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コレラ菌NADH-キノン酸化還元酵素のナトリウム輸送メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K14837
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分38040:生物有機化学関連
研究機関京都大学

研究代表者

桝谷 貴洋  京都大学, 農学研究科, 助教 (80803775)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード呼吸鎖酵素 / ユビキノン / コレラ菌 / ケミカルバイオロジー / Cryo-EM / 呼吸鎖 / NADH-キノン酸化還元酵素 / ナトリウム輸送
研究開始時の研究の概要

Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素(Na+-NQR)は、基質の酸化還元と共役してNa+の能動輸送を行う膜タンパク質複合体である。2014年にコレラ菌Na+-NQRのX線結晶構造が報告されたが、酸化還元を担うコファクター間の距離が異常に長く、分子レベルでの反応メカニズム、特に、基質の酸化還元とNa+輸送の共役メカニズムについてはほとんど未解明のままである。本研究では、生合理的にデザインした構造系統的な合成キノン類縁体を用いて、Na+輸送に要求される側鎖構造因子を明らかにするとともに、cryo-電子顕微鏡により得る構造情報と併せてキノン還元とNa+輸送の共役メカニズムの解明を目指す。

研究成果の概要

ナトリウムイオン輸送型NADH-キノン酸化還元酵素(NQR)は、基質の酸化還元と共役してナトリウムイオンの能動輸送を行う膜タンパク質複合体である。基質の酸化還元とナトリウムイオン輸送の共役メカニズムを調べるため、様々な側鎖構造を有するキノン類を合成し、活性を評価した。その結果、炭素鎖が3つよりも短い側鎖を有するキノン類では還元は観察されるにも関わらず、ナトリウムイオンが輸送されないことがわかった。この知見は、キノンの側鎖構造が輸送に決定的な役割を担っていることを意味するものであった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

NQRはコレラ菌(Vibrio cholerae)などの多くの病原性細菌の生育に必須であり、機能の類似した哺乳類ミトコンドリアのプロトン輸送型NADH-キノン酸化還元酵素(呼吸鎖複合体-I)とは構造的にも進化的にも異なるため、病原性細菌に対する有望な創薬標的として注目されている。そのため、NQRの作用機構を明らかにすることは、NQRの基礎研究の進展に貢献するだけでなく、新規抗菌剤分子の設計戦略に資するところも大きい。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 3件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (22件) (うち国際学会 1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Discovery of Bis-sulfonamides as Novel Inhibitors of Mitochondrial NADH-Quinone Oxidoreductase (Complex I)2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Atsuhito、Masuya Takahiro、Arichi Norihito、Inuki Shinsuke、Murai Masatoshi、Miyoshi Hideto、Ohno Hiroaki
    • 雑誌名

      ACS Medicinal Chemistry Letters

      巻: 14 号: 2 ページ: 211-216

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.2c00504

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cryo-EM structures of Na+-pumping NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae2022

    • 著者名/発表者名
      Kishikawa Jun-ichi、Ishikawa Moe、Masuya Takahiro、Murai Masatoshi、Kitazumi Yuki、Butler Nicole L.、Kato Takayuki、Barquera Blanca、Miyoshi Hideto
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 4082-4082

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31718-1

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Diverse reaction behaviors of artificial ubiquinones in mitochondrial respiratory complex I.2022

    • 著者名/発表者名
      Uno S, Masuya T, Zdorevskyi O, Ikunishi R, Shinzawa-Itoh K, Lasham J, Sharma V, Murai M, Miyoshi H.
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: 298 号: 7 ページ: 102075-102075

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102075

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The side chain of ubiquinone plays a critical role in Na+ translocation by the NADH-ubiquinone oxidoreductase (Na+-NQR) from Vibrio cholera2022

    • 著者名/発表者名
      Moe Ishikawa, Tkahiro Msuya, Seina Kuroda, Shinpei Uno, Nicole Butler, Sara Foreman, Masatoshi Murai, Blanca Barquera, and Hideto Miyoshi
    • 雑誌名

      Biochim. Biophy. Acta (Bioenergetics)

      巻: 未定 号: 5 ページ: 148547-148547

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2022.148547

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Comprehensive understanding of multiple actions of anticancer drug tamoxifen in isolated mitochondria2022

    • 著者名/発表者名
      Unten Yufu、Murai Masatoshi、Koshitaka Tomoki、Kitao Kotaro、Shirai Osamu、Masuya Takahiro、Miyoshi Hideto
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1863 号: 2 ページ: 148520-148520

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2021.148520

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ミトコンドリア膜透過性遷移を阻害するイソオキサゾール類の作用機構研究2024

    • 著者名/発表者名
      渡辺 大賀、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農薬学会第49回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-I に対するロテノンの作用機構2024

    • 著者名/発表者名
      桝谷貴洋、村井正俊、三芳秀人
    • 学会等名
      日本農薬学会第49回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の特異的化学修飾と動態観測2024

    • 著者名/発表者名
      宮地 咲野、田中 比奈子、石川 萌、Blanca Barquera、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 合成ユビキノンプローブを用いた出芽酵母のユビキノン取り込みに関与するタンパク質の探索2024

    • 著者名/発表者名
      水谷 みらい、黒田 聖奈、奥 公秀、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] リン脂質-キナゾリン・ハイブリッド阻害剤を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン反応ポケットの解析2024

    • 著者名/発表者名
      大谷 燎平、志村 優介、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送性NADH-キノン酸化還元酵素に対する阻害剤の作用機構の解明2024

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、岸川 淳一、桝谷 貴洋、村井 正俊、加藤 貴之、Barquera Blanca、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Cryo-EM Structures of the Na+-Pumping NADH-ubiquinone Oxidoreductase from Vibrio cholerae2023

    • 著者名/発表者名
      13.石川 萌、岸川 淳一、桝谷 貴洋、村井 正俊、北隅 優希、Nicole L. Butler、加藤 貴之、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      Gordon Research Conference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 人工キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットに関する研究2023

    • 著者名/発表者名
      桝谷 貴洋、生西 凌、大谷 燎平、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第49回討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送性NADH-キノン酸化還元酵素に関する阻害剤作用機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、岸川 淳一、桝谷 貴洋、村井 正俊、加藤 貴之、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第49回討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の動態観測2023

    • 著者名/発表者名
      宮地 咲野、田中 比奈子、石川 萌、桝谷 貴洋、村井 正俊、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      第37回農薬デザイン研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 人工キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン反応ポケットに関する研究2023

    • 著者名/発表者名
      大谷燎平、生西凌、桝谷貴洋、村井正俊、志波智生、三芳秀人
    • 学会等名
      第37回農薬デザイン研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iを阻害するアセトゲニンの結合部位の同定2023

    • 著者名/発表者名
      西田 美咲、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるコレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素の構造解明2023

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、岸川 淳一、桝谷 貴洋、村井 正俊、北隅 優希、Nicole L. Butler、加藤 貴之、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 人工キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットに関する研究2023

    • 著者名/発表者名
      生西 凌、大谷 燎平、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおける脱共役ユビキノン類の作用機構2023

    • 著者名/発表者名
      越高 知生、富澤 康平、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素におけるユビキノン側鎖の結合部位の同定2023

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、桝谷 貴洋、村井 正俊、Nicole L. Butler、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農薬学会第48回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-I を阻害するアセトゲニンの結合部位の同定2023

    • 著者名/発表者名
      西田 美咲、桝谷 貴洋、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本農薬学会第48回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 人工キノン類を用いたミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iのユビキノン反応部位の特性解明2022

    • 著者名/発表者名
      桝谷 貴洋、宇野 晋平、越高 知生、生西 凌、富澤 康平、大谷 燎平、奥田 健司、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素におけるユビキノン側鎖の結合部位の同定2022

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、桝谷 貴洋、村井 正俊、Nicole L. Butler、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送性NADH-キノン酸化還元酵素に対する阻害剤の作用機構2022

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、岸川 淳一、桝谷 貴洋、村井 正俊、北隅 優希、Nicole L. Butler、加藤 貴之、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      第37回農薬デザイン研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡を用いたコレラ菌 Na+輸送性 NADH-ユビキノン酸化還元酵素の構造解明2022

    • 著者名/発表者名
      石川 萌、岸川 淳一、桝谷 貴洋、村井 正俊、北隅 優希、Nicole L. Butler、加藤 貴之、Blanca Barquera、三芳 秀人
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の阻害剤コロルミシンの作用機序2022

    • 著者名/発表者名
      桝谷 貴洋、石川 萌、田中 比奈子、岸川 淳一、Blanca Barquera、北隅 優希、村井 正俊、三芳 秀人
    • 学会等名
      第64回天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 所属研究室ホームページ

    • URL

      http://www.biofunc-chem.kais.kyoto-u.ac.jp

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/t_masuya/?lang=japanese

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] Google Scholar

    • URL

      https://scholar.google.co.jp/citations?user=AyNAzrUAAAAJ&hl=ja

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2025-01-30  

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