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細胞外小胞を用いた空間的・時間的不均一性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K08787
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55020:消化器外科学関連
研究機関日本医科大学

研究代表者

山田 岳史  日本医科大学, 医学部, 准教授 (50307948)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードLiquid biopsy / 抗EGFR抗体 / 大腸癌 / 細胞外小胞 / 空間的不均一性 / 時間的不均一性 / 薬剤耐性 / リキッドバイオプシー / 不均一性
研究開始時の研究の概要

化学療法における耐性化は、耐性能を獲得したクローン増殖がその主たる原因である。我々は、抗EGFR抗体投与によりEGFR、RAS、BRAFに変異を有するクローンが増殖することをctDNAを用いて明らかにしてきた。しかし、ctDNAは血中のDNA分解酵素により、速やかに分解されるため腫瘍内の希少クローンの存在を同定することは困難である。細胞外小胞内には、血中の分解酵素に暴露されない良質なDNA、RNA、タンパクが含まれる。本研究では、ctDNAよりも希少クローンの同定に適する2種類の細胞外小胞を用いて、大腸癌での空間的・時間的不均一性による分子標的治療に対する耐性獲得メカニズムを明らかにする。

研究実績の概要

本研究では、Liquid biopsyを用いて抗epidermal growth factor receptor (EGFR)抗体の耐性獲得メカニズムを解明することを目的とした。これまでの研究から、腫瘍組織の検査でRAS野生型と診断された患者の10%以上の症例の腫瘍内にRAS/BRAF変異クローンが存在している(空間的不均一性)ことを明らかにしており、この空間的不均一性は、治療効果に影響を及ぼすと考えていた。RAS/BRAF以外にも、PIK3CA変異、HER2の増幅、METの増幅、等の空間的不均一性があり、またRAS変異、BRAF変異、PIK3CA変異、HER2の増幅、METの増幅には時間的不均一性があるため、これらが治療効果に与える影響を検証した。研究開始前の仮説に反し、RAS変異、BRAF変異、PIK3CA変異の空間的不均一性は、奏効率という点では抗EGFR抗体の効果に影響を与えなかった。しかし、奏効期間には影響を与える可能性があり、現在、経過観察中である。
多くの症例で、RAS変異、BRAF変異、PIK3CA変異、HER2増幅の時間的不均一性が観察され、特に、HER2が治療開始直後から増幅する症例では、効果が得られないことが明らかとなった。またRAS変異、BRAF変異、PIK3CA変異は多くの症例で観察されたが、これらの変異は抗EGFR抗体投与終了後、約1年で消失し、これらの症例では、抗EGFR抗体が再度奏効することも明らかとなった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

抗EGFR抗体の投与によりRAS変異、BRAF変異、PIK3CA変異、およびHER2の増幅が生じることが確認できた。METの増幅についてはまだ確認できていない。
末梢血からSmall extracellular vesicles (S-EV)およびLarge extracellular vesicles (L-EV)を抽出することができた。S-EV単離キットを用いるとL-EVが混じることが明らかになったので、新たにマイクロ流路を作成し、S-EVのみを単離することに成功した。単離したS-EVを用いることで、circulating tumor DNA (ctDNA)を用いるよりも高感度にRAS等の変異を同定できることを明らかにした。

今後の研究の推進方策

本研究では、血液中の循環DNAと細胞外小胞(extracellular vesicles:EVs)を用いて行っている。細胞外小胞は100 nm程度のSmall EVsと400 nm程度、あるいはそれ以上の大きさを持つLarge EVsに分類される。市販のEVs単離キットを用いるとSmall EVsとLarge EVsが混じったものが採取される。独自に開発したマイクロ流路を用いることでSmall EVsのみを単離することに成功したため、純度の高いSmall EVsを用いた解析を進める。またLarge-EVsのみを単離する方法の開発を継続する。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Analysis of Circulating DNA to Assess Prognoses for Metastatic Colorectal Cancer Patients Treated with Regorafenib Dose-Escalation Therapy: A Retrospective, Exploratory Analysis of the RECC Trial2023

    • 著者名/発表者名
      Ohta Ryo、Yamada Takeshi、Nakamura Masato、Enomoto Masanobu、Takahashi Makoto、Yokomizo Hajime、Kosugi Chihiro、Ishimaru Kei、Sonoda Hiromichi、Kuramochi Hidekazu、Yoshida Yoichiro、Furuya Shinji、Hirata Keiji、Yoshida Hiroshi、Nozawa Keijiro、Hashiguchi Yojiro, et al.
    • 雑誌名

      Digestion

      巻: 104 号: 3 ページ: 233

    • DOI

      10.1159/000528283

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Impact of RAS and BRAF heterogeneity on the efficacy of EGFR blockade in patients with metastatic colorectal cancer.2023

    • 著者名/発表者名
      Yamada T, et al.
    • 学会等名
      ASCO Gastrointestinal Cancers Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Precision medicine for patients with colorectal cancer using liquid biopsy2023

    • 著者名/発表者名
      Yamada T, et al.
    • 学会等名
      日本癌治療学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ふたつのHeterogeneityが抗EGFR抗体の治療効果に与える影響2023

    • 著者名/発表者名
      山田岳史、他
    • 学会等名
      日本消化器外科学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 尿と細胞外小胞を用いた大腸癌Liquid biopsy2023

    • 著者名/発表者名
      山田岳史
    • 学会等名
      日本消化器病学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Impact of RAS and BRAF heterogeneity on the efficacy of EGFR blockade in patients with metastatic colorectal cancer.2023

    • 著者名/発表者名
      山田岳史
    • 学会等名
      ASCO-GI
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection of RAS mutations in colorectal cancer patients using DNA from extracellular vesicles2023

    • 著者名/発表者名
      栗山翔、山田岳史
    • 学会等名
      American Association for Cancer Research
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ふたつのHeterogeneityがもたらす大腸癌の難治性とその克服2022

    • 著者名/発表者名
      山田岳史
    • 学会等名
      Japan Digestive Disease Week 2002
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 消化管疾患のLiquid biopsy2022

    • 著者名/発表者名
      山田岳史
    • 学会等名
      日本消化管学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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