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がん臨床研究における治療効果を推定するための非線形回帰モデルに関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 22K11937
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分60030:統計科学関連
研究機関和歌山県立医科大学

研究代表者

下川 敏雄  和歌山県立医科大学, 医学部, 教授 (00402090)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードアンサンブル樹木法 / 治療効果モデル / Meta-learner / 異質性治療効果 / サブグループ同定法 / 生存時間解析 / がん臨床研究 / リアルワールド・データ
研究開始時の研究の概要

近年,医薬品の臨床開発において,「リアルワールド・データ」あるいは「医療ビッグデータ」に注目が集まっている.本研究の目的は,これらの大規模データに含まれている患者背景情報に基づいて治療効果(臨床的アウトカムの差)を推定するための非線形回帰モデルを開発することにある.このとき,適用場面として,がん臨床研究の臨床評価過程において頻用される生存時間データに焦点を当てるとともに,非線形回帰モデルとして,CART法に代表される樹木モデル,樹木モデルを基本学習器に用いたアンサンブル学習法,樹木モデルから派生したプロダクション・ルールに基づく非線形回帰モデルに焦点を当てる.

研究実績の概要

今年度は,共有基底条件付き平均回帰(SCMR; Shared basis conditional mean regression, Powers et al., 2018)の概念のもと,主効果を伴う治療効果モデルを開発するとともに,生存時間解析への拡張を行った.それらの手法では,昨年度までと同様に,ルール・アンサンブル法(Friedman & Popescu, 2008)あるいは生存時間ルール・アンサンブル法(下川他, 2013, Fokkema et al., 2017)を回帰モデルとして採用するとともに,回帰パラメータの推定において,Group lasso法(Bakin, 1999)を用いた.
連続応答に対する主効果を伴う因果ルール・アンサンブル法は,2023年度 日本計量生物学会年会,64th ISI World Congress (Ottawa, Canada)で発表するとともに,国際論文誌「Statistical Methods in Medical Research」に採択された.また,生存時間データに対する主効果を伴う因果ルール・アンサンブル法は,2023年度 日本計量生物学会年会,64th ISI World Congress (Ottawa, Canada)で発表しており,現在,論文投稿中である.
また,生存時間データに対するmeta-learnerに関する検討を開始した.生存時間データでは,HTEの定義について,(1) 生存時間の差,(2) 生存率の差,(3)対数ハザードの差など,論文によって様々である.そのため,当該研究では,HTEの定義を整理するとともに,それぞれに対するmeta-learnerの枠組みのもと,シミュレーションに基づいて適切な方法を検討した.その中間成果については,2023年度 日本計量生物学会年会のなかで公表した.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

2023年度の位置づけは,新たな治療効果モデルの開発,とくに生存時間データへの拡張を行うことであった.その点では,通常の治療効果モデルが「治療+治療×共変量の交互作用」の検討のみであったものを(予測因子の検討),「治療+共変量+治療×共変量の交互作用」に発展させた(予後因子・予測因子の検討)ことは,大きな成果であったと考えられる.この新たな概念がStatistical Methods in Medical Researchに採択されたことは,国際的にも認められたと考えている.
また,この新たな治療効果モデルを生存時間データに拡張した方法について,64th ISI World Congress (Ottawa, Canada)で公表し,論文を投稿することができた.また,主に機械学習分野で研究されているmeta-learnerを生存時間データに拡張することの可能性について検討できた.このことは,本事業の目標である「生存時間データに治療効果モデルを拡張する」が着実に実行できていることを示しているものである.
医療統計学では,医療系分野におけるニーズをいち早くキャッチアップするとともに,そのニーズに応える形で新たな手法を開発すべきである.本事業に関連して開催した「第4回かごしまデータ科学シンポジウム」,「第5回かごしまデータ科学シンポジウム」を開催したことは,このニーズをとらえるうえで有益であった.
さらに,2022年度に懸念事項であった,四川大学(中国)との大規模疫学研究の再開に関する打ち合わせを行えたことも,提案手法を適応するためのフィールド整備として非常に実りあるものとなった.

今後の研究の推進方策

2024年度は,本事業の最終年度となるため,現在開発中のすべての手法を論文化すること,および統計パッケージとして公表することを目的とする.
これまでに開発した治療効果モデルは,二つの治療法(治療薬)に限定して検討を行ってきた.他方,RWD (Real World Data)への適用を考慮した場合,三つ以上の多群比較に治療効果モデルを展開する必要がある.今年度の一つ目の目標は,多群比較のための治療効果モデルを開発することである.多群比較のための治療効果モデルの開発においても,これまでと同様に共有基底条件付き平均回帰を拡張する.
2023年度に開発した生存時間に対する因果ルール・アンサンブル法は,臨床試験を意図しており,傾向スコアによるバイアス補正を行っていない.また,HTEを対数ハザードの差で定義している(つまり,比例ハザード・モデルを拡張している)ため,免疫チェックポイント阻害薬の上乗せ効果を評価するような場面(すなわち,非比例ハザード性が明らかである場面)では,適切にモデル構築が行えない可能性がある.そのため,今年度の二つ目の目標は,加速モデルのもとで新たなルール・アンサンブル法を開発するとともに,傾向スコアによるバイアス補正を伴う形式で生存時間因果ルール・アンサンブル法を開発する.
さらに,本事業から次の展開に繋げるための新たな取り組みとして,がん臨床試験における探索的なサブグループ解析を支援するための新たなツールを開発する.そこでは,QUINT法(Dusseldorp, 2013)を生存時間データに拡張する形で開発する.

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件)

  • [国際共同研究] 四川大学/西南交通大学(中国)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Causal rule ensemble method for estimating heterogeneous treatment effect with consideration of prognostic?effects2024

    • 著者名/発表者名
      Hiraishi Mayu、Wan Ke、Tanioka Kensuke、Yadohisa Hiroshi、Shimokawa Toshio
    • 雑誌名

      Statistical Methods in Medical Research

      巻: - 号: 6 ページ: 1021-1042

    • DOI

      10.1177/09622802241247728

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rule ensemble method with adaptive group lasso for heterogeneous treatment effect Estimation2023

    • 著者名/発表者名
      Ke Wan, Kensuke Tanioka, Toshio Shimokawa
    • 雑誌名

      Statistics in Medicine

      巻: -

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 異質性治療効果に対する調整型因果ルールアンサンブル法2023

    • 著者名/発表者名
      平石麻友・万可・谷岡健資・宿久洋・下川敏雄
    • 学会等名
      2023年度 日本計量生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 生存時間データにおけるMeta-learnerの検討2023

    • 著者名/発表者名
      下川敏雄
    • 学会等名
      2023年度 日本計量生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 予後因子の影響を調整した生存時間因果ルールアンサンブル法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      万可・下川敏雄
    • 学会等名
      2023年度 日本計量生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 地理的加重回帰分析とその拡張について2023

    • 著者名/発表者名
      下川敏雄
    • 学会等名
      日本計算機統計学会 第37回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Survival causal rule ensemble method considering the prognostic factors for estimating heterogeneous treatment effect Author2023

    • 著者名/発表者名
      Ke Wan, He Guanwenqing, Toshio Shimokawa
    • 学会等名
      64th ISI World Statistics Congress
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Causal rule ensemble method considering the main effect In heterogeneous treatment effect2023

    • 著者名/発表者名
      Mayu HIraishi, Ke Wan, Toshio Shimokawa
    • 学会等名
      64th ISI World Statistics Congress
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Pythonを用いた臨床試験における中央モニタリングレポートの自動作成プログラムの構築2023

    • 著者名/発表者名
      北山恵・下川敏雄
    • 学会等名
      日本計算機統計学会 第36回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 臨床研究法下における非特定臨床研究の実施状況の地域差に関する検討2023

    • 著者名/発表者名
      笹山洋子・下川敏雄
    • 学会等名
      日本計算機統計学会 第36回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Causal bagging multivariate adaptive regression splines via adaptive group lasso2023

    • 著者名/発表者名
      He Guanwenqing, Wan Ke, 丸尾和司, 下川敏雄
    • 学会等名
      日本計算機統計学会 第36回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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