研究課題/領域番号 |
22K19343
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研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
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研究機関 | 山梨大学 |
研究代表者 |
安達 登 山梨大学, 大学院総合研究部, 教授 (60282125)
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研究分担者 |
田中 智久 山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (30585310)
神澤 秀明 独立行政法人国立科学博物館, 人類研究部, 研究主幹 (80734912)
森石 恆司 山梨大学, 大学院総合研究部, 教授 (90260273)
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研究期間 (年度) |
2022-06-30 – 2025-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2024年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2023年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2022年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
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キーワード | HBVゲノム / 古代DNA / 感染実験 |
研究開始時の研究の概要 |
B型肝炎ウイルスは人類以外の霊長類に広く感染し、それらが人類へも感染することが知られており、各々に特有な遺伝子型が明らかにされている。そのため、特徴的な生息域を持つ霊長類のB型肝炎ウイルス遺伝子を古人骨から検出できれば、ヒトの移動経路が明らかにされる可能性がある。これを用いて日本列島へのヒトの移動仮説の検証を行い、新たな仮説の提唱を目指す。また、古代ウイルス粒子を再現し感染実験を行うことで、B型肝炎ウイルスの進化史をも明らかにする。
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研究実績の概要 |
縄文時代人骨から検出されたB型肝炎ウイルスのゲノム配列は、既存のB型肝炎ウイルスクラスターの中では東南アジアタイプとの一致率が最も高く、同一ジェノタイプの基準を満たすものであった。 そのため系統解析、主成分分析を行うと東南アジアタイプのクラスター近くに入ってはくるが、ブートストラップ値が十分高いとはいえず、進化のプロセスが不明のままであった。既知の研究からはリコンビナントの可能性が最も有力に考えられた。 しかしリコンビナント解析を既存のB型肝炎ウイルスとの間で行っても、はっきりとした検出には至らず、未知のB型肝炎ウイルスとのリコンビナントの可能性も示唆された。 系統ネットワーク解析を行うと複雑なリコンビナントの可能性が示され、検出されたB型肝炎ウイルスはやはり東南アジアタイプの近縁に位置した。 以上の結果を初期人類集団の移動と関連させて論文に投稿する予定である。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
上記の様に、古人骨から検出したHBVゲノム配列自体は決定できており、その系統についてもほぼ決定できている。しかし感染実験については未だおこなえていないので、今年度はこの実験の実現を目指す。
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今後の研究の推進方策 |
感染実験を精力的に進める。古代HBV(ancient HBV: aHBV)DNAを培養細胞に導入、レプリコンを作製、導入後の複製効率をaHBVと現代HBV(modernHBV : mHBV)とで比較、またウイルス粒子を再現し、aHBVとmHBVの現代人のNTCPへの感染効率の比較、aHBVとmHBVの古代人のNTCPへの感染効率を感染実験で探る。さらにHBVの病原性にはHBVの産生するHBxタンパクが関わるが、未だ不明な部分が多い。予備研究で、HBxの塩基配列に進化速度の遅い部分を特定しており、本研究で得られた古代HBV DNAからHBxの保存領域を取り出したプラスミドを培養細胞に導入し、レプリコンまたはウイルス粒子を復元し、ウイルス増殖におけるHBxの機能を明らかにする。
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