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腸内環境に基づいて抗悪性腫瘍剤の治療反応性を層別化する基盤的研究

研究課題

研究課題/領域番号 22K16336
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分54010:血液および腫瘍内科学関連
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

柴 知史  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 特任研究員 (00797003)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2025年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2024年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードがん / 化学療法 / 腸内細菌叢 / 抗がん剤 / 抗悪性腫瘍剤 / 腸内環境 / 腸内細菌 / 個別化医療 / 免疫チェックポイント阻害剤
研究開始時の研究の概要

従来の抗がん剤や免疫チェックポイント阻害剤による全身化学療法を行うがん患者を対象とし、全身化学療法の治療効果及び副作用発現の層別化を目指す。全身化学療法を行うがん患者の腸内環境をプロファイリングし、当該患者に対する治療効果及び副作用の発現状況等を臨床データとして収集する。収集された腸内環境と臨床情報をもとに、治療効果が最大となり、副作用発現が最小となる腸内環境を見出し、全身化学療法を行う患者を層別化する。本研究を基盤として、治療反応性が良好となる腸内環境を誘導する食事、生活習慣等を同定し、将来的に臨床応用へ発展させることが目標である。

研究実績の概要

本研究に関わるサンプル採取等は概ね終了し、サンプルからのDNA抽出を行い、そのDNAを用いてシークエンスを実施した。
必要な臨床情報の抽出を進めており、解析したシークエンス結果と臨床情報を統合し、臨床的意義のある結果解釈を進めているところであり、進捗は概ね順調である。
引き続き解析したデータと臨床情報を突合させ、意義のある結果を見出し、本研究の成果を纏めていく予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

必要なサンプル収集は概ね終了しており、サンプルからのDNA抽出、DNAからシークエンスを行う過程も順調に進んでいる。
データ結果の解釈、臨床情報であるメタデータとの統合について、纏めの段階に入っている。

今後の研究の推進方策

必要なデータは概ね揃ってきたため、今後は臨床情報とシークエンス結果との統合を行い、統合データを解釈し、臨床的な意義のある結果を纏める。データを纏める過程の中で、適宜追加研究や修正等を行い、本研究を纏める作業を進めていく予定である。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Intestinal Bacteria Fluctuating in Early-Stage Colorectal Cancer Carcinogenesis are Associated with Diet in Healthy Adults2024

    • 著者名/発表者名
      Narii Nobuhiro、Zha Ling、Sobue Tomotaka、Kitamura Tetsuhisa、Komatsu Masayo、Shimomura Yoshimitsu、Shiba Satoshi、Mizutani Sayaka、Yamada Takuji、Yachida Shinichi
    • 雑誌名

      Nutrition and Cancer

      巻: 未定 号: 6 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1080/01635581.2024.2344257

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification2023

    • 著者名/発表者名
      Rynazal Ryza、Fujisawa Kota、Shiroma Hirotsugu、Salim Felix、Mizutani Sayaka、Shiba Satoshi、Yachida Shinichi、Yamada Takuji
    • 雑誌名

      Genome Biology

      巻: 24 号: 1

    • DOI

      10.1186/s13059-023-02858-4

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Efficient and accurate KRAS genotyping using digital PCR combined with melting curve analysis for ctDNA from pancreatic cancer patients2023

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Junko、Nakagawa Tatsuo、Harada Kunio、Morizane Chigusa、Tanaka Hidenori、Shiba Satoshi、Ohba Akihiro、Hijioka Susumu、Takai Erina、Yachida Shinichi、Kamura Yoshio、Ishida Takeshi、Yokoi Takahide、Uematsu Chihiro
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-023-30131-y

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Association Between Diet and <i>Fusobacterium nucleatum</i> in the Feces of Healthy Adults: A Hospital-based Cross-sectional Study2022

    • 著者名/発表者名
      Narii Nobuhiro、Zha Ling、Sobue Tomotaka、Kitamura Tetsuhisa、Shiba Satoshi、Mizutani Sayaka、Yamada Takuji、Yachida Shinichi
    • 雑誌名

      Cancer Prevention Research

      巻: 16 号: 2 ページ: 119-126

    • DOI

      10.1158/1940-6207.capr-22-0399

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mediation effect of intestinal microbiota on the relationship between fiber intake and colorectal cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Shimomura Yoshimitsu、Zha Ling、Komukai Sho、Narii Nobuhiro、Sobue Tomotaka、Kitamura Tetsuhisa、Shiba Satoshi、Mizutani Sayaka、Yamada Takuji、Sawada Norie、Yachida Shinichi
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer

      巻: 152 号: 9 ページ: 1752-1762

    • DOI

      10.1002/ijc.34398

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Surgical Treatment for Colorectal Cancer Partially Restores Gut Microbiome and Metabolome Traits.2022

    • 著者名/発表者名
      Shiroma H, Shiba S, Erawijantari PP, Takamaru H, Yamada M, Sakamoto T, Kanemitsu Y, Mizutani S, Soga T, Saito Y, Shibata T, Fukuda S, Yachida S, Yamada T.
    • 雑誌名

      mSystems

      巻: 7 号: 2

    • DOI

      10.1128/msystems.00018-22

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 便マルチオミクス解析を用いた大腸多段階発癌に関連する腸内微生物・微小環境の大腸癌術後における変化2022

    • 著者名/発表者名
      高丸博之、柴知史、齋藤豊
    • 学会等名
      JDDW2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] 胆と膵2023

    • 著者名/発表者名
      糸井隆夫
    • 総ページ数
      111
    • 出版者
      医学図書出版
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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