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HIVに倣う新規タンパク質分解誘導剤の開発とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 22K15243
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分47010:薬系化学および創薬科学関連
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

辻 耕平  東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 准教授 (50866639)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードHIV / Polo-like kinase 1 / ペプチド / タンパク質分解誘導剤
研究開始時の研究の概要

HIV-1のアクセサリータンパク質であるVprを利用した新規標的タンパク質分解誘導剤の創製を本研究の目的とする。PROteolysis TArgeting Chimera (PROTAC) 法は標的タンパク質に対するリガンドとユビキチンリガーゼ (E3) に対するリガンドのコンジュゲートを用いることにより、標的タンパク質のユビキチン-プロテアソームシステム (UPS) による分解を促進する手法である。そこで本研究では、HIV-1のVprが宿主のUPSを利用して宿主防御因子を分解することに着目し、Vpr由来ペプチドをE3リガンドとした新規PROTAC分子の開発に挑戦する。

研究実績の概要

Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) のアクセサリータンパク質であるviral protein R (Vpr) を利用した新規標的タンパク質分解誘導剤の創製を行った。近年、新たな創薬モダリティの一つとして注目されているPROteolysis TArgeting Chimera (PROTAC) 法は標的タンパク質に対するリガンドとユビキチンリガーゼ (E3) に対するリガンドのコンジュゲートを用いることにより、標的タンパク質のユビキチン-プロテアソームシステム (UPS) による分解を促進する手法である。しかし、現在E3リガンドとしてPROTAC法に用いられるリガンドは限られており、PROTAC法に適用可能な新たなE3ユビキチンリガーゼ複合体およびそのE3リガンドの開発が望まれている。そこで本研究では、HIV-1のVprが宿主のUPSを利用して宿主防御因子を分解することに着目した。がん関連タンパク質であるPolo-like kinase 1 (Plk1) を標的タンパク質とし、Vpr由来ペプチドを新たなE3リガンドとした新規Plk1-PROTACの開発を行っている。本年度は前年度に引き続きPlk1リガンドおよびVpr由来ペプチドを用いたPlk1-PROTACの設計、合成を行った。前年度までに合成したペプチドにおいて溶解性に問題があった配列を検討し直し、新たに設計したPlk1-PROTACの合成を行った。さらに、コントロール化合物として既知のペプチド性E3リガンドであるVHL E3リガンドを用いたPlk1-PROTACの合成を行った。これら合成品のPlk1親和性、標的タンパク質分解誘導能、細胞毒性について活性評価を行い、その活性を確認した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度は前年度に引き続きPlk1リガンドおよびVpr由来ペプチドを用いたPlk1-PROTACの設計、合成を行った。さらに合成したペプチドのうち溶解性に問題があった配列を検討し直し、新たに設計したPlk1-PROTACの合成を行い、9種類の新規Plk1-PROTAC候補化合物を合成した。さらに、コントロール化合物として既知のペプチド性E3リガンドであるVHL E3リガンドを用いた6種類のPlk1-PROTAC候補化合物を合成した。これら合成品のPlk1親和性、標的タンパク質分解誘導能、細胞毒性について活性評価を行い、その活性を確認した。

今後の研究の推進方策

昨年度に引き続きPlk1-PROTAC候補化合物のPlk1親和性、標的タンパク質分解誘導能、細胞毒性について活性評価系の最適化を図る。確立した評価法を用いて昨年度および本年度に合成したPlk1-PROTAC候補化合物の活性評価を行う。得られた結果を基にリンカーの構造や長さ、コンジュゲート方法の変更など化合物の最適化を図る。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (14件) (うち国際共著 8件、 査読あり 14件、 オープンアクセス 11件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件、 招待講演 5件)

  • [国際共同研究] National Institutes of Health(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] National Institutes of Health(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Effect of Two-Photon Excitation to 8-Azacoumarin Derivatives as Photolabile Protecting Groups2024

    • 著者名/発表者名
      Kobayakawa Takuya、Takano Hikaru、Ishii Takahiro、Bolah Peter、Tsuji Kohei、Ohashi Nami、Nomura Wataru、Furuta Toshiaki、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 72 号: 3 ページ: 311-312

    • DOI

      10.1248/cpb.c24-00013

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2024-03-16
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of Small-Molecule Anti-HIV-1 Agents Targeting HIV-1 Capsid Proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Kobayakawa Takuya、Yokoyama Masaru、Tsuji Kohei、Boku Sayaka、Kurakami Masaki、Fujino Masayuki、Ishii Takahiro、Miura Yutaro、Nishimura Soshi、Shinohara Kouki、Yamamoto Kenichi、Bolah Peter、Kotani Osamu、Murakami Tsutomu、Sato Hironori、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 72 号: 1 ページ: 41-47

    • DOI

      10.1248/cpb.c23-00618

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2024-01-01
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Exploratory Studies of Effective Inhibitors against the SARS-CoV-2 Main Protease by Halogen Incorporation and Amide Bond Replacement2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Kohei、Kobayakawa Takuya、Ishii Takahiro、Higashi-Kuwata Nobuyo、Azuma Chika、Shinohara Kouki、Miura Yutaro、Yamamoto Kenichi、Nishimura Soshi、Hattori Shin-ichiro、Bulut Haydar、Mitsuya Hiroaki、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 71 号: 12 ページ: 879-886

    • DOI

      10.1248/cpb.c23-00562

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2023-12-01
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structure-Activity Relationship Studies of SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors Containing 4-Fluorobenzothiazole-2-carbonyl Moieties2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Kohei、Ishii Takahiro、Kobayakawa Takuya、Higashi-Kuwata Nobuyo、Shinohara Kouki、Azuma Chika、Miura Yutaro、Nakano Hiroki、Wada Naoya、Hattori Shin-ichiro、Bulut Haydar、Mitsuya Hiroaki、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 66 号: 19 ページ: 13516-13529

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.3c00777

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of anti-HBV agents targeting HBV capsid proteins2023

    • 著者名/発表者名
      Kobayakawa Takuya、Amano Masayuki、Nakayama Miyuki、Tsuji Kohei、Ishii Takahiro、Miura Yutaro、Shinohara Kouki、Yamamoto Kenichi、Matsuoka Masao、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      RSC Medicinal Chemistry

      巻: 14 号: 10 ページ: 1973-1980

    • DOI

      10.1039/d3md00258f

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Synthesis and evaluation of DAG-lactone derivatives with HIV-1 latency reversing activity2023

    • 著者名/発表者名
      Ishii Takahiro、Kobayakawa Takuya、Matsuda Kouki、Tsuji Kohei、Ohashi Nami、Nakahata Shingo、Noborio Airi、Yoshimura Kazuhisa、Mitsuya Hiroaki、Maeda Kenji、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      European Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 256 ページ: 115449-115449

    • DOI

      10.1016/j.ejmech.2023.115449

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of a Novel CD4 Mimetic Compound YIR-821 against HIV-1 Clinical Isolates2023

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Kaho、Kuwata Takeo、Tolbert William D.、Richard Jonathan、Ding Shilei、Prevost Jeremie、Takahama Shokichi、Judicate George P.、Ueno Takamasa、Nakata Hirotomo、Kobayakawa Takuya、Tsuji Kohei、Tamamura Hirokazu、Smith Amos B.、Pazgier Marzena、Finzi Andres、Matsushita Shuzo
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 97 号: 1

    • DOI

      10.1128/jvi.01638-22

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Sensitivity to a CD4 mimic of a consensus clone of monkey-adapted CCR5-tropic SHIV-MK38C2023

    • 著者名/発表者名
      Matsuura Kanako、Yamaura Mizuki、Sakawaki Hiromi、Himeno Ai、Pisil Yalcin、Kobayakawa Takuya、Tsuji Kohei、Tamamura Hirokazu、Matsushita Shuzo、Miura Tomoyuki
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 578 ページ: 171-179

    • DOI

      10.1016/j.virol.2022.12.004

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Low-molecular-weight Anti-HIV-1 Agents Targeting HIV-1 Capsid Proteins2023

    • 著者名/発表者名
      Kobayakawa, T., M. Yokoyama, K. Tsuji, M. Fujino, M. Kurakami, T. Onishi, S. Boku, T. Ishii, Y.Miura, K. Shimohara, Y. Kishihara, N. Ohashi, O. Kotani, T. Murakami, H. Sato and H. Tamamura
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 13 号: 3 ページ: 2156-2167

    • DOI

      10.1039/d2ra06837k

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of SARS-CoV-2 Mpro inhibitors containing P1’ 4-fluorobenzothiazole moiety highly active against SARS-CoV-22023

    • 著者名/発表者名
      Higashi-Kuwata Nobuyo、Tsuji Kohei、Hayashi Hironori、Bulut Haydar、Kiso Maki、Imai Masaki、Ogata-Aoki Hiromi、Ishii Takahiro、Kobayakawa Takuya、Nakano Kenta、et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 1076-1076

    • DOI

      10.1038/s41467-023-36729-0

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dimerized fusion inhibitor peptides targeting the HR1?HR2 interaction of SARS-CoV-22023

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Kohei、Baffour-Awuah Owusu Kofi、Miura Yutaro、Ishii Takahiro、Shinohara Kouki、Kobayakawa Takuya、Emi Akino、Nakano Takashi、Suzuki Youichi、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 13 号: 13 ページ: 8779-8793

    • DOI

      10.1039/d2ra07356k

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of ultra-high affinity bivalent ligands targeting the polo-like kinase 12022

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Kohei、Hymel David、Ma Buyong、Tamamura Hirokazu、Nussinov Ruth、Burke Terrence R.
    • 雑誌名

      RSC Chemical Biology

      巻: 3 号: 9 ページ: 1111-1120

    • DOI

      10.1039/d2cb00153e

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Potent and biostable inhibitors of the main protease of SARS-CoV-22022

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Kohei、Ishii Takahiro、Kobayakawa Takuya、Higashi-Kuwata Nobuyo、Azuma Chika、Nakayama Miyuki、Onishi Takato、Nakano Hiroki、Wada Naoya、Hori Miki、et al.
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 25 号: 11 ページ: 105365-105365

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105365

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hybrids of small CD4 mimics and gp41-related peptides as dual-target HIV entry inhibitors2022

    • 著者名/発表者名
      Wang Rongyi、Tsuji Kohei、Kobayakawa Takuya、Liu Yishan、Yoshimura Kazuhisa、Matsushita Shuzo、Harada Shigeyoshi、Tamamura Hirokazu
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 76 ページ: 117083-117083

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2022.117083

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 抗ウイルス薬の創薬研究 ~HIV研究から学ぶSARS-CoV-2阻害剤の創製~2023

    • 著者名/発表者名
      辻 耕平
    • 学会等名
      第55回若手ペプチド夏の勉強会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] UTILIZATION OF A NON-SPECIFIC KINASE INHIBITOR FOR THE DEVELOPMENT OF HIGH-AFFINITY BIVALENT POLO-LIKE KINASE 1 POLO-BOX DOMAIN INHIBITORS2023

    • 著者名/発表者名
      Kohei Tsuji, Hirokazu Tamamura, Terrence R. Burke, Jr.
    • 学会等名
      第60回ペプチド討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 大学における創薬研究 ~抗ウイルス薬の創製を目指して~2023

    • 著者名/発表者名
      辻 耕平
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] HIV-1研究を基盤としたSARS-CoV-2膜融合阻害ペプチドの創製2023

    • 著者名/発表者名
      辻 耕平
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploration of novel class anti-HIV-1 agents derived from a viral capsid protein2022

    • 著者名/発表者名
      K. Tsuji; R. Wang; K. B.-A. Owusu; T. Kobayakawa; T. Murakami; H. Tamamura
    • 学会等名
      The 12th International Peptide Symposium/The 36th European Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 二価結合型超高親和性Polo-like kinase 1阻害剤の創製2022

    • 著者名/発表者名
      辻 耕平、玉村啓和、Terrence R. Burke, Jr.
    • 学会等名
      第39回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DEVELOPMENT OF FUSION INHIBITOR PEPTIDES OF SARS-COV-2 LEARNED FROM ANTI-HIV-1 AGENTS2022

    • 著者名/発表者名
      Kohei Tsuji, Kofi Baffour-Awuah Owusu, Takuya Kobayakawa, Youichi Suzuki, Hirokazu Tamamura
    • 学会等名
      第59回ペプチド討論会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 抗ウイルス薬の創製研究と中圧分取装置2022

    • 著者名/発表者名
      辻 耕平
    • 学会等名
      日本ビュッヒ株式会社分取クロマトセミナー2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大学での創薬研究 ~抗ウイルス薬の創製を目指して~2022

    • 著者名/発表者名
      辻 耕平
    • 学会等名
      医療薬学フォーラム2022/第30回クリニカルファーマシーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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