを検証する。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] The NERP-4-SNAT2 axis regulates pancreatic β-cell maintenance and function2023

    • 著者名/発表者名
      Zhang Weidong、Miura Ayako、Abu Saleh Md Moin、Shimizu Koichiro、Mita Yuichiro、Tanida Ryota、Hirako Satoshi、Shioda Seiji、Gmyr Valery、Kerr-Conte Julie、Pattou Francois、Jin Chunhuan、Kanai Yoshikatsu、Sasaki Kazuki、Minamino Naoto、Sakoda Hideyuki、Nakazato Masamitsu
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 1-21

    • DOI

      10.1038/s41467-023-43976-8

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] An efficient selenium transport pathway of selenoprotein P?utilizing a high-affinity ApoER2 receptor variant and being independent of selenocysteine lyase2023

    • 著者名/発表者名
      Mizuno Ayako、Toyama Takashi、Ichikawa Atsuya、Sakai Naoko、Yoshioka Yuya、Nishito Yukina、Toga Renya、Amesaka Hiroshi、Kaneko Takayuki、Arisawa Kotoko、Tsutsumi Ryouhei、Mita Yuichiro、Tanaka Shun-ichi、Noguchi Noriko、Saito Yoshiro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 8 ページ: 105009-105009

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105009

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Antioxidant action of persulfides and polysulfides against free radical-mediated lipid peroxidation2022

    • 著者名/発表者名
      Kaneko Takayuki、Mita Yuichiro、Nozawa-Kumada Kanako、Yazaki Masana、Arisawa Mieko、Niki Etsuo、Noguchi Noriko、Saito Yoshiro
    • 雑誌名

      Free Radical Research

      巻: 56 号: 9-10 ページ: 677-690

    • DOI

      10.1080/10715762.2023.2165918

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Role of selenoprotein P expression in the function of pancreatic β cells: Prevention of ferroptosis-like cell death and stress-induced nascent granule degradation2022

    • 著者名/発表者名
      Kitabayashi Nanako、Nakao Shohei、Mita Yuichiro、Arisawa Kotoko、Hoshi Takayuki、Toyama Takashi、Ishii Kiyo-aki、Takamura Toshinari、Noguchi Noriko、Saito Yoshiro
    • 雑誌名

      Free Radical Biology and Medicine

      巻: 183 ページ: 89-103

    • DOI

      10.1016/j.freeradbiomed.2022.03.009

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] セレノプロテインPの翻訳を抑制する新規noncoding RNAの同定およびその病態生理学的意義2022

    • 著者名/発表者名
      三田雄一郎、斎藤芳郎
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 94 ページ: 386-390

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] SH-SY5Y細胞の培養上清によるSelenoprotein P発現抑制メカニズムの解析2024

    • 著者名/発表者名
      三田雄一郎、下村加誉子、山本真帆、野口範子
    • 学会等名
      第 7 回日本セレン研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] エタノールが肝臓細胞のセレノプロテインPに及ぼす影響とそのメカニズムの解明2024

    • 著者名/発表者名
      陳簡、三田雄一郎、野口範子
    • 学会等名
      第 7 回日本セレン研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] パーキンソン病関連タンパク質DJ-1の新規修飾をターゲットとした治療法・予防法の検討2024

    • 著者名/発表者名
      松田康平、三田雄一郎、浦野泰臣、西郷和真、斎藤芳郎、 野口範子
    • 学会等名
      生化学若い研究者の会 近畿・中四国支部 冬のセミナー
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 筋分化C2C12細胞におけるSelenoprotein Pが誘導するインスリン抵抗性に対するシステイン代謝の関与の解析2023

    • 著者名/発表者名
      野口歩夢、三田雄一郎、鎌田莉々香、池田聖司
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] L-ISTの発現に必要な転写因子結合部位の同定2023

    • 著者名/発表者名
      細川萩月, 三田雄一郎, 小槻悠介, 野口範子
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 神経由来SH-SY5Y細胞が分泌するSelenoprotein Pの発現を抑制する因子の探索2023

    • 著者名/発表者名
      山本真帆, 三田雄一郎, 下村加誉子、野口範子
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] SH-SY5Y細胞におけるH2O2誘導性細胞死に対する細胞外DJ-1の細胞保護効果の解析2023

    • 著者名/発表者名
      河井 麗 三田 雄一郎 野口 範子
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] パーキンソン病関連タンパク質DJ-1の新規修飾の同定2023

    • 著者名/発表者名
      松田康平、三田雄一郎、野口範子
    • 学会等名
      第76回日本酸化ストレス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト肝癌細胞HepG2におけるRetinoic AcidによるSelenoprotein Pの減少メカニズムの解析2023

    • 著者名/発表者名
      傳谷理玖, 三田雄一郎, 関谷駿史, 野口範子
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 超硫黄分子種による活性種選択的な脂質過酸化抑制作用2023

    • 著者名/発表者名
      金子尚志, 三田雄一郎, 二木鋭雄, 野口範子, 斎藤芳郎
    • 学会等名
      第76回日本酸化ストレス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Selenoprotein Pを標的とした糖尿病治療の開発2023

    • 著者名/発表者名
      三田雄一郎
    • 学会等名
      レドックスR&D委員会 第2回夏のシンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unknown modification of DJ-1 is increased in red blood cells from Unmedicated patients with Parkinson’s disease.2022

    • 著者名/発表者名
      Kohei Matsuda, Yuichiro Mita, Takuma Kashi, Yuto Kataoka, Kazumasa Saigoh, Yoshiro Saito, Noriko Noguchi
    • 学会等名
      The Society for Redox Biology and Medicine 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 糖尿病関連タンパク質Selenoprotein Pが供給するセレンが,糖尿病による創傷治癒の遅延に与える影響の解析2022

    • 著者名/発表者名
      村田汐梨, 三田雄一郎, 野口範子
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] システインの増加は筋細胞におけるインスリン抵抗性を誘導する。2022

    • 著者名/発表者名
      鎌田莉々香、三田雄一郎、坂口理沙子、星野恭幸、斎藤芳郎、野口範子
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] エタノールが肝臓細胞のセレノプロテインPに及ぼす影響とそのメカニズムの解明2022

    • 著者名/発表者名
      陳簡、三田雄一郎、野口範子
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Se運搬タンパク質Selenoprotein Pによる筋インスリン抵抗性誘導メカニズムにはSe運搬能や抗酸化能は関与しない2022

    • 著者名/発表者名
      三田雄一郎、曽谷奏、坂口理沙子、 中山華穂、 鎌田莉々香、斎藤芳郎、 野口範子
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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