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多彩な構造を有する天然物の迅速評価による核内受容体の活性化・阻害と構造の相関解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K06664
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47050:環境および天然医薬資源学関連
研究機関石川県立大学

研究代表者

関口 光広  石川県立大学, 生物資源環境学部, 准教授 (40822490)

研究分担者 小橋川 敬博  熊本大学, 大学院生命科学研究部(薬), 准教授 (90455600)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード核内受容体 / 酵素誘導 / 天然有機化合物 / 構造活性相関
研究開始時の研究の概要

異物の代謝をコントロールする核内受容体は、大きくフレキシブルな結合領域を有することで様々な化合物によって活性化・不活性化されるため、その活性調節のための知見は乏しい。そこで我々が構築した高いスループットを有するリガンド識別法を活用し、核内受容体リガンドのプロファイリング、構造活性相関研究を行う。これによって将来的に医薬品摂取時の避けるべき食品を明らかし、医薬品の適正使用の提案に資する。

研究実績の概要

核内受容体タンパク質PXR (Pregnane X receptor) やCAR(Constitutive Androstane Receptor)は外因性のリガンドの作用によって活性化や阻害され、薬物代謝酵素の誘導や阻害を引き起こすため、摂取した医薬品の効果を減弱や増強させてしまう。そのため、機能発現のコントロールが重要である。
PXR、CARのリガンド結合領域は非常に大きく、また特異性が低いため、現在までPXR, CARの活性を調節する成分やその構造的特徴についての知見は乏しい。そこで、CAR、PXRに対する作動薬、逆作動薬、拮抗薬を食品成分より体系的に探索することで各機能発現のための化合物の構造上の特徴を明らかにすることを目的とした。

迅速に核内受容体タンパク質PXR, CARとの結合評価が可能な物理化学的評価法を確立し、食品成分のスクリーニングを実施したところ、セージに含まれる13-epimanoolがCARと結合することを見出した。そこで、同じラブダン骨格を有するジテルペノイドのmanoolとsclareolを含めた3つの化合物を用いてCARへの作用を解析した。
Thermal shift assayによって、3つの化合物はCARタンパク質との複合体形成時の構造安定性は大きく変わらないこと、つまり結合力は大きく変わらないことを明らかにした。一方、ルシフェラーゼアッセイにおいてはmanoolはpartial agonist、13-epimanoolは弱いpartial agonist、sclareolはantagonist活性をそれぞれ有していることを見出した。3つの化合物の構造の違いは、13位の立体構造と8位の構造であり、ラブダンジテルペノイドにおいてはこれらの構造の違いがCARのagonist、antagonist活性に影響を与えていることを明らかにした。
同様に、PXRに対するスクリーニングも行い、新規リガンドを見出した。現在構造類似化合物も含めて活性の評価を実施している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

結合アッセイおよびレポーターアッセイを通じて、CARに結合する新たな化合物を見出し、2か所の構造の違いにより活性が大きく異なることを見出した。
また、論文および学会で発表する事で世の中に知見を還元した。

今後の研究の推進方策

昨年度に明らかとなったCARのリガンド化合物の構造の違いによる活性の違いについて、その理由を明らかにするために関連化合物の評価、計算科学を用いた複合体予測を実施する。
また、PXRについても同様に評価する事で、機能発現のための構造の必要条件を解明する。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Activity difference of three labdane diterpenoids on human constitutive androstane receptor2023

    • 著者名/発表者名
      Sekiguchi Mitsuhiro、Fujinami Yui、Takado Keiyu、Kimoto Yuu、Higashimura Yasuki
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 87 号: 11 ページ: 1310-1315

    • DOI

      10.1093/bbb/zbad113

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 3つのラブダン型ジテルペノイドの核内受容体constitutive androstane receptorに対する活性2024

    • 著者名/発表者名
      関口光広、藤浪佑衣、高土恵有、木本祐、東村泰希
    • 学会等名
      2024年度 日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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