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疫学を中心とした学際的アプローチに基づく医学論文査読の実証分析と教育への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22K10388
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分58010:医療管理学および医療系社会学関連
研究機関福島県立医科大学

研究代表者

大前 憲史  福島県立医科大学, 公私立大学の部局等, 講師 (60645430)

研究分担者 片岡 裕貴  京都大学, 医学研究科, 客員研究員 (10814379)
マスワナ 紗矢子  東京理科大学, 教養教育研究院葛飾キャンパス教養部, 准教授 (60608933)
荒牧 英治  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (70401073)
金丸 敏幸  京都大学, 国際高等教育院, 准教授 (70435791)
水本 篤  関西大学, 外国語学部, 教授 (80454768)
栗田 宜明  福島県立医科大学, 公私立大学の部局等, 特任教授 (80736976)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード査読 / 医学論文 / 自然言語処理 / ランダム化比較試験 / 大規模言語モデル / コーパス / Move分析
研究開始時の研究の概要

まず、公開査読制を採用する医学研究雑誌の査読レポートを集積し、査読に特化した膨大な言語表現データベース(コーパス)を構築する。さらに、コーパスを利用して、医学研究のデザインや方法論的枠組みに着目した疫学的分析と査読特有の構造や評価表現に着目した言語学的分析から、査読者の思考や嗜好を質と量の両面から明確化する。構築したコーパスや明確化した査読者の思考や嗜好は、査読教育用の資材としても活用することを想定する。

研究実績の概要

研究の第一段階として、我々はまず、査読者コメントを意味的なまとまりに分類し、各パートに意味づけするアノテーションを行った。今回は、公開査読制を採用し、かつ4大トップジャーナルの1つとして知られるThe British Medical Journal (BMJ)に焦点を絞り、BMJに掲載されたランダム化比較試験(RCT)論文に対する査読レポートを解析した。
その後、2022年11月に米国のOpenAI社がChatGPTをリリースしたことを皮切りに、膨大なテキストデータを用いて訓練された先進的な大規模言語モデルが次々と登場し、比較的安価で簡単に利用できるようになった。訓練に用いられたテキストデータには医学研究や論文に関するものも多く含まれており、医学分野での応用事例もいくつか報告された。本研究の計画当初の最も大きな目的は、医学論文査読に特化したコーパスの構築であったが、これら大規模言語モデルの性能の高さからコーパス構築の必要性は高くないとの判断に至った。実際、上記アノテーション作業には関わっていない臨床医兼研究者2名とChatGPT(モデル:GPT-3.5-turbo)それぞれ別々に査読レポートの言語解析を行ってもらったところ、解析結果の一致割合は人同士の方が高かったものの、ChatGPTによる解析結果も十分に理解・許容可能なものであった。
そこで、我々は査読作業における大規模言語モデルの有効性を検討した先行研究について文献レビューを実施した。見つかった文献のうち、模擬査読でGPT-4の有効性を明らかにした論文では、解析に用いられたプロンプトも公開されていた。目下、それらを応用し、GPT-4を併用したさらなる査読レポートの言語解析に取り組んでいる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

上述の通り、大規模言語モデルが登場し解析にも活用できるようになったことで、当初の目的であった医学論文査読に特化したコーパスの構築は不要になった。さらに、言語解析にも応用できることがわかり、新たに関連文献のレビューを追加して知見を深めた。全体的な進捗は概ね、順調と考える。

今後の研究の推進方策

今後は、引き続きGPT-4をはじめとする大規模言語モデルを活用しながら、さらに査読者コメントの言語解析を進め、特に統計査読者や患者査読者など、査読者の立場の違いがコメントの対象や内容にどのような影響を与えるかに着目していく。さらに、特に日本の臨床家が論文執筆の際、簡単ですぐに参照できるようなReviewer at Handといった仕組みを実装できるよう引き続き研究を進めていく。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 7件)

  • [雑誌論文] 論文解説:Longitudinal Associations between Concurrent Changes in Phenotypic Frailty and Lower Urinary Tract Symptoms among Older Men.2023

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 雑誌名

      排尿障害プラクティス

      巻: 31 ページ: 167-176

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 効果的な論文査読を行うために知っておきたい重要な視点2023

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 雑誌名

      老年看護学

      巻: 27 ページ: 26-31

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] まるわかり!医学論文査読のお作法 その① 査読ってなに?2024

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      Dr’s Prime Academia
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] データベース研究初級者が学ぶ Clinical QuestionからResearch Questionへ2024

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      第1回疫学初級ウェビナー
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 須賀川Study論文化への道 そしてキャリアが拓けた!2024

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      第11回 會津藩校日新館 臨床研究デザイン塾
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] リサーチクエスチョンにおいて何が最も重要なのか?: Feasible, Interesting, Novel, Ethical, Relevant.2023

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      日本臨床疫学会第6回年次学術大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 量的研究論文、私はこう書く2022

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      PCR Connect 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 研究論文のどのパートが最も重要なのか?Introduction, Methods, Results, Discussion2022

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      日本臨床疫学会第5回年次学術大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 効果的な論文査読を行うために知っておきたい重要な視点2022

    • 著者名/発表者名
      大前憲史
    • 学会等名
      日本老年看護学会第27回学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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