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歯の異常に多様性をもたらす分子機構の解明へ向けた組織特異的横断的オミクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K10239
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分57070:成長および発育系歯学関連
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

小川 卓也  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 准教授 (50401360)

研究分担者 田中 敏博  東京医科歯科大学, 統合研究機構, 教授 (50292850)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード希少遺伝性疾患 / 横断的オミクス解析 / 歯数・形態異常
研究開始時の研究の概要

網羅的なゲノム解析技術の発展に伴い、歯の形態形成に関与する様々な遺伝子が明らかになってきたが、ヒトにおける形質情報との因果関係を明らかにするには至っていない。そこで、本課題では、疾患患者から得られた歯細胞を用い、組織特異的な横断的オミクス解析により、疾患ゲノム情報を中心に、症状ならびに遺伝子発現量の違いを分野横断的に統合することで、疾患病態の解明ひいては歯数ならびに形態を決定する運命因子を同定することを目的とした。本研究は、歯科領域からヒト疾患ゲノム情報の適切な解釈と社会実装の推進が期待される。

研究実績の概要

本課題では、疾患患者から得られた歯細胞を用い、組織特異的な横断的オミクス解析により、疾患ゲノム情報を中心に、症状ならびに遺伝子発現量の違いを分野横断的に統合することで、疾患病態の解明ひいては歯数ならびに形態を決定する因子の同定を目的とした。2023年度の研究実績の概要を以下に示す。
歯根の過伸長を認めるBCOR遺伝子にフレームシフト変異を有するoculo-facio-cardio-dental (OFCD) 症候群患者の歯根膜細胞(Mut-PDL)において、ナンセンス変異依存mRNA分解機構(NMD)の中心的な因子であるup-frameshift protein 1 (UPF1)をノックダウンし歯根形成関連因子の発現量をqPCR法により解析したところ、OCN、ALP、RUNX2の発現量は有意差を認めないもののやや上昇傾向を示し、DSPの発現量は有意に上昇した。一方、BMP2の発現量は有意に低下した。また、UPF1の過剰発現により、OCN、ALPおよびBMP2の発現量は有意に上昇した。Mut-PDLにおけるUPF1のノックダウンならびに過剰発現の結果、相反する発現パターンを示すBMP2に着目したところ、Mut-PDLにおけるBMP2の発現量は、健常者女性の歯根膜細胞と比較して有意に低下していた。さらに、ヒト歯根膜線維芽細胞株にWT-BCOR を過剰発現させたところ、BMP2 の発現量は有意に上昇し、Mut-BCORによりBMP2の発現量は有意に低下した。
以上より、OFCD症候群患者の歯根膜細胞において、BCORのフレームシフト変異により生じた早期終止コドンにUPF1が結合しNMDが生じ、BMP2の発現量を調節することで歯根長の異常を引き起こしている可能性が示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

OFCD症候群以外にも、short root anomalyにおいてゲノム解析並びに患者から得られる臨床情報を統合して、疾患発症要因ならびに責任遺伝子の機能の解明を行なっている。

今後の研究の推進方策

引き続き希少遺伝性疾患患者のゲノム解析ならびに疾患組織から得られた情報を分野横断的に統合させることで、歯の数ならびに形態を規定する分子機構を明らかにしていく。具体的には、次世代シークエンサーを用いたRNAシークエンスにより、mRNAを中心に発現変動を網羅的に解析することで、直接遺伝子発現量に影響を与える転写調節領域の変異や転写因子の異常のほか、alternative splicing産物や染色体リアレンジメントななど構造異常による融合遺伝子産物の検出を行う。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] University of Sao Paulo(ブラジル)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Nonsense-mediated mRNA decay affects hyperactive root formation in oculo-facio-cardio-dental syndrome via up-frameshift protein 12024

    • 著者名/発表者名
      Machida Ryoto、Ogawa Takuya、Min Soe Kyaw、Moriyama Keiji
    • 雑誌名

      Journal of Oral Biosciences

      巻: 66 号: 1 ページ: 225-231

    • DOI

      10.1016/j.job.2024.01.008

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical report: Chronic liver dysfunction in an individual with an AMOTL1 variant2022

    • 著者名/発表者名
      Kirino Shizuka、Suzuki Mitsuyoshi、Ogawa Takuya、Takasawa Kei、Adachi Eriko、Gau Maki、Takahashi Ken、Ikeno Mitsuru、Yamada Mamiko、Suzuki Hisato、Kosaki Kenjiro、Moriyama Keiji、Yoshida Masayuki、Morio Tomohiro、Kashimada Kenichi
    • 雑誌名

      European Journal of Medical Genetics

      巻: 65 号: 11 ページ: 104623-104623

    • DOI

      10.1016/j.ejmg.2022.104623

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular mechanism of hyperactive tooth root formation in oculo-facio-cardio-dental syndrome2022

    • 著者名/発表者名
      Min Soe Kyaw、Ogawa Takuya、Moriyama Keiji
    • 雑誌名

      Frontiers in Physiology

      巻: 13 ページ: 946282-946282

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.946282

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Association between Child Abuse and Poor Oral Habits in Mongolian Adolescents2022

    • 著者名/発表者名
      Okawara A, Matsuyama Y, Yoshizawa Araki M, Unnai Yasuda Y, Ogawa T, Tumurkhuu T, Ganburged G, Bazar A, Fujiwara T*, Moriyama K*
    • 雑誌名

      International Journal of Environmental Research and Public Health

      巻: 19(17) 号: 17 ページ: 10667-10667

    • DOI

      10.3390/ijerph191710667

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Association between gender and tooth agenesis patterns in patients with non-syndromic cleft palate2023

    • 著者名/発表者名
      Omori Y, Nakagawa Kang J, Uezono M, Ogawa T, Moriyama K.
    • 学会等名
      2023 APCA, APCLPC & Chang Gung Forum
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Exome analysis of short root anomaly in Japanese population2023

    • 著者名/発表者名
      Sagawa Y, Ogawa T, Sudo T, Nagata Y, Moriyama K, Tanaka T.
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第68回大会, Human Genetics Asia 2023 合同開催, 第14回アジアパシフィック人類遺伝学会, 第22回東アジア人類遺伝学会連合
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] AMOTL1病的バリアントを有する両側性口唇口蓋裂の1例2023

    • 著者名/発表者名
      浮田奈穂、小川卓也、森山啓司.
    • 学会等名
      第47回 日本口蓋裂学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Oclulo-facio-cardio-dental症候群における歯根形態異常発症に関する分子メカニズムについて2022

    • 著者名/発表者名
      小川卓也、Kyaw Min Soe、森山啓司
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第67回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Association between maternal smoking during pregnancy and short root anomaly in offspring2022

    • 著者名/発表者名
      Sagawa Y, Ogawa T, Matsuyama Y, Nakagawa Kang J, Yoshizawa Araki M, Unnai Yasuda Y, Tumurkhuu T, Ganburged G, Bazar A, Tanaka T, Fujiwara T, Moriyama K
    • 学会等名
      The 55th Annual Congress of the KAO and the 13th Asian Pacific Orthodontic Congress
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 包摂性のある社会の実現に向けた矯正歯科の役割~難病や障害を抱えている患者の矯正歯科治療~2022

    • 著者名/発表者名
      小川卓也
    • 学会等名
      第76回 NPO法人日本口腔科学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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