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オルガネラの力計測と操作を実現する新規技術の開発と初期胚核における力の意義の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K18362
研究種目

挑戦的研究(開拓)

配分区分基金
審査区分 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

島本 勇太  国立遺伝学研究所, 遺伝メカニズム研究系, 准教授 (80409656)

研究分担者 岩城 光宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 客員研究員 (30432503)
宮本 圭  近畿大学, 生物理工学部, 准教授 (40740684)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2022年度)
配分額 *注記
26,000千円 (直接経費: 20,000千円、間接経費: 6,000千円)
2025年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2024年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2022年度: 9,750千円 (直接経費: 7,500千円、間接経費: 2,250千円)
キーワードオルガネラ物性 / 核 / クロマチン動態 / 細胞骨格 / 初期胚発生 / オルガネラ / マテリアル特性 / 細胞内力センサ / 細胞内力アクチュエータ
研究開始時の研究の概要

本研究では、細胞機能の維持調節に必須のオルガネラが持つ硬さ、変形、可塑性などの物理特性に着目し、それらを細胞内で自在に計測・操作するための技術的革新を目指す。遺伝子コードしたウイルス様粒子やDNAオリガミ等の最先端技術を利用してナノサイズの歪みセンサー・アクチュエーターを作製し、細胞内に形成する核等の標的オルガネラの力学特性とその変動、ストレス応答や遺伝子発現動態との関連をこれまでにない時空間精度で解析する。オルガネラの動態と機能をマテリアル的観点から理解することで、細胞が内包する未知のメカニズム解明と関連疾病に対する新たな治療・診断方策の提案を目指す。

研究実績の概要

核などの細胞内構造と周囲の細胞質が持つ物性と力場を高精度で計測・操作可能な技術の開発とそれに基づく新たな生物メカニズムの発見を目標に、当該年度では特に以下の研究項目に重点を置いて研究を行った。
1)オルガネラ動態の可視検出技術の開発:研究は当初の予定に従って初期胚の核を対象に行った。胚の生化学操作と生細胞観察が可能な顕微鏡システムを構築し、核膜の変形、核膜構造の組成変化、内部クロマチン動態等を構成因子への蛍光標識や不活性型Cas9を使って高い時空間精度で数値化できる手法を確立した。またナノサイズの蛍光性粒子を胚に導入し、細胞質の物性と発生ステージ依存性の定量決定を達成した。
2)オルガネラ物性計測・操作技術の開発:核の物性を生細胞内で計測可能なキャピラリー型探針にもとづく技術を2種類開発した。それぞれの方法が相補的に機能して核の局所物性と大局的な物性を定量可能なことを確認し、力のパラメータ依存的に変化する核のレオロジー特性の取得を予定通り達成した。また開発した手法が非侵襲であることを胚の発生率を指標に実証した。さらに核の物性操作について、核内で重合する骨格構造の動態制御経路に介入可能な手法を確立し、発生の特定の時期における核の硬さと可塑性の操作を予定に先だって実現した。
3)初期胚の核物性と生理機能の関係性の解析:開発した上記技術を使って、初期胚における核の物性、核膜組成、核内クロマチン動態、発生能等を網羅的に解析した。その結果、核の構造・物性変化を起点とした新規の発生プログラムを同定した。この成果をプレプリント論文としてまとめ、発表を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

次年度までの目標であった生細胞内における核オルガネラの物性解析技術を確立し、その非侵襲性についても実証することができたため。また開発した技術を使って胚発生における核物性の未報告の動態を予想外に発見し、その制御機構の一端を同定することができたため。

今後の研究の推進方策

次年度以降は、1)核動態の可視化技術の開発、2)核物性の計測・操作技術の開発、3)胚発生における核物性と核構造の生理機能の探索、のそれぞれについて研究を継続する。1)については、当該年度に確立した手法に加えて、特定の遺伝子座の核内座標と時間的な変動の可視化追跡技術の開発など、さらに高精度で核内ゲノムの動態解析を行えるよう精錬を行う。また内在性核因子の蛍光標識法についても引き続き改良を進める。2)の物性計測と操作の技術開発については、蛍光粒子を使って細胞質で確立した計測手法のオルガネラへの応用と、核骨格の操作をさらに高い時空間精度で行うことを可能とする方法論の探索を行う。3)のオルガネラ物性が持つ生理機能については、発生過程への影響、クロマチンと核骨格の相互作用への影響、転写活性との関係等に解析対象を広げ、より詳細で包括的な分子機序の同定を進める。

報告書

(2件)
  • 2022 審査結果の所見   実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 6件、 招待講演 4件)

  • [国際共同研究] Academia Sinica(台湾)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Hong Kong(中国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Transition to the structurally vulnerable nuclear state is an integral part of mouse embryonic development2023

    • 著者名/発表者名
      Masahito Tanaka、Sakanoue Rin、Takasu Atsushi、Watanabe Naoko、Shimamoto Yuta、Miyamoto Kei
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: 2023.02.20.529332

    • DOI

      10.1101/2023.02.20.529332

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Morphological growth dynamics, mechanical stability, and active microtubule mechanics underlying spindle self-organization2022

    • 著者名/発表者名
      Fukuyama Tatsuya、Yan Lucan、Tanaka Masahito、Yamaoka Megumi、Saito Kei、Ti Shih-Chieh、Liao Chung-Chi、Hsia Kuo-Chiang、Maeda Yusuke T.、Shimamoto Yuta
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 44

    • DOI

      10.1073/pnas.2209053119

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Mechanical dynamics of the nucleus in early mouse embryos2023

    • 著者名/発表者名
      Yuta Shimamoto
    • 学会等名
      日本生理学会第100回記念大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Morphological growth dynamics, active microtubule mechanics, and mechanical plasticity of the vertebrate meiotic spindle2022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Shimamoto
    • 学会等名
      ASCB/EMBO 2022 Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dissecting the nuclear shape and mechanical dynamics in mouse preimplantation embryos2022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Shimamoto
    • 学会等名
      日本分子生物学会第45回年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 紡錘体の力学的可塑性と多極構造化2022

    • 著者名/発表者名
      島本勇太
    • 学会等名
      日本分子生物学会第45回年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Morphological growth dynamics and active microtubule mechanics underlying spindle self-organization2022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Shimamoto
    • 学会等名
      日本生物物理学会第60回年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 紡錘体の可塑性と多極構造化2022

    • 著者名/発表者名
      島本勇太
    • 学会等名
      細胞分裂研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Measuring and perturbing the mechanical properties of the cell nucleus2022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Shimamoto
    • 学会等名
      The 9th World Congress of Biomechanics
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2022-07-05   更新日: 2023-12-25  

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