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異質倍数体種の成立に関わるゲノム安定性機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K15161
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分45010:遺伝学関連
研究機関新潟大学 (2023-2024)
横浜市立大学 (2022)

研究代表者

岡田 萌子  新潟大学, 自然科学系, 助教 (20913289)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードコムギ / 異質倍数性進化 / オミックス / 細胞遺伝学 / 雑種 / 倍数性進化 / 染色体 / 種分化 / トランスクリプトーム / 野生種
研究開始時の研究の概要

ゲノム分化と倍数性進化は、多くの動植物で一般的にみられる現象で、種分化と適応進化の原動力である。多くの倍数体植物では、倍数体化後に特定のゲノムにのみ変異が蓄積する。ムギ類のゲノムも、倍数体化後も安定な「軸ゲノム」と、変異しやすい「可変ゲノム」に分けられるが、ゲノム安定性を決める分子基盤は未解明である。さらに、軸ゲノム同士の組合せをもつ4倍体野生種は、自然界には存在しない。そこで本研究では、「ゲノム安定性の違いは異質倍数体種成立に影響するのか」という核心的「問い」を通じて、異質倍数性進化の分子基盤解明を目指す。

研究成果の概要

多くの倍数体植物では、倍数体化後に特定の親に由来する染色体にのみ変異が蓄積する。ムギ類野生種が持つゲノムも、倍数体化後も安定な「軸ゲノム」と、変異しやすい「可変ゲノム」に分けられるが、ゲノム安定性を決める分子基盤は未解明である。
本研究では、「ゲノム安定性の違いは倍数体種成立に影響するのか」という問いに答えるべく、屋内栽培系を確立した。また、種間交雑実験と継代的な染色体観察を行ったところ、「軸ゲノム」同士の交雑組み合わせでは雑種種子形成異常が確認された。現在、交雑後代の表現型の詳細な観察と、オミックス解析を進めている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

異質倍数性進化や雑種形成に関する研究は、遺伝学、進化学的だけでなく、野生遺伝資源を用いた育種の効率化にも重要である。交雑育種法が主流である日本のコムギ育種において、有用な野生種との交雑可否や、その障壁を解明することで、野生種を育種利用する際に必須な基本的知見を得られる。
コムギ近縁野生種を用いた本研究の結果から、「軸ゲノム」同士の交雑では雑種種子形成異常が起こることがわかった。つまり、「軸ゲノム」と「可変ゲノム」の違いは雑種成立可否を決める要因となる可能性が見出されたことは、コムギ遺伝学、進化学、育種学のどの観点からも大変重要であり、将来的には新品種育成や新技術開発に応用可能と期待される。

報告書

(4件)
  • 2024 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2025 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 8件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] 進化生態学研究所/University of Zurich(スイス)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Discrepancy of flowering time between genetically close sublineages of Aegilops umbellulata Zhuk.2024

    • 著者名/発表者名
      Son In、Kasazumi Nozomi、Okada Moeko、Takumi Shigeo、Yoshida Kentaro
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 14 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-024-57935-w

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Wheat: Recent Advances in Genomics to Explore the History of Domestication and Polyploidization2024

    • 著者名/発表者名
      Okada Moeko、Shimizu Kentaro K.
    • 雑誌名

      Phylogeographic History of Plants and Animals Coexisting with Humans in Asia

      巻: 1 ページ: 155-180

    • DOI

      10.1007/978-981-97-6887-5_10

    • ISBN
      9789819768868, 9789819768875
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Genome Assembly and Population Genomics in Aegilops umbellulata Zhuk.2025

    • 著者名/発表者名
      Moeko Okada, In Son, Nozomi Kasazumi, Shigeo Takumi, Kentaro K. Shimizu, Kentaro Yoshida
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome Conference 32
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Alteration of Homoeologous Gene Expression by Allopolyploidization: an Example of Cold Response2024

    • 著者名/発表者名
      Moeko Okada, Jianquiang Sun, Toshiaki Tameshige, Masaomi Hatakeyama, Rie Shimizu-Inatsugi, Shigeo Takumi†, Jun Sese, Kentaro K. Shimizu
    • 学会等名
      The 3rd International Wheat Congress
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effects of Allopolyploidization on Homoeologous Gene Expression under Cold Treatment in Synthetic Hexaploid Wheat.2024

    • 著者名/発表者名
      Moeko Okada, Jianquiang Sun, Toshiaki Tameshige, Masaomi Hatakeyama, Rie Shimizu-Inatsugi, Shigeo Takumi, Jun Sese, Kentaro K. Shimizu
    • 学会等名
      KAAB international symposium
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effects of allopolyploidization on homoeologous gene expression in synthetic hexaploids.2023

    • 著者名/発表者名
      Moeko Okada
    • 学会等名
      Polyploid evolutionary genomics: challenges and opportunities
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 異質倍数体化が相同遺伝子発現パターンに及ぼす影響2023

    • 著者名/発表者名
      岡田萌子, 孫建強、爲重才覚、畠山剛臣、清水(稲継)理恵、宅見薫雄、瀬々潤、清水健太郎
    • 学会等名
      第18回ムギ類研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] コムギ近縁野生種の育種利用に向けて2023

    • 著者名/発表者名
      岡田萌子
    • 学会等名
      第18回東北育種研究集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Effects of allopolyploidization on homoeologous gene expression changes and environmental response in hexaploid wheat.2023

    • 著者名/発表者名
      M. Okada, J. Sun, T. Tameshige, M. Hatakeyama, R. Shimizu-Inatsugi, S. Takumi, J. Sese, K. K. Shimizu.
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome Conference 30
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] RNA-seq-based bulked segregant analysis of the causal U- genome gene for hybrid incompatibility between tetraploid wheat and wild wheat relative Aegilops umbellulata.2022

    • 著者名/発表者名
      M. Okada, K. Yoshida, K.K. Shimizu, S. Takumi.
    • 学会等名
      The 26th International Conference on Sexual Plant Reproduction
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Allopolyploid Evolution in Wheat and its Relatives Revealed by De Novo Genome Assemblies.2022

    • 著者名/発表者名
      M. Okada, K. Yoshida, K.K. Shimizu.
    • 学会等名
      The 10th Annual Retreat of URPP Evolution in Action
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Homoeologous gene expression analysis of wheat cultivars and sunthetic hexaploid wheats as an example of cold response.2022

    • 著者名/発表者名
      M. Okada, J. Sun, T. Tameshige, M. Hatakeyama, R. Shimizu-Inatsugi, S. Takumi, J. Sese, K. K. Shimizu,
    • 学会等名
      PSC symposium
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2026-01-16  

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