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生体膜で創るロタキサン型タンパク質超分子構造と機能発現

研究課題

研究課題/領域番号 22K19060
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分35:高分子、有機材料およびその関連分野
研究機関名古屋工業大学

研究代表者

出羽 毅久  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70335082)

研究分担者 近藤 政晴  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (20571219)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2024年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2023年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2022年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード光合成 / 超分子構造 / タンパク質 / 光収穫系複合体 / 超分子 / タンパク質集合体 / ロタキサン
研究開始時の研究の概要

本研究では、「リング状」の膜タンパク質である光合成の光収穫系複合体(LH2)の内部に「軸」となるダンベル型タンパク質を挿入したロタキサン状の非天然型タンパク質超分子構造を細胞膜中で人工的に創ることを目的とする。LH2は光合成膜中でリング構造の形成過程で、リング中心部に軸となるダンベル型タンパク質を挿入することで非天然型ロタキサン構造を形成させる。単離精製後、クライオ電顕により構造観察を行う。本研究は、天然の組み立て機構を利用した非天然型のタンパク質超分子構造形成の最初の例となり、刺激応答性タンパク質超分子・分子マシンの創製の先駆けとなる。

研究実績の概要

ロタキサン構造をもつ膜タンパク質複合体を作成するために、紅色光合成細菌の光収穫系複合体2(LH2)をリング部位とし、そのリング内部に挿入する軸タンパ ク質を各種設計した。膜貫通部分は膜貫通型αヘリックス構造とし、ストッパーとなる親水性部位はマルトース結合タンパク(MBP)および蛍光タンパク質 (mCherry)とした。前年度の問題点として、発現した軸タンパク質の膜への挿入効率が低いことが明らかとなり、本年度は次の4つについて検討した。
(1) 軸のαヘリックスの変更:ペリプラズム側にN末端となるようにし、膜への挿入方向とタンパク質発現方向が同じにあるようにした。その結果、これまで逆方向であった軸部に比べ、光合成膜中への挿入量が増加した。
(2) 遺伝子配列の変更:これまでLH2βー軸ーLH2αの遺伝子(pucB-Axis-pucA)の順で遺伝子を作成していたが、軸の発現量を増やすために、Axis-pucB-pucAの配列に変更した。その結果、発現量に優位な変化は見られなかった。
(3) N末端配列の重要性の確認:軸タンパク質のN末端領域にpucBの配列を一部組み込んだものと、その配列が無いものについて検討した。その結果、pucBの配列を一部組み込んもののみ発現が確認できた事から、軸タンパク質のN末端領域にはLH2βのN末端アミノ酸数個が光合成細菌内での発現に重要である事がわかった。
(4) タンパク質間相互作用の導入:膜に挿入れた軸分子をLH2タンパク質が認識し相互作用する仕掛けを導入し、超分子構造形成を促す設計を行なった。ここではSpy-tag/SpyCatcherシステムを用い、軸タンパク質部分にSpyCatcher, LH2β部位にSpy-tagを導入した遺伝子の作成を行なっいる。(現在進行中)

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

目的の超分子複合体の安定性が低く、単離精製時に分解してしまう事がわかった。このため、より安定な構造となる設計を導入し、遺伝子作成および光合成細菌内での発現を試みている。

今後の研究の推進方策

より安定な複合体をより収率よく光合成膜中で形成させるために、現在進めているSpy-tag/SpyCatcherシステムで研究を推進する。これまでに超分子複合体形成による吸収波長シフトや、単離生成のノウハウが蓄積できているので、より大量に安定な超分子複合体を単離精製する。単離精製できれば、クライオ電子顕微鏡での構造解析に着手し、超分子構造の明確な証拠を得る。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (21件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Delivery of external proteins into the cytoplasm using protein capsules modified with IgG on the surface, created from the amphiphilic two helix-bundle protein OLE-ZIP2024

    • 著者名/発表者名
      Kousuke Takahashi, Taiki Nishiyama, Naoki Umezawa, Yasumichi Inoue, Isamu Akiba, Takehisa Dewa, Atsushi Ikeda, Toshihisa Mizuno
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 60 号: 8 ページ: 968-971

    • DOI

      10.1039/d3cc05347d

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional Coupling of Biohybrid Photosynthetic Antennae and Reaction Center Complexes: Quantitative Comparison with Native Antennae2023

    • 著者名/発表者名
      Takehisa Dewa, Komei Kimoto, Genki Kasagi, Hiromi Harada, Ayumi Sumino, and Masaharu Kondo
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 127 号: 48 ページ: 10315-10325

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c04922

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Atomic force microscopic analysis of the light-harvesting complex 2 from purple photosynthetic bacterium Thermochromatium tepidum2023

    • 著者名/発表者名
      Morimoto Masayuki、Hirao Haruna、Kondo Masaharu、Dewa Takehisa、Kimura Yukihiro、Wang-Otomo Zheng-Yu、Asakawa Hitoshi、Saga Yoshitaka
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: - 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1007/s11120-023-01010-4

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cryogenic single-molecule fluorescence detection of mid-infrared response of an intrinsic pigment in light-harvesting complex2023

    • 著者名/発表者名
      Kohei Otomo, Takehisa Dewa, Michio Matsushita, and Satoru Fujiyoshi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B.

      巻: 127 号: 22 ページ: 4959-4965

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c00284

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Functional Coupling of Biohybrid Photosynthetic Antennae and Reaction Center Complexes: Quantitative Comparison with Native Antennae2023

    • 著者名/発表者名
      Takehisa Dewa
    • 学会等名
      16th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 光合成膜タンパク質集合体により駆動する光エネルギー変換人工オルガネラ2023

    • 著者名/発表者名
      出羽毅久
    • 学会等名
      2023年度 超越分子システム 高野山会議
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] B800またはB850近傍に人工色素を導入したバイオハイブリッドLH2の示すエネルギー移動ダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      石川 宙・邨井 孝行・松中 由有・山本 哲也・平川 正斗・米田 勇祐・近藤 政晴・出羽 毅久・小島 理沙・長澤 裕
    • 学会等名
      第23回 日本光生物学協会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] バイオハイブリッド光収穫系複合体による波長領域の拡張・超高速エネルギー移動・光電変換2023

    • 著者名/発表者名
      出羽毅久・平川正斗・森川凌雅・鬼頭征也・石川宙・山本哲也・米田勇祐・近藤政晴・長澤裕
    • 学会等名
      第72回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛍光色素を結合した光収穫系複合体LH2変異体での超高速エネルギー移動2023

    • 著者名/発表者名
      平川正斗、森下凌雅、鬼頭征也、石川宙、山本哲也、米田勇佑、近藤政晴、長澤裕、出羽毅久
    • 学会等名
      第72回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 光重合性脂質 (Diyne-PC) により形成される光収穫相から光収穫系複合体(LH2)へのエネルギー移動2023

    • 著者名/発表者名
      長谷川 馨、近藤 政晴、森垣 憲一、出羽 毅久
    • 学会等名
      第72回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 半導体光触媒の水分解反応と共役する光収穫系1-反応中心複合体(LH1-RC)の光触媒反応2023

    • 著者名/発表者名
      各務 朱音、小久保 燎、近藤 政晴、鈴木 肇、阿部 竜、出羽 毅久
    • 学会等名
      第72回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 光合成膜中で発現させた非天然型タンパク質による超分子複合体形成2023

    • 著者名/発表者名
      秦潤奈、鈴木康史、和田拓也、近藤政晴、出羽毅久
    • 学会等名
      第72回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Energy transfer dynamics of biohybrid LH2: Introduction of artificial dye in the vicinity of B8002023

    • 著者名/発表者名
      Sora Ishikawa・Takayuki Murai・Yu Matsunaka・Tetsuya Yamamoto・Masato Hirakawa・Yusuke Yoneda・Masaharu Kondo・Takehisa Dewa・Risa Kojima・Yutaka Nagasawa
    • 学会等名
      2023年光化学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 脂質に結合した蛍光色素を利用した光捕集系膜タンパク質LHCIIの機能拡張2023

    • 著者名/発表者名
      近藤政晴・桑原隼人・Ashley Hancock・Peter Adams・出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 半導体光触媒と光収穫系1-反応中心複合体(LH1-RC)の電子移動反応2023

    • 著者名/発表者名
      各務朱音・小久保燎・近藤政晴・鈴木 肇・阿部 竜・出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 紅色光合成細菌の膜中での人工膜タンパク質発現2023

    • 著者名/発表者名
      藤田悠作、秦 潤奈、鈴木康史、平野佳穂、近藤政晴、出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 光合成膜中で発現させた非天然型タンパク質による超分子複合体形成2023

    • 著者名/発表者名
      秦潤奈、鈴木康史、和田拓也、近藤政晴、出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] B820/B850混在LH2の作製を目的としたRhodobacter sphaeroides 2.4.1変異体の調製2023

    • 著者名/発表者名
      浅野賢吾・三浦彩音・近藤政晴・出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 重合性脂質Diyne-PCからなるリポソームの光重合と光収穫相としての分光学的特性2023

    • 著者名/発表者名
      長谷川 馨・近藤政晴・森垣憲一・出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛍光色素を結合した光収穫系複合体LH2変異体による超高速エネルギー移動制御2023

    • 著者名/発表者名
      平川正斗・鬼頭征也・石川 宙・山本哲也・米田勇佑・近藤政晴・長澤 裕・出羽毅久
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 近赤外蛍光タンパク質と光捕集タンパク質の融合による光合成機能拡張2023

    • 著者名/発表者名
      松本空大、出羽毅久、近藤政晴
    • 学会等名
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛍光色素により光収穫能を増強したバイオハイブリッドLH2とその後2023

    • 著者名/発表者名
      出羽毅久
    • 学会等名
      JSTさきがけ「光エネルギーと物質変換」第18回領域会議
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 光合成膜中で発現させた非天然型タンパク質による超分子複合体形成2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木康史、秦 潤奈、和田拓也、近藤政晴、出羽毅久
    • 学会等名
      第29回 光合成セミナー2022:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 光合成細菌中でのダンベル型人工膜タンパク質の発現2022

    • 著者名/発表者名
      秦 潤奈、鈴木康史、和田拓也、近藤政晴、出羽毅久
    • 学会等名
      第29回 光合成セミナー2022:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 紅色光合成細菌内での人工膜タンパク質発現のための遺伝子設計2022

    • 著者名/発表者名
      藤田悠作、平野佳穂、近藤政晴、出羽毅久
    • 学会等名
      第29回 光合成セミナー2022:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] カロテノイドの科学 ―基礎、研究の新展開、生理活性―2024

    • 著者名/発表者名
      高市真一(監修)、出羽毅久・近藤政晴(第6章)
    • 総ページ数
      275
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781317984
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2022-07-05   更新日: 2024-12-25  

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