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細胞内タンパク質選別輸送・膜挿入に関わる真核生物由来の糖脂質の同定と構造機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K19262
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関岩手大学

研究代表者

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

研究分担者 永森 收志  東京慈恵会医科大学, 医学部, 教授 (90467572)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2023年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2022年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードタンパク質細胞内輸送 / タンパク質選別輸送 / タンパク質膜挿入 / ミトコンドリア / 小胞体 / 糖脂質 / MPIase / 細胞内選別輸送 / リポソーム
研究開始時の研究の概要

タンパク質が細胞質で生合成されたのち、それらが機能を発揮する場所に輸送され局在化する。申請者らは、モデル生物大腸菌のタンパク質膜挿入機構を研究し、膜挿入に必須の糖脂質MPIaseを発見した。タンパク質膜挿入機構は基本的にすべての生物で保存されているため、真核生物でもMPIase様の機能をもつ物質が存在する可能性を着想した。本研究では真核生物のMPIaseホモログを同定し、構造機能解析を進める。真核生物MPIaseホモログは、細胞内タンパク質局在化に関する未解明の問題をすべて解決する最後のミッシング・ピースと位置付けられる。

研究成果の概要

タンパク質が細胞質で生合成されたのち、それらが機能を発揮する場所に局在化する。多くのタンパク質がオルガネラや細胞質膜に挿入する。この分子機構は、基本的なレベルではすべての生物で保存されている。大腸菌では糖脂質MPIaseが膜挿入に必須である。本研究では、ヒト由来の細胞のミトコンドリアや小胞体にMPIaseホモログが存在することを実証し、その精製、構造機能解析を通して局在化機構が不明な、膜タンパク質の選別輸送・膜挿入機構を明らかにすることを目的に研究を進めた。ミトコンドリアや小胞体にはそれぞれ特有のMPIaseホモログが存在し、膜挿入だけでなく選別輸送にも関与していることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

タンパク質の細胞内局在や膜挿入の分子機構については、様々な手法を用いて精力的に研究されている。特に、タンパク質性の因子については、局在化・選別輸送や膜挿入に関わる因子はすべて同定されていると考えられている。一方、非タンパク質性の因子については、比較的注目されてこなかった。本研究で同定した、オルガネラの各MPIaseホモログは、タンパク質選別輸送・膜挿入といったタンパク質局在化に関する未解明の問題をすべて解決する最後の「ミッシング・ピース」とも位置付けされるものと言える。特に、ミトコンドリアは老化や生活習慣病にも深くかかわるオルガネラであるため、これらの分子機構の解明も進むことが期待される。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (29件) (うち招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] CdsA, a CDP‐diacylglycerol synthase involved in phospholipid and glycolipid MPIase biosynthesis, possesses multiple initiation codons2024

    • 著者名/発表者名
      Hikage Runa、Sekiya Yusei、Sawasato Katsuhiro、Nishiyama Ken‐ichi
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 29 号: 4 ページ: 347-355

    • DOI

      10.1111/gtc.13104

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural Requirements of a Glycolipid MPIase for Membrane Protein Integration2023

    • 著者名/発表者名
      Kohki Fujikawa, Youjung Han, Tsukiho Osawa, Shoko Mori, Kaoru Nomura, Maki Muramoto, Ken-ichi Nishiyama, Keiko Shimamoto
    • 雑誌名

      Chemistry A European Journal

      巻: - 号: 30

    • DOI

      10.1002/chem.202300437

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Coordinated upregulation of two CDP-diacylglycerol synthases, YnbB and CdsA, is essential for cell growth and membrane protein export in the cold2023

    • 著者名/発表者名
      Kamemoto Yuki、Hikage Runa、Han Youjung、Sekiya Yusei、Sawasato Katsuhiro、Nishiyama Ken-ichi
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters

      巻: 370

    • DOI

      10.1093/femsle/fnad131

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Intermolecular Interactions between a Membrane Protein and a Glycolipid Essential for Membrane Protein Integration2022

    • 著者名/発表者名
      Mori Shoko、Nomura Kaoru、Fujikawa Kohki、Osawa Tsukiho、Shionyu Masafumi、Yoda Takao、Shirai Tsuyoshi、Tsuda Shugo、Yoshizawa-Kumagaye Kumiko、Masuda Shun、Nishio Hideki、Yoshiya Taku、Suzuki Sonomi、Muramoto Maki、Nishiyama Ken-ichi、Shimamoto Keiko
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 17 号: 3 ページ: 609-618

    • DOI

      10.1021/acschembio.1c00882

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Role of a bacterial glycolipid in Sec-independent membrane protein insertion2022

    • 著者名/発表者名
      Nomura K, Mori S, Fujikawa K, Osawa T, Tsuda S, Yoshizawa-Kumagaye K, Masuda S, Nishio H, Yoshiya T, Yoda T, Shionyu M, Shirai T, Nishiyama KI, Shimamoto K.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 12 号: 1 ページ: 12231-12231

    • DOI

      10.1038/s41598-022-16304-1

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Interaction between glycolipid MPIase and proteinaceous factors during protein integration into the cytoplasmic membrane of E. coli2022

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa Hanako、Sawasato Katsuhiro、Mori Shoko、Fujikawa Kohki、Nomura Kaoru、Shimamoto Keiko、Nishiyama Ken-Ichi
    • 雑誌名

      Frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 9 ページ: 986602-986602

    • DOI

      10.3389/fmolb.2022.986602

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A bacterial glycolipid essential for membrane protein integration2022

    • 著者名/発表者名
      Fujikawa Kohki、Mori Shoko、Nishiyama Ken-ichi、Shimamoto Keiko
    • 雑誌名

      Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry

      巻: 81 ページ: 95-129

    • DOI

      10.1016/bs.accb.2022.09.005

    • ISBN
      9780323985888
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 低温かつ CdsA の制限された条件における YnbB の重要性2024

    • 著者名/発表者名
      日景瑠那、西山賢一
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質膜挿入に関わる糖脂質酵素MPIaseの構造と機能に関する研究2024

    • 著者名/発表者名
      Han Youjung、西山賢一
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌内膜、外膜由来の生体膜保護物質の同定と構造・機能解析2024

    • 著者名/発表者名
      古谷萩、西山賢一
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 生体膜保護物質(BPF)の同定・構造機能解析~BBMV由来のマウスBPF精製スキームの検討~2024

    • 著者名/発表者名
      渡会未夢、古谷萩、Wiriyasermukul Pattama、永森收志、西山賢一
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] TATタンパク質膜透過機構の解析2024

    • 著者名/発表者名
      西川華子、西山賢一
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] YidCと相互作用する機能未知因子YibNのin vitro 解析2024

    • 著者名/発表者名
      山本波知、西川華子、Katherine Zhao、Franck Duong、西山賢一
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌生体膜由来の膜保護物質の同定および構造機能解析2024

    • 著者名/発表者名
      古谷 萩、沢里克宏、森祥子、藤川紘樹、島本啓子、西山賢一
    • 学会等名
      第9回デザイン生命工学研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 再構成系を用いたTAT 膜透過機構の解析2024

    • 著者名/発表者名
      西川 華子、山本 波知、菅野 琴華、沢里 克宏、山田 美和、西山 賢一
    • 学会等名
      第18 回 無細胞生命科学研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌EmrE タンパク質の膜挿入機構の解析2024

    • 著者名/発表者名
      山本 波知、小川 裕太、西川 華子、松浦 友亮、西山 賢一
    • 学会等名
      第18 回 無細胞生命科学研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] リン脂質および糖脂質MPIase 生合成に関わるCDP-ジアシルグリセロール生合成酵素をコードするcdsA遺伝子の翻訳開始領域の解析2024

    • 著者名/発表者名
      日景瑠那 、関谷優晟 、沢里克宏 、西山賢一
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] CDP-ジアシルグリセロール生合成酵素CdsAの翻訳開始領域の解析2023

    • 著者名/発表者名
      日景瑠那、西山賢一
    • 学会等名
      第19回 21世紀大腸菌研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌のタンパク質膜挿入に関わる糖脂質MPIaseの生合成酵素の探索2023

    • 著者名/発表者名
      澁谷まゆ、Han Youjung、田近優太、大澤月穂、藤川絋樹、島本啓子、西山賢一
    • 学会等名
      予知生合成科学 第2回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 構造類似糖脂質MPIase、BPF、ECAの生合成酵素の探索・比較による糖付加戦略の解明2023

    • 著者名/発表者名
      西山賢一
    • 学会等名
      予知生合成科学 第2回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 社会実装を目指した汎用的セル・フリー膜タンパク質合成システムの開発2023

    • 著者名/発表者名
      西山賢一
    • 学会等名
      超越分子システム 第二回領域会議
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 膜タンパク質の複合体形成と機能発現におけるMPIaseの役割2023

    • 著者名/発表者名
      山本波知、西川華子、Pattama Wiryasermkul、永森収志、西山賢一
    • 学会等名
      超越分子システム 第二回領域会議
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] TAT (Twin-Arginine Translocation )膜透過機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      西川華子、山本波知、菅野琴華、沢里克宏、山田美和、西山賢一
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質膜挿挿入に関与するMPIase生合成酵素の探索2023

    • 著者名/発表者名
      Han Youjung、藤川 紘樹、島本啓子、西山賢一
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ヒト細胞を用いた真核生物のタンパク質膜挿入因子 MPIaseホモログの探索2023

    • 著者名/発表者名
      日景 瑠那、Pattama Wiriyasemkul、永森 收志、西山 賢一
    • 学会等名
      第8回 デザイン生命工学研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌生体膜由来の生体膜保護物質の同定とその構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      古谷 萩、沢里 克宏、森 祥子、藤川 絋樹、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      21世紀大腸菌研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] MPIase生合成酵素の探索2022

    • 著者名/発表者名
      澁谷 まゆ、Han Youjung、大澤 月穂、藤川 紘樹、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌生体膜由来の膜保護物質の同定と構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      古谷 萩、沢里 克宏、森 祥子、藤川 絋樹、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 生体膜保護物質(BPF)の同定・構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡会 未夢、古谷 萩、Wiriyasemkul Pattama、永森 收志、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 膜タンパク質の膜挿入と複合体形成におけるMPIase の機能2022

    • 著者名/発表者名
      山本 波知、西川 華子、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質の膜挿入反応を触媒する糖脂質MPIaseの構造・機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      Han Youjung、藤川 紘樹、大澤 月穂、村本 真規、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 膜挿入基質タンパク質GFP-Tom5の精製2022

    • 著者名/発表者名
      木村 樹南、森 祥子、藤川 紘樹、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 真核生物のMPIase(Membrane protein integrase)ホモログの探索2022

    • 著者名/発表者名
      日景 瑠那、Wiriyasemkul Pattama 、永森 收志、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] TAT(Twin-Arginine Translocation )膜透過反応の分子機構解析2022

    • 著者名/発表者名
      西川 華子、西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 膜タンパク質のバイオジェネシスに関与する糖脂質MPIaseの構造と機能2022

    • 著者名/発表者名
      西山 賢一
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] タンパク質の膜挿入反応を触媒する糖脂質MPIaseの構造・機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      Han Youjung、藤川 紘樹、大澤 月穂、村本 真規、島本 啓子、西山 賢一
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 岩手大学農学部・応用生物化学科・分子生物学研究室

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 岩手大学農学部応用生物化学科分子生物学研究室

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2022-07-05   更新日: 2025-01-30  

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