| 研究課題/領域番号 |
22K19349
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| 研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
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| 研究機関 | 東京都立大学 |
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研究代表者 |
野澤 昌文 東京都立大学, 理学研究科, 准教授 (50623534)
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| 研究期間 (年度) |
2022-06-30 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2024年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2023年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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| キーワード | B染色体 / ショウジョウバエ / Y染色体 / 遺伝子発現 / 性染色体 / 染色体ドライブ / マイクロダイセクション / ゲノムアセンブリ / 染色体FISH |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では、メンデル遺伝に従わないB染色体とよばれる染色体を物理的に単離する2つの手法を確立し、その方法を用いて申請者自身が発見したアサヒナショウジョウバエのB染色体の配列を決定することを目的とする。また、得られたB染色体配列を本種および近縁種のゲノム配列と比較し、B染色体の起源と機能、さらには生物学的意義を明らかにすることを目指す。
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| 研究実績の概要 |
本年度はB染色体を持つDrosophila asahinai（アサヒナショウジョウバエ、以降アサヒナ）のB有系統とB無系統の交配実験を行い、B染色体の次世代（F1世代）への伝播率を調べた。B染色体の有無の確認を迅速に行うため、B染色体を特異的に増幅するプライマーの設計を試みた。しかし、B染色体とY染色体を識別して増幅することが困難であったため、F1個体のゲノムサイズをフローサイトメトリーで測定する方法を併用した。その結果、B染色体をもつオスとB染色体をもたないメスが交配した場合に、オスにB染色体が伝わりやすく、一方でメスにB染色体が伝わりにくいことが明らかになった。
そこで、この要因を明らかにすべく、減数分裂過程や受精過程でのB染色体の挙動を明らかにする実験を計画すると共に、より高精度なゲノム配列決定を試みた。しかし、カビの繁殖により本系統の維持で精いっぱいな状況が続いたため、これらの実験を遂行することができなかった。
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| 現在までの達成度 |
現在までの達成度
3: やや遅れている
理由
予定していた、
１．減数分裂過程や受精過程におけるB染色体の挙動の観察
２．より高精度なゲノム配列決定
を実施できなかったため。
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| 今後の研究の推進方策 |
研究期間延長を認めていただいたので、2025年度はHiFi-seq、Hi-C、ナノポア超ロングリードなどを併用し、さらに高精度なゲノム配列を決定し、B染色体およびY染色体配列をできるだけ完全に決定したい。また、減数分裂や受精過程を観察することにより、Y有オス×Y無メスの交配によりF1オスにB染色体が伝播しやすく、F1メスにB染色体が伝播しにくい要因を明らかにすることを目指す。
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