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植物生体情報画像を用いた深層学習用教師データの自動生成技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22K14970
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分41040:農業環境工学および農業情報工学関連
研究機関豊橋技術科学大学

研究代表者

戸田 清太郎  豊橋技術科学大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (60893104)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2023年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード植物生体情報計測 / 自動アノテーション / クロロフィル蛍光画像計測 / ディープラーニング / 物体検出 / 茎伸長計測
研究開始時の研究の概要

深層学習における教師データの生成(アノテーション)は,一般的に人手で行われるがそのコストが膨大であることが解決すべき課題としてある。
他方,アノテーションする際,人間は検出対象物を形状や色に基づいて範囲選択する。植物が検出対象である場合も,その形状や色に基づいてアノテーションするが,それら以外にも植物特有または植物の器官毎に異なる生理現象を画像計測することで,検出対象物を植物生理に基づいて範囲選択できる可能性がある。
そこで,植物の生体情報画像計測を行い,形状や色以外にも植物の生理現象を用いてアノテーションを効率化,自動化する手法を開発する。

研究実績の概要

本研究では、深層学習における教師データの生成(アノテーション)にかかる時間的、労力的コストを解決すべく農学的知見を用いた解決方法を開発する。具体的には、植物生体情報画像を用いることで、アノテーションを効率化、自動化する手法を開発することを目的とする。
本研究の成果として、日単位茎伸長計測に活用可能な汎用的植物茎頂検出モデルを開発した。これは、列状に栽培されているトマト個体群を水平方向にスキャンして得られたクロロフィル蛍光動画に対し、植物体高さの分布を解析することで自動アノテーションを行うものである。自動アノテーションの結果得られた教師画像は215枚であり、その精度はPrecision 0.75、Recall 0.75、F-measure 0.75であった。得られた教師画像で訓練した茎頂検出モデルの精度はPrecision 0.97、Recall 0.96、F-measure 0.96であった。他方、手動でアノテーションした教師画像272枚を用いて訓練した茎頂検出モデルの精度はPrecision 1.00、Recall 0.99、F-measure 0.99であった。この結果により,開発した自動アノテーション手法によってトマト個体群の手動アノテーションを代替可能であることが示唆された。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Smartphone-based strawberry plant growth monitoring using YOLO2023

    • 著者名/発表者名
      S. Toda, T. Sakamoto, Y. Imai, R. Maruko, T. Kanoh, N. Fujiuchi, K. Takayama
    • 雑誌名

      Acta Horticalturae

      巻: -

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Practical use of Deep Learning-Based Daily Stem Elongation Measurement of Tomato Plants in Two Commercial Greenhouses2022

    • 著者名/発表者名
      S. Toda, T. Higuchi, T. Kanoh, T. Sakamoto, N.Fujiuchi, K. Takayama
    • 雑誌名

      IFAC-PapersOnLine

      巻: 55(32) 号: 32 ページ: 113-118

    • DOI

      10.1016/j.ifacol.2022.11.124

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Daily Measurement of Strawberry Flowers and Fruits by Using YOLO2022

    • 著者名/発表者名
      Seitaro Toda, Yuya Imai, Takeru Kanoh, Tetsutaka Sakamoto, Naomichi Fujiuchi, Kotaro Takayama
    • 雑誌名

      CIGR The XX CIGR World Congress 2022

      巻: -

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 生育状態の概要把握を目的としたトマト個体群パノラマ画像の要約手法の提案2022

    • 著者名/発表者名
      田内 楓, 戸田 清太郎, 加納 多佳留, 藤内 直道, 高山 弘太郎
    • 学会等名
      農業情報学会2022年度年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] イチゴ検出モデルの適用可能圃場・品種拡大のための効率的学習方法の検討2022

    • 著者名/発表者名
      戸田清太郎, 丸小凌我, 坂本哲隆, 藤内直道, 高山弘太郎
    • 学会等名
      農業情報学会2022年度年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] つり下げ型画像計測ロボットを用いたイチゴ個体群の日単位葉量計測2022

    • 著者名/発表者名
      今井裕也, 戸田清太郎, 坂本哲隆, 加納多佳留, 高山弘太郎
    • 学会等名
      農業情報学会2022年度年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] イメージセンシングによる農作物の生育状態把握2022

    • 著者名/発表者名
      戸田清太郎
    • 学会等名
      OPERAマルチモーダルセンシング共創コンソーシアム 2022年度全体会議
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Smartphone-based strawberry plant growth monitoring using YOLO2022

    • 著者名/発表者名
      S. Toda, T. Sakamoto, Y. Imai, R. Maruko, T. Kanoh, N. Fujiuchi, K. Takayama
    • 学会等名
      International Horticultural Congress (IHC) 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ディープラーニングを用いたイチゴ個体群の栄養-生殖成長の評価2022

    • 著者名/発表者名
      今井裕也, 戸田清太郎, 坂本哲隆, 加納多佳留, 高山弘太郎
    • 学会等名
      日本生物環境工学会2022年福岡大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] つり下げ型画像計測ロボットによる温室栽培キュウリの高精度生育評価2022

    • 著者名/発表者名
      戸田清太郎, 松岡宏樹, 坂本哲隆, 加納多佳留, 大場佳成, 秋月拓磨, 高山弘太郎
    • 学会等名
      日本生物環境工学会2022年福岡大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ディープラーニングを用いた観葉植物の形状評価2022

    • 著者名/発表者名
      戸田清太郎, 戸田多哉, 坂本哲隆, 加納多佳留, 大場佳成, 秋月拓磨, 高山弘太郎
    • 学会等名
      日本生物環境工学会2022年福岡大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ディープラーニングを活用したトマト個体群の栄養-生殖成長の評価2022

    • 著者名/発表者名
      戸田清太郎, 田内楓, 樋口達哉, 坂本哲隆, 加納多佳留, 藤内直道, 高山弘太郎
    • 学会等名
      日本生物環境工学会2022年福岡大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Practical use of Deep Learning-Based Daily Stem Elongation Measurement of Tomato Plants in Two Commercial Greenhouses2022

    • 著者名/発表者名
      S. Toda, T. Higuchi, T. Kanoh, T. Sakamoto, N. Fujiuchi, K. Takayama
    • 学会等名
      IFAC Agricontrol 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 植物生体情報に基づいた自動アノテーション手法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      古田友木, 戸田清太郎, 高山弘太郎
    • 学会等名
      2022 年度日本生物環境工学会東海・北信越支部合同支部大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] YOLOv5を用いた観葉植物の輪郭抽出2022

    • 著者名/発表者名
      戸田多哉, 戸田清太郎, 高山弘太郎
    • 学会等名
      2022 年度日本生物環境工学会東海・北信越支部合同支部大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Daily Measurement of Strawberry Flowers and Fruits by Using YOLO2022

    • 著者名/発表者名
      Seitaro Toda, Yuya Imai, Takeru Kanoh, Tetsutaka Sakamoto, Naomichi Fujiuchi, Kotaro Takayama
    • 学会等名
      CIGR The XX CIGR World Congress 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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