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プログラム可能な水性二相系DNA液滴の単分散生成と集積化を行うマイクロ流路の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22K14528
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分27010:移動現象および単位操作関連
研究機関東京工業大学

研究代表者

鵜殿 寛岳  東京工業大学, 情報理工学院, JSPS特別研究員 (50895761)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードDNAナノテクノロジー / マイクロ流体 / 液液相分離 / 人工細胞 / マイクロ流体デバイス / DNA / マイクロ流路
研究開始時の研究の概要

DNAが相分離したDNA液滴は,塩基配列の設計により配列選択的な相互作用や分子認識能をプログラムできる.しかし,試験管内の自発的な生成に限定され,物性評価や高次構造体の構築ができていない.本研究では,高単分散な液滴の生成と操作を行うマイクロ流路を開発することで,集合的な機能と構造をプログラムできるDNA機能性流体を創出する.

研究実績の概要

研究代表者が2023年度に主に取り組んだことは、(1)昨年度末に査読誌から要修正として戻ってきた投稿論文(相状態の光制御が可能なDNA液滴)の修正対応および(2)演算を行うRNA液滴の研究である。(2)に関して、英文の化学・マイクロ工学系の査読誌に提出して要修正として戻ってきた。
(1)に関して査読者から要求されていた追加実験は、(A)光応答能を持つDNAの基本的な性質をより明確にするための対照実験、(B)相挙動を基礎づける熱力学的な議論に関して、定性的な議論にとどまらず定量的なデータの裏付けを与える基礎的な実験、(C)光応答DNAの挙動を用いた何らかのデモンストレーション(例えば、一方向に自走するシステム)である。このうち、(A)および(B)に関して、研究代表者は実験を完了して修正原稿に反映した。特に、マイクロ構造体の熱力学的な変数を実験的に推定することで、液滴の光誘発ダイナミクスの物理的な基礎付けを与えた点は初の試みである。(C)は、本研究の直接的な範囲ではないが、査読者が真剣に原稿を読み建設的な見解を述べていることをふまえて、この追加実験にトライした。当初案では、ガラス基板上にDNAパターンを作製して光応答するDNAとの相互作用を利用して一方向に移動させる手法を着想した。しかし、技術的なハードルおよび時間の制約から当初案は中途断念した。現在は、相分離して散在しているマイクロ構造物を遠心で集めて巨大化させることで、光応答能が非対称的に分布した構造体の作製に取り組んでいる。
(2)演算を行うRNA液滴については、先日アクセプトされた.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

査読対応で要求された追加実験が質・量ともにハードルが高い.

今後の研究の推進方策

査読者が要求していることがらを柔軟に解釈して,はやく再投稿する.

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] DNA Droplets: Intelligent, Dynamic Fluid2022

    • 著者名/発表者名
      Udono Hirotake、Gong Jing、Sato Yusuke、Takinoue Masahiro
    • 雑誌名

      Advanced Biology

      巻: 7 号: 3 ページ: 2200180-2200180

    • DOI

      10.1002/adbi.202200180

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] DNA condensate capable of photocontrollable rheological change creates multi-mode DNA microflow2023

    • 著者名/発表者名
      Hirotake Udono, Shin-ichiro. M. Nomura, Masahiro Takinoue
    • 学会等名
      DNA29
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] miRNAの入力に応じてAND演算を行うRNA液滴2023

    • 著者名/発表者名
      鵜殿寛岳、范敏之、齊藤洋子、大野博久、野村M.慎一郎、清水義宏、齊藤博英、瀧ノ上正浩
    • 学会等名
      CBI学会分子ロボット倫理研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Kissing-loop相互作用により構築されたRNA液滴によるAND論理演算2023

    • 著者名/発表者名
      鵜殿寛岳、范敏之、齊藤洋子、大野博久、野村M.慎一郎、清水義宏、齊藤博英、瀧ノ上正浩
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Remotely controllable DNA microflow2022

    • 著者名/発表者名
      H. Udono, S. M. Nomura, M. Takinoue
    • 学会等名
      The 26th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 光応答能を持つDNA液滴のマイクロ流れ2022

    • 著者名/発表者名
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • 学会等名
      第8回サイボウニクス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 光制御によるDNA液滴の『ゲル-液』相転移ダイナミクスで駆動するマイクロ流れ2022

    • 著者名/発表者名
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • 学会等名
      第6回分子ロボティクス年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 遠隔操作が可能なDNA流体のマイクロ流制御2022

    • 著者名/発表者名
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA流体の『ゲル-液』相転移ダイナミクスにより駆動されるマイクロ流れ遠隔操作2022

    • 著者名/発表者名
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • 学会等名
      生物物理学会サブグループ人工細胞&分子ロボティクス第3回研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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