| 研究課題/領域番号 |
22K08576
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分54030:感染症内科学関連
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| 研究機関 | 東邦大学 (2023)
東京大学 (2022) |
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研究代表者 |
原田 壮平 東邦大学, 医学部, 准教授 (30591630)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円)
2023年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2022年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
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| キーワード | Klebsiella variicola / K. quasipneumoniae / 血流感染症 / 全ゲノム解析 / 病原遺伝子 / MLST |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究はヒト感染症の重要な病原体として広く知られているKlebsiella pneumoniaeの近縁種であるKlebsiella variicolaが起こす感染症の特徴、ヒトに対する病原性の高さ、抗菌薬に対する抵抗性の高さなどについて詳しく調べることを目的にしています。この研究の結果は、将来、Klebsiella variicolaに感染した患者さんの診断や治療のために役立つことが期待されます。
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| 研究実績の概要 |
2023年8月の研究代表者の異動に伴い当初予定していたKlebsiella variicola血流感染症を対象とした多施設研究の実施が困難となったため、予定を変更し、Klebsiella variicola血流感染症および類縁種であるKlebsiella quasipneumoniae血流感染症を対象とした東京大学医学部附属病院における単施設研究に研究計画を変更した。
2010年から2018年に東京大学医学部附属病院で血液培養から検出されK. pneumoniaeと同定された452株について、MALDI-TOF MSおよびMultiplex PCRによる菌種同定を実施し、77株のK. variicola菌株および31株のK. quasipneumoniae菌株を得た。これらのうちK. variicola 62株、K. quasipneumoniae 30株についてMiSeq（illumina）を用いた全ゲノム解析を実施した。K. variicolaについて、multilocus sequence typingによりこれらの菌株の遺伝学的背景は多様であることを確認するとともに、2株がK. pneumoniaeの高病原性と関連するとされる高粘稠性関連遺伝子（rmpA）やシデロフォア関連遺伝子（iro, ybt）を保有していたことを確認した。K. quasipneumoniaeについてK. quasipneumoniae subsp. quasipneumoniaeに属する菌株とK. quasipneumoniae subsp. similipneumoniaeに属する菌株が混在することやK. pneumoniaeにおいて高病原性との関連が高い莢膜遺伝子型を有する株が一部に存在することを確認した。
臨床研究部分については、研究計画を作成し、倫理委員会での審査を受けている状況である。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
研究代表者の異動に伴い当初予定していた多施設研究の実施が困難となり、対象菌種を拡げる形での単施設研究に計画を変更した。計画変更と、変更した計画の倫理委員会申請のために現在まで、研究のうちの臨床研究部分が進んでいないため、全体としても遅れている。
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| 今後の研究の推進方策 |
K. variicola菌株およびK. quasipneumoniae菌株について、残りの16株の全ゲノム解析（MiSeq）を速やかに完遂し、全体でのデータ検討を行う。特徴のあるクローンについて、long-read sequencer（MinION）による全ゲノム解析を加えて、hybrid assemblyによる完全ゲノム解析を行い、重要遺伝子の遺伝子周辺環境を明らかにする。また、倫理委員会での承認が得られ次第、血流感染症患者の臨床情報を収集し、菌株の遺伝学的情報と統合的に解析する。
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