研究課題/領域番号 |
22K08388
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分53050:皮膚科学関連
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研究機関 | 札幌医科大学 |
研究代表者 |
宇原 久 札幌医科大学, 医学部, 教授 (40201355)
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研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2023年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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キーワード | 悪性黒色腫 / リキッドバイオプシー / 個別化医療 / デジタルPCR / ctDNA / メラノーマ / 遺伝子パネル |
研究開始時の研究の概要 |
1)2020年に我々が開発したメラノーマに特化した遺伝子パネルによって腫瘍組織から同定された複数の遺伝子変異から候補遺伝子を選択し、患者から定期的に採取された末梢血(血漿)からデジタルPCRを用いて、腫瘍由来変異遺伝子群についてモニターし、単独の遺伝子を用いた場合と感度を比較する。 2)アジュバント療法中の患者について、腫瘍組織の遺伝子パネル情報を元に、複数の遺伝子を検査対象としたときに、末梢血腫瘍由来変異遺伝子のモニターが定期的な画像検査による再発の発見に勝るか検証する。
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研究実績の概要 |
本年度は1)メラノーマの転移を有する症例からの経時的な血清採取と保存、2)原発巣のパネルシークエンスによる個々の患者における特異的な遺伝子変異の検索、3)2)の情報に基づいて1症例をピックアップした。この症例の原発巣はBRAF V600E変異、MTOR,POLE,NTRK3の変異が確認されたため、当該変異部位の遺伝子配列を合成し、デジタルPCRによる患者特異的な腫瘍関連遺伝子を同定するためのプライマーの作成とポジティブコントロール、ネガティブコントロールの作成までを行った。今後はデジタルPCR(QuantStudio Absolute Q)機器で実際に保存されている患者血清から腫瘍特異的な遺伝子変異が検出できるか検索を開始する。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本年度の予定である、1)メラノーマの転移を有する症例からの経時的な血清採取と保存、2)原発巣のパネルシークエンスによる個々の患者における特異的な遺伝子変異の検索、3)2)の情報に基づいて1症例をピックアップした。この症例の原発巣はBRAF V600E変異、MTOR,POLE,NTRK3の変異が確認されたため、当該変異部位の遺伝子配列を合成し、デジタルPCRによる患者特異的な腫瘍関連遺伝子を同定するためのプライマーの作成とポジティブコントロール、ネガティブコントロールの作成までが完了でき、デジタルPCR(QuantStudio Absolute Q)機器で実際に保存されている患者血清から腫瘍特異的な遺伝子変異が検出できるか検証が開始できるため。
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今後の研究の推進方策 |
原発巣のパネルシークエンスによって、原発巣からBRAF V600E変異、MTOR,POLE,NTRK3の変異が確認された症例について、当該変異部位の遺伝子配列を合成し、デジタルPCRによる患者特異的な腫瘍関連遺伝子を同定するためのプライマーの作成とポジティブコントロール、ネガティブコントロールを用いてデジタルPCR(QuantStudio Absolute Q)機器で実際に保存されている患者血清から腫瘍特異的な遺伝子変異が検出できるか検証を開始する。手技が安定すれば症例数を増やして検証する。
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