| 研究課題/領域番号 |
22K19340
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| 研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
鈴木 庸平 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (00359168)
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| 研究分担者 |
金井 昭夫 慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 教授 (60260329)
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| 研究期間 (年度) |
2022-06-30 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2022年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
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| キーワード | 金属硫化物チムニー / 光熱変換赤外分光法 / Pacearhaeota / プロテオーム解析 / トランスクリプトーム解析 / DPANN / 初期生命進化 / ゲノム解析 / 深海底熱水噴出孔 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
近年、ゲノム情報に基づく最新の普遍系統樹では、DPANNと呼ばれる細胞とゲノムのサイズが非常に小さい古細菌が共通祖先に近い根本で分岐することが明らかになった。ほとんどのDPANNは50℃より低い環境に生息するため、生命初期進化の従来説の再検討が行われている。先行研究で、南部マリアナトラフで採取した深海底熱水噴出孔の金属硫化物チムニーは、DPANNが優先し、細胞密度も高い希少な試料であることが判明した。本研究ではプロテオームとメタボローム解析、培養実験を行い、チムニー中に生息するDPANNの生物学的特徴、生態、代謝様式を解明し、初期生命進化の科学的知見を拡大する。
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| 研究実績の概要 |
本研究の目的は、「チムニー内部で始原的な特徴を有する生命が、どのように生命活動を営んでいるのか?」という問いを解明することである。令和4年度は、先行するメタゲノム解析に加えプロテオーム解析を実施することで、深海熱水噴出孔チムニー内部でDPANN古細菌のPacearchaeotaが優先していることを明らかにした。令和5年度は、深海熱水噴出孔チムニー内部に生息する微生物の共生を明らかにした。
さらに、南マリアナトラフの熱水噴出域で採取したチムニー試料を、精密ダイヤモンドバンドソーを用いて切断し、分析用の薄片を作成した。樹脂埋めなしで作成した薄片は、切断面の研磨等の処理をせずに分析に供した。次に、光熱変換赤外分光法(Optical-photothermal IR spectroscopy, O-PTIR)を用いて、チムニー内部で微生物が生息する箇所を詳細に解析した。また、別に作成した同サイトのチムニー薄片試料
を対象に、大型放射光施設(SPring-8)の軟X線光物性ビームラインBL17SUにて解析した結果とも比較した。R5年度の結果は、R4年度分とまとめ、論文化を進めている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
R5年度末に結果を取りまとめ論文を作成し国際誌へ投稿を行ったが、データの追加と再投稿が必要となった。補助事業の目的をより精緻に達成するための研究の実施や論文投稿などを、R6年度に行うことになった。
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| 今後の研究の推進方策 |
R6年4月の時点で必要な追加実験は完了しているので、再投稿のための準備を行なっているところである。
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