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Generalized linear mixed models for copula-based bivariate survival analysis

研究課題

研究課題/領域番号 22K11948
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分60030:統計科学関連
研究機関統計数理研究所 (2023)
久留米大学 (2022)

研究代表者

江村 剛志  統計数理研究所, 統計基盤数理研究系, 教授 (20464802)

研究分担者 道前 洋史  北里大学, 薬学部, 講師 (70447069)
魚住 龍史  東京工業大学, 工学院, 准教授 (30738836)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードコピュラ / 生存時間解析 / 代替エンドポイント / 競合リスク / 信頼性 / ワイブル分布 / 最尤推定 / ベイズ推定 / Cox回帰 / リッジ回帰 / 動的予測 / 従属打ち切り / Copula / Frailty / Censoring / Cox regression / Conditional copula
研究開始時の研究の概要

患者の生存期間と無増悪期間の相関構造をコピュラでモデリングして行う統計データ解析手法は医学研究において有用である。データの統合解析などにより, 複数の集団から得た患者の生存時間を解析するためフレイルティ項を加えたモデルが近年注目を集めている. 本研究では, 条件付きコピュラを用いて相関構造をモデリングするフレイルティ・コピュラのモデルを拡張し、患者の予後予測に活用する. モデルの実践的な有用性を示すため, より具体的に患者の生存期間と無増悪期間の相関をコピュラでモデル化する手法を考える. モデルのパラメータを推定する際には, 最尤法を用いる. 患者の予後予測のためのウェブアプリを公開する。

研究実績の概要

研究計画にあるよう、多変量生存時間解析におけるコピュラモデリングの研究を進めた。2023年度内の出版の中では特に、従属切断下における、生存予後予測法の感度分析法とマン・ホイットニー効果(治療効果)の実験計画による推定法が重要な研究結果となり、これらを研究集会で発表した。また、韓国や台湾から招待を受け、講演を行い、研究成果を発表した。研究が順調に進行していることと、研究分担者の協力もあり、多くの研究成果が得られた年であった。特に、久留米をはじめとした国内で多数行った研究打ち合わせが、実績に結び付いたと考えられる。生存時間解析におけるコピュラの応用は、左切断・競合リスクデータの解析の問題にも発展し、関連する論文を出版することが出来た。2023年度の査読付き欧文原著論文の出版数、査読付き邦文論文の出版数、海外講演および国内講演の数は、予定を大幅に上回った。昨年度に引き続き、当初の予定を大きく上回る実績となった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本研究計画で行った研究論文が順調に出版された結果、9本の査読付き欧文原著論文を出版(6件は責任著者、3件は筆頭著者)した。また、2本の査読付き邦文を出版(2件とも単著)、7件の海外講演、4件の国内講演を行った。昨年度に引き続き、当初の予定を大きく上回る実績となった。

今後の研究の推進方策

今年度も、昨年度に引き続き予想を上回る研究実績が予想される。引き続き、研究費を有効活用して行きたい。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (18件) (うち国際共著 14件、 査読あり 17件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 9件、 招待講演 14件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [雑誌論文] g.ridge: An R Package for Generalized Ridge Regression for Sparse and High-Dimensional Linear Models2024

    • 著者名/発表者名
      Emura T, Matsumoto K, Uozumi R, Michimae H
    • 雑誌名

      Symmetry

      巻: 16 号: 2 ページ: 223-223

    • DOI

      10.3390/sym16020223

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Change point estimation under a copula-based Markov chain model for binomial time series2023

    • 著者名/発表者名
      Emura Takeshi、Lai Ching-Chieh、Sun Li-Hsien
    • 雑誌名

      Econometrics and Statistics

      巻: 28 ページ: 120-137

    • DOI

      10.1016/j.ecosta.2021.07.007

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Sensitivity Analysis for Survival Prognostic Prediction with Gene Selection: A Copula Method for Dependent Censoring2023

    • 著者名/発表者名
      Yeh Chih-Tung、Liao Gen-Yih、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Biomedicines

      巻: 11 号: 3 ページ: 797-797

    • DOI

      10.3390/biomedicines11030797

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A survival tree based on stabilized score tests for high-dimensional covariates2023

    • 著者名/発表者名
      Emura Takeshi、Hsu Wei-Chern、Chou Wen-Chi
    • 雑誌名

      Journal of Applied Statistics

      巻: 50 号: 2 ページ: 264-290

    • DOI

      10.1080/02664763.2021.1990224

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A class of general pretest estimators for the univariate normal mean2023

    • 著者名/発表者名
      Shih, J.-H. Konno, Y., Chang, Y-T., and Emura
    • 雑誌名

      Commmunication in Statistics-Theory and Methods

      巻: 52 号: 8 ページ: 2538-2561

    • DOI

      10.1080/03610926.2021.1955384

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Bayesian ridge regression for survival data based on a vine copula-based prior2023

    • 著者名/発表者名
      Michimae Hirofumi、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      AStA Advances in Statistical Analysis

      巻: 107 号: 4 ページ: 755-784

    • DOI

      10.1007/s10182-022-00466-4

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Estimation of the Modified Weibull Additive Hazards Regression Model under Competing Risks2023

    • 著者名/発表者名
      Rehman Habbiburr、Chandra Navin、Emura Takeshi、Pandey Manju
    • 雑誌名

      Symmetry

      巻: 15 号: 2 ページ: 485-485

    • DOI

      10.3390/sym15020485

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamic lifetime prediction using a Weibull-based bivariate failure time model: a meta-analysis of individual-patient data.2023

    • 著者名/発表者名
      Shinohara S, Lin YH, Michimae H, Emura T
    • 雑誌名

      Communications in Statistics - Simulation and Computation

      巻: 52 号: 2 ページ: 349-368

    • DOI

      10.1080/03610918.2020.1855449

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Consistency of the Estimator for the Common Mean in Fixed-Effect Meta-Analyses2023

    • 著者名/発表者名
      Taketomi Nanami、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Axioms

      巻: 12 号: 5 ページ: 503-503

    • DOI

      10.3390/axioms12050503

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Factorial survival analysis for treatment effects under dependent censoring2023

    • 著者名/発表者名
      Emura Takeshi、Ditzhaus Marc、Dobler Dennis、Murotani Kenta
    • 雑誌名

      Statistical Methods in Medical Research

      巻: 33 号: 1 ページ: 61-79

    • DOI

      10.1177/09622802231215805

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Bayesian ridge estimators based on copula-based joint prior distributions for regression coefficients2022

    • 著者名/発表者名
      Michimae Hirofumi、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Computational Statistics

      巻: 37 号: 5 ページ: 2741-2769

    • DOI

      10.1007/s00180-022-01213-8

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Left‐truncated and right‐censored field failure data: Review of parametric analysis for reliability2022

    • 著者名/発表者名
      Emura Takeshi、Michimae Hirofumi
    • 雑誌名

      Quality and Reliability Engineering International

      巻: 38 号: 7 ページ: 3919-3934

    • DOI

      10.1002/qre.3161

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Likelihood Inference for Copula Models Based on Left-Truncated and Competing Risks Data from Field Studies2022

    • 著者名/発表者名
      Michimae Hirofumi、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Mathematics

      巻: 10 号: 13 ページ: 2163-2163

    • DOI

      10.3390/math10132163

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Copula-Based Estimation Methods for a Common Mean Vector for Bivariate Meta-Analyses2022

    • 著者名/発表者名
      Shih Jia-Han、Konno Yoshihiko、Chang Yuan-Tsung、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Symmetry

      巻: 14 号: 2 ページ: 186-186

    • DOI

      10.3390/sym14020186

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Parametric Distributions for Survival and Reliability Analyses, a Review and Historical Sketch2022

    • 著者名/発表者名
      Taketomi Nanami、Yamamoto Kazuki、Chesneau Christophe、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Mathematics

      巻: 10 号: 20 ページ: 3907-3907

    • DOI

      10.3390/math10203907

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] meta.shrinkage: An R Package for Meta-Analyses for Simultaneously Estimating Individual Means2022

    • 著者名/発表者名
      Nanami Taketomi, Hirofumi Michimae, Yuan-Tsung Chang, Takeshi Emura
    • 雑誌名

      Algorithms

      巻: 15 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.3390/a15010026

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Flexible parametric copula modeling approaches for clustered survival data2022

    • 著者名/発表者名
      Kwon Sookhee、Ha Il Do、Shih Jia‐Han、Emura Takeshi
    • 雑誌名

      Pharmaceutical Statistics

      巻: 21 号: 1 ページ: 69-88

    • DOI

      10.1002/pst.2153

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] ヴァインコピュラで事前分布をモデリングしたベイズリッジ推定量2022

    • 著者名/発表者名
      道前洋史, 江村剛志
    • 雑誌名

      信学技報

      巻: 122 ページ: 37-42

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Bayesian ridge regression for survival data based on a vine copula based prior2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      CM Statistics 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Bayesian ridge regression for survival data based on a vine copula based prior2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      EcoSta 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A survival tree based on stabilized score tests for high-dimensional covariates2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      The Korean Statistical Society Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Survival Prognostic Prediction with Gene Selection-Copula methods-2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      Invited seminar talk, Chang Gung University
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Overview of copulas and Bayesian ridge estimator,2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      Invited seminar talk, MMSD, Osaka University
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Bayesian ridge estimator based on vine-copula priors2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      Invited seminar talk, Pukyong National University
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Overview of copulas and Bayesian ridge estimator2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      Invited talk at 中興大學統計所
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Factorial survival analysis for treatment effects under dependent censoring2023

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      Invited talk at 中興大學統計所
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Factorial survival analysis for treatment effects under dependent censoring2022

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Emura
    • 学会等名
      CMStatistics 2022, London, UK
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Conditional copula models for correlated survival endpoints in individual patient data meta-analysis2022

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Emura
    • 学会等名
      EcoSta2022, Japan
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生存時間の2標本問題 - コピュラに基づく従属打ち切り問題への対処 -2022

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      , 2022年度統計関連学会連合大会, 企画セッション「生存時間解析・イベントヒストリー分析」
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 正規分布の母平均のPretest推定量の累積分布関数とWald信頼区間2022

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      法政大・日本統計研究所研究集会~統計的モデリングとその周辺~
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生存時間に基づく要因実験計画法;コピュラに基づく従属打ち切り問題への対処ー2022

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      共同研究集会2022:接合関数(コピュラ)理論の新展開, 統計数理研究所
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヴァインコピュラで事前分布をモデリングしたベイズリッジ推定量2022

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      電子情報通信学会 信頼性研究会, 久留米大, 福岡サテライト
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 周辺モデル・Frailty・コピュラ2022

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      2022年度計量生物セミナー「生存時間解析」, 中央大学
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] セミ競合リスク・相関のあるエンドポイントへのアプローチ2022

    • 著者名/発表者名
      江村剛志
    • 学会等名
      2022年度計量生物セミナー「生存時間解析」, 中央大学
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会・シンポジウム開催] 医療健康データの生存時間解析(International Workshop: Survival Analysis for Medical and Health Data)2023

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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