| 研究課題/領域番号 |
22K09311
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 審査区分 |
小区分56020:整形外科学関連
|
|---|
| 研究機関 | 横浜市立大学 |
|---|
研究代表者 |
崔 賢民 横浜市立大学, 医学部, 准教授 (20760888)
|
|---|
| 研究分担者 |
稲葉 裕 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (40336574)
手塚 太郎 横浜市立大学, 医学研究科, 客員研究員 (70748516)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2024年度)
|
| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
|
|---|
| キーワード | 整形外科感染 / インプラント / バイオフィルム / 遺伝子診断 / PCR / 混合感染 / 人工関節周囲感染 / 細菌培養 / 脊椎感染 / 小児化膿性関節炎 / シーケンサー / ポリメラーゼチェインリアクション / 薬剤耐性 / 感染 / 整形外科 / 化膿性関節炎 / 脊椎関節炎 / 骨軟部組織感染 / 次世代シークエンサー / ナノポア |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
骨軟部感染症患者に対するナノポアシーケンサーMinION MK1C による細菌同定および薬剤耐性の診断精度を明らかにする。また骨軟部感染患者において、ナノポアシーケンサーによる感染経路の解明が可能であるかについて明らかにする。薬剤耐性遺伝子を用い精度で同定することが可能であれば、難治性となることが多い細菌培養陰性症例における抗菌薬の選択への応用と治療成績の改善が見込まれる。また、感染経路について解析することで、感染巣における感染治療後の再感染の防止に貢献することが期待される。
|
| 研究成果の概要 |
ナノポアシーケンサーMinION MK1Cの人工関節周囲感染（PJI）診断精度を検討した。2020年7月～2022年5月に当院で細菌培養陽性と診断されたPJI 61例を対象に、従来の細菌培養や16S rRNA PCRと比較した結果、MinIONは74.5％で培養同定菌属を検出し、47.5％で培養陰性菌を同定した。ONSは混合感染の検出にも優れ、16S rRNA陽性例での検出率は81.6％であった。さらに現在、PJI以外の感染例での有用性と、唾液・糞便・表皮検体と創部との菌株一致による感染経路の特定を検証中である。
|
| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究は、ナノポアシーケンサーMinION MK1Cが、従来の細菌培養やPCRでは検出困難な病原菌や混合感染の同定に有用であることを示した。特に培養陰性例や多菌種感染の診断精度向上が期待され、早期診断・適切な抗菌薬選択に貢献する。さらに、感染経路の同定により再発防止や感染対策の強化が可能となり、整形外科領域における感染症管理の新たな診断基盤を提供する点で学術的・社会的意義は大きい。
|
