| 研究課題/領域番号 |
22K15085
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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| 研究機関 | 沖縄科学技術大学院大学 |
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研究代表者 |
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
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| キーワード | RNA editing / cephalopods / single-cell mRNA / neural organs / Cephalopod / Neural organs / Single-cell RNA / Cephalopods / Single-cell sequencing / thermal adaptability |
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| 研究開始時の研究の概要 |
Cephalopods are poikilotherms and need to regulate different neurophysiological processes at different temperatures. One proposed adaptive mechanism is the A-to-I messenger RNA editing. This project aims to understand how RNA-editing is regulated and the cell-specificity of this mechanism in coleoid cephalopods.
The results of this project will unravel how isoforms from different cell types with different RNA-editing levels influence the gene regulatory networks, enabling cephalopods adapt physiologically to the temperature variation.
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| 研究成果の概要 |
私はイカの視葉から高品質な単一細胞の分離およびソーティングのためのプロトコルを標準化することに成功しました。また、生後1日から7日のイカにおいて、サイズと粒度が異なる独自の細胞集団を特定しました。これらの高品質な細胞のmRNAをシーケンシングすることで、特にUTR領域において、Ty3hのようなドーパミン作動性遺伝子マーカーのアイソフォーム特異的編集が明らかになりました。さらに、RNA編集が細胞型特異性の明確なパターンなしにトランスポーザブルエレメントにおいて顕著に発生することを発見しました。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
We found that dopaminergic cell types, the most abundant in the optic lobe, exhibit differential RNA-editing patterns in gene markers, particularly in regulatory regions. We expect to fully characterize cephalopod-specific and evolutionarily conserved regulatory networks that underlie RNA editing.
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