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1細胞オミクスによる多様な植物異形細胞の機能解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K15136
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関横浜市立大学

研究代表者

山本 浩太郎  横浜市立大学, 理学部, 助教 (60888535)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワードアルカロイド / 異形細胞 / 一細胞メタボロミクス / 薬用植物 / チョウジソウ / アルカロイド細胞 / 一細胞オミクス / ニチニチソウ / 1細胞オミクス / 植物二次代謝 / メタボロミクス
研究開始時の研究の概要

植物が生産する二次代謝産物には、一次代謝産物とは異なり、一連の生合成過程が一つの細胞内で完結せず、複数の細胞を横断して行われるものがある。異形細胞と呼ばれる、他の細胞とは異なる形態をもつ細胞がその代謝の一翼を担っている可能性が示唆されているが、その役割・発生過程・類似性・二次代謝との関連性などは未だによくわかっていない。本研究では、1細胞生物学的手法を植物種ごとに適宜改良して、多様な植物における異形細胞とアルカロイド代謝の関係性を明らかにする。さらに代謝物による異形細胞の分類を行う。

研究実績の概要

植物は、昆虫や草食動物などの捕食者に対する防御物質として、カフェインやモルヒネのような二次代謝産物を生産している。これらの二次代謝産物の中には、薬、嗜好品、さらには染料やゴムなど、人に有用な物質が数多くある。植物の二次代謝には、一連の生合成が一つの細胞内で完結せず、複数の細胞を横断して行われるものがある。キョウチクトウ科ニチニチソウでは、異形細胞と呼ばれる他の細胞とは異なる形態である細胞が、細胞間を横断して行われる二次代謝の一翼を担っている可能性が示唆されているが、その役割・発生過程・類似性・二次代謝との関連性などは未だによくわかっていない。
本研究では、1細胞生物学実験手法を植物種ごとに改良して、多様な植物における異形細胞とアルカロイド代謝の関係性を明らかにしていく。さらに、代謝物による異形細胞の分類を行う。
日本原産薬用植物であるキョウチクトウ科チョウジソウの細胞を蛍光顕微鏡で観察していると、キョウチクトウ科ニチニチソウと似た蛍光性物質を蓄積する異形細胞が存在していることを発見した。本年度は、一細胞メタボロミクス手法を改良して、このチョウジソウの各細胞種や異形細胞に含まれるアルカロイドを明らかにしてきた。その結果、ニチニチソウと同様に、チョウジソウでもアルカロイドを異形細胞に蓄積していることが明らかになった。また、チョウジソウのトランスクリプトームデータを解析した結果、既知のアルカロイド生合成酵素遺伝子のオーソログなど二次代謝に関連のある遺伝子の候補が得られてきた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

興味深い異形細胞が観察できたキョウチクトウ科チョウジソウにおいては、組織レベルでのメタボロームデータやトランスクリプトームデータを取得して、アルカロイドの代謝経路図を推測してきた。チョウジソウなどの植物で二次代謝研究をはじめるために、分子生物学・生化学などの実験系の構築を行ってきた。本年度、一過的過剰発現の実験系を立ち上げ、チョウジソウのトランスクリプトームデータを元に、アルカロイド合成酵素をスクリーニングする実験をはじめたところであるため、酵素探索についての研究の進捗は当初の計画よりやや遅れている。

今後の研究の推進方策

現在、チョウジソウのトランスクリプトームデータより、ニチニチソウやインドジャボクにおいて過去に同定されているアルカロイド合成酵素遺伝子のオーソログを複数得てきている。今後これらの遺伝子に関して、異種発現系を用いて、代謝酵素の探索・機能解析を進め、代謝物の蓄積・反応の場となる分化した細胞種が、多様なアルカロイドを生合成するために、どのような役割を果たしているのかを解明する。また、チョウジソウのように興味深い異形細胞を見つけた植物では、一過的過剰発現やノックダウンの実験系の確立に取り組んでいき、植物体内での代謝機構について調べていく予定である。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Integration of cell differentiation and initiation of monoterpenoid indole alkaloid metabolism in seed germination of <i>Catharanthus roseus</i>2024

    • 著者名/発表者名
      Uzaki Mai、Mori Tetsuya、Sato Mayuko、Wakazaki Mayumi、Takeda‐Kamiya Noriko、Yamamoto Kotaro、Murakami Akio、Guerrero Delia Ayled Serna、Shichijo Chizuko、Ohnishi Miwa、Ishizaki Kimitsune、Fukaki Hidehiro、O'Connor Sarah E.、Toyooka Kiminori、Mimura Tetsuro、Hirai Masami Yokota
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 242 号: 3 ページ: 1156-1171

    • DOI

      10.1111/nph.19662

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-cell multi-omics in the medicinal plant Catharanthus roseus2023

    • 著者名/発表者名
      Li Chenxin、Wood Joshua C.、Vu Anh Hai、Hamilton John P.、Rodriguez Lopez Carlos Eduardo、Payne Richard M. E.、Serna Guerrero Delia Ayled、Gase Klaus、Yamamoto Kotaro、Vaillancourt Brieanne、Caputi Lorenzo、O’Connor Sarah E.、Robin Buell C.
    • 雑誌名

      Nature Chemical Biology

      巻: 19 号: 8 ページ: 1031-1041

    • DOI

      10.1038/s41589-023-01327-0

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Differential regulation of fluorescent alkaloid metabolism between idioblast and lacticifer cells during leaf development in Catharanthus roseus seedlings2022

    • 著者名/発表者名
      Uzaki Mai、Yamamoto Kotaro、Murakami Akio、Fuji Yushiro、Ohnishi Miwa、Ishizaki Kimitsune、Fukaki Hidehiro、Hirai Masami Yokota、Mimura Tetsuro
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: - 号: 3 ページ: 473-483

    • DOI

      10.1007/s10265-022-01380-1

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Imaging MS Analysis in Catharanthus roseus2022

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Kotaro、Takahashi Katsutoshi、O’Connor Sarah E.、Mimura Tetsuro
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2505 ページ: 33-43

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2349-7_2

    • ISBN
      9781071623480, 9781071623497
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In vivo characterization of key iridoid biosynthesis pathway genes in catnip (Nepeta cataria)2022

    • 著者名/発表者名
      Palmer Lira、Chuang Ling、Siegmund Marlen、Kunert Maritta、Yamamoto Kotaro、Sonawane Prashant、O’Connor Sarah E.
    • 雑誌名

      Planta

      巻: 256 号: 5 ページ: 99-99

    • DOI

      10.1007/s00425-022-04012-z

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 空間的代謝物イメージングによって見えてきた植物のアルカロイド代謝機構2024

    • 著者名/発表者名
      山本 浩太郎
    • 学会等名
      Trans-scale組織学ワークショップ
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] チョウジソウの葉組織におけるアルカロイド代謝物分布解析2024

    • 著者名/発表者名
      山本 浩太郎,森 哲哉,田中 節保,鵜崎 真妃,武田-神谷 紀子,豊岡 公徳,平井 優美
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ニチニチソウにおける細胞の代謝的分化を駆動する新規遺伝子の探索2024

    • 著者名/発表者名
      鵜崎 真妃,山本 浩太郎,三村 徹郎,平井 優美
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 日本原産薬用植物チョウジソウにおけるアルカロイド生合成研究とその研究基盤構築2023

    • 著者名/発表者名
      山本 浩太郎
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ニチニチソウ種子発芽過程における細胞種特異的なアルカロイド代謝の開始過程の解析2023

    • 著者名/発表者名
      鵜崎 真妃,森 哲哉,佐藤 繭子,若崎 眞由美,山本 浩太郎,村上 明男,豊岡 公徳,三村 徹郎,平井 優美
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ニチニチソウの発芽に伴う細胞種特異的なアルカロイド代謝開始過程の解析2023

    • 著者名/発表者名
      鵜崎真妃, 森哲哉, 佐藤繭子, 若崎真由美, 山本浩太郎、村上明男、豊岡公徳, 三村徹郎、平井優美
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 薬用植物ニチニチソウの種子発芽過程におけるアルカロイド代謝開始過程の解析2022

    • 著者名/発表者名
      鵜崎真妃, 山本浩太郎、森哲哉、村上明男、大西美輪、七條千津子、石崎公庸、深城英弘、三村徹郎、平井優美
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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