研究課題/領域番号 |
22K15469
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研究種目 |
若手研究
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
小区分49060:ウイルス学関連
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研究機関 | 大阪大学 |
研究代表者 |
高田 光輔 大阪大学, 微生物病研究所, 特任助教(常勤) (40881701)
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研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2022年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
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キーワード | RNAウイルス / ゲノム進化 / SARS-CoV-2 / 動物モデル / ゲノム多様性 |
研究開始時の研究の概要 |
RNAウイルスの一種であるコロナウイルスは、遺伝子校正機能を担う酵素を備えているため、他のRNAウイルスと比較してゲノム変異を起こしにくい。しかし、SARS-CoV-2は、これまで多様なゲノム変異が確認され、ゲノム進化やゲノム多様化機構について不明な点が多い。本研究では、SARS-CoV-2のゲノム多様化機構の一端を明らかにする。公共データベースのゲノム配列を解析し、ゲノム変異を起こし易い性質に関わるアミノ酸置換を同定し、そのアミノ酸置換による影響を培養細胞と動物モデルで調べる。さらに、ゲノム変異を起こし易いウイルス株の存在意義を提唱するため、抗原変異株の出現や低感受性動物への適応を検証する。
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研究成果の概要 |
コロナウイルスは、校正機能を担う酵素(nsp14)を備えているため、RNAウイルスの中ではゲノム突然変異が起こりにくい。しかし、SARS-CoV-2は短期間の間に、多様な変異株が出現している。本研究では、SARS-CoV-2のゲノム多様化機構を明らかにし、"ゲノム多様性を増加しやすいウイルス株"が出現する意味を提案することを目的とした。データ解析とウイルス実験より、nsp14における幾つかのアミノ酸置換がSARS-CoV-2のゲノム多様性を増加し、ウイルス進化に寄与していることが示唆された。一方、"ゲノム多様性を増加しやすいウイルス株"が出現する意味については、追加検証の必要性が示唆された。
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究によって、"ゲノム多様性を増加しやすいウイルス株"は、パンデミック中に幾度と出現していたが、同ウイルス種集団内では少数派ウイルス株として存在していることが明らかとなった。これまでのウイルス学では、ウイルスが感染拡大する上で有利な性質を獲得し、同ウイルス種集団内で多数派となったウイルス株が着目されてきた。そこで本研究で着目した、集団サイズが小さいながらも”ゲノム多様性を増加しやすいウイルス株”が、幾度と出現する生物学的意義(例えば、抗原変異株の出現に寄与しているなど)が示されれば、RNAウイルスの制御に新たな視点をもたらすと期待されたが、その点ついては未解決であり、今後の研究に期待される。
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