研究課題
若手研究
C型肝炎ウイルス(HCV)はウイルスゲノムに遺伝子変異が蓄積することが薬剤耐性変異や治癒後の肝発癌の原因と考えられる。しかしながら、遺伝子変異蓄積の多様性にアプローチした研究はあまりなされていない。研究者らは、 HCVの細胞内複製モデルを9年に渡り継代培養し、HCVゲノムは多様性を保ったまま時間依存的に且つ直線的に変異が蓄積増大していくことを最近明らかにした。本研究では、貴重な同モデルを用いて継代0-12年目の各HCVゲノムの変異蓄積を解析することで長期的な変異動態の詳細を明らかにする。さらにそのデータを数理モデル化し、新型コロナウイルスな どを含めたRNAウイルス進化モデルへの応用を目指す。
C型肝炎ウイルス(HCV)は、肝臓内での長期的なウイルスの感染・増殖によってウイルスゲノムに遺伝子変異が蓄積することが薬剤耐性変異や治癒後の肝発癌の原因と考えられる。しかしながら、HCV持続感染系の長期的な維持は難しく、構造領域の欠損などが頻繁に起こってしまうため遺伝子変異蓄積の多様性にアプローチした研究はあまりなされていない。本研究では、HCVの細胞内複製モデルを13年に渡り継代培養し、HCVゲノムを第3世代ロングリードシークエンサで長期的な変異動態の詳細を明らかにしただけでなく、そのデータを数理モデル化した。
本研究で用いたHCVレプリコン細胞株は申請者が所属する研究室において2002年と2003年に樹立したオリジナルの実験システムであり、HCVゲノムの進化ばかりでなく細胞がん化の要因を探る研究にも役立つと考え、HCVレプリコン細胞樹立時から継代を続けており、世界的にみてもHCVだけでなく他のウイルスでもこのような長期継代培養は皆無であり、今後もこのようなモデルの作成は極めて困難で、非常に貴重なモデルから得られた成果である。そして、この結果はHCVだけでな く他の新規ウイルスに対しても活用が大いに期待できる。
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すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 備考 (3件)
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