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新機軸・PHD1特異的阻害による低酸素障害緩和化合物の創出と責任遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 22K19755
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野
研究機関佐賀大学

研究代表者

辻田 忠志  佐賀大学, 農学部, 准教授 (20622046)

研究分担者 川口 真一  佐賀大学, 農学部, 准教授 (00722894)
伴 匡人  久留米大学, 分子生命科学研究所, 准教授 (00579667)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2024年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード低酸素 / PHD選択制 / PH-HIF阻害剤 / 低分子化合物 / 虚血性疾患 / PHD/HIF / PHD / HIF / 低酸素応答 / PHD-HIF系
研究開始時の研究の概要

抹消小規模塞栓の形成、解消の繰り返しは低酸素障害や慢性炎症を誘導する。これらの障害が頻発すると糖尿病、神経変性疾患などの成人病を誘導するため、予防や介入法の確立が求められている。血中の酸素濃度が低下すると、PHD群によるHIF-αの水酸化度合いが低下し、HIF-αが安定化し低酸素防御機構が発動される。低酸素に暴露せずにHIF-αを安定化できれば、低酸素障害から組織を保護し、機能回復が加速できる。PHD群の中でPHD1欠失マウスは、構成的な低酸素防御遺伝子の発現に関与するHIF-αの機能を増強し、低酸素刺激に防御的に働くことから、本研究ではPHD1の機能を特異的に阻害する方策の確立を目指す。

研究成果の概要

本研究で開発した新規HIF-PHD阻害剤PyrzAは、既存のHIF-PHD阻害剤と異なり、HIFペプチドを模する形で、活性中心に至るポケット構造に蓋をし、HIF-PHDの結合を阻害する。PyrzAのケミカルスペースは十分に存在することから、核内に存在するPHD1と細胞質に存在するPHD2に対して特異的に阻害する化合物の取得を目指した。数種の化合物はPHD1にPHD2より強く結合する結果を得たが、培養細胞での機能差異は小さく、今後in silicoモデリングなどを通して構造変更を進める。また、核内へ直接送達する形のHoechest-PyrzAの開発にも取り組み、少量ながらも化合物を合成できた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

これまで、PHD1とPHD2に選択制を与える化合物は存在しておらず、その違いに注目した研究も少ない。今回の研究で、組換えPHD1及びPHD2組換えタンパク質の大量精製に成功し、PHD酵素活性評価、結晶構造解析などを実施できるようになった。また、PyrzAの改良を進め、核移行性PyrzAの開発に着手し、粗精製物ながらも、新規化合物を作製することができた。現在は、溶解性の問題を解決するために、リンカー部分を改良した化合物を開発しており、よりPHD1を特異的に阻害できる化合物を創出できる見込みである。

報告書

(4件)
  • 2024 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2025 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 2件) 備考 (3件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] アルメリア大学(スペイン)

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [国際共同研究] ペラデニア大学(スリランカ)

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [雑誌論文] NF-E2-related factor 1 suppresses the expression of a spermine oxidase and the production of highly reactive acrolein2025

    • 著者名/発表者名
      Hirakawa Tomoaki、Taniuchi Megumi、Iguchi Yoko、Bogahawaththa Sudarma、Yoshitake Kiko、Werellagama Shanika、Uemura Takeshi、Tsujita Tadayuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 15 号: 1 ページ: 12405-12405

    • DOI

      10.1038/s41598-025-96388-7

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Emerging Role of GCN1 in Disease and Homeostasis2024

    • 著者名/発表者名
      Tatara Yota、Kasai Shuya、Kokubu Daichi、Tsujita Tadayuki、Mimura Junsei、Itoh Ken
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 25 号: 5 ページ: 2998-2998

    • DOI

      10.3390/ijms25052998

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification and mechanistic investigation of ellagitannins from <i>Osbeckia octandra</i> that attenuate liver fibrosis via the TGF-<i>β</i>/SMAD signaling pathway2023

    • 著者名/発表者名
      Bogahawaththa Sudarma、Kawamura Tomoaki、Bandaranayake Udari、Hirakawa Tomoaki、Yamada Goki、Ishino Hana、Hirohashi Tsuzumi、Kawaguchi Shin-ichi、Wijesundera Kavindra K、Wijayagunawardane Missaka P B、Ishimaru Kanji、Kodithuwakku Suranga P、Tsujita Tadayuki
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 87 号: 11 ページ: 1295-1309

    • DOI

      10.1093/bbb/zbad114

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Improving lipophilicity of 5-(1-acetyl-5-phenylpyrazolidin-3-ylidene)-1,3-dimethylbarbituric acid increases its efficacy to activate hypoxia-inducible factors2022

    • 著者名/発表者名
      Sonoda Kento、Ujike Saki、Katayama Akito、Suzuki Norio、Kawaguchi Shin-ichi、Tsujita Tadayuki
    • 雑誌名

      Bioorganic and Medicinal Chemistry

      巻: 73 ページ: 117039-117039

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2022.117039

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Prolyl Hydroxylase Domain Protein Inhibitor Not Harboring a 2-Oxoglutarate Scaffold Protects against Hypoxic Stress2022

    • 著者名/発表者名
      Kento Sonoda , Sudarma Bogahawatta, Akito Katayama, Saki Ujike, Sae Kuroki, Naho Kitagawa, Kohichi Hirotsuru, Norio Suzuki, Toshio Miyata, Shin-ichi Kawaguchi, and Tadayuki Tsujita*
    • 雑誌名

      ACS Pharmacol. Transl. Sci.

      巻: 5 号: 5 ページ: 362-372

    • DOI

      10.1021/acsptsci.2c00002

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 細胞内局所で生じるストレスと食品成分等による解消方策2024

    • 著者名/発表者名
      辻田 忠志
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年西日本支部大会シンポジウム「摂食による生体恒常性の制御」
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新奇PHD阻害剤の作用機序解明に向けた組換えPHDタンパク質の発現2024

    • 著者名/発表者名
      吉竹 紀子, 園田 健登, 伴 匡人, 川口 真一, 辻田 忠志
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年西日本支部大会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 2-OG骨格を持たない新規HIF-PH阻害薬PyrzA2023

    • 著者名/発表者名
      川口 真一, 濱田 悠菜, 氏家 沙綺, 園田 健登, 辻田 忠志.
    • 学会等名
      第45回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] バキュロウイルス発現系によるPHDタンパク質大量発現と精製条件の検討2023

    • 著者名/発表者名
      吉竹 紀子, 園田 健登, 伴 匡人, 辻田 忠志
    • 学会等名
      第45回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質恒常性の維持・老化と関連する環境転写因子Nrf1の解析2022

    • 著者名/発表者名
      辻田 忠志
    • 学会等名
      佐賀大学SDGsプロジェクト研究所「皮膚科学に関する知の拠点形成プロジェクト」第一回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 低酸素ストレスから防御する新奇HIF活性化剤PyrzAの発見2022

    • 著者名/発表者名
      園田 健登, 片山 彰人, 氏家 沙綺, 黒木 紗英, 北川 尚穂, 廣津留 倖一, 川口 真一, 辻田 忠志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会.
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 新たな骨格を持つPHD活性阻害剤PyrzAの創出と構造活性相関研究2022

    • 著者名/発表者名
      辻田 忠志, 園田 健登, 氏家 沙綺, 片山 彰人, 鈴木 教郎 川口 真一
    • 学会等名
      第18回がんとハイポキシア研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 佐賀大学農学部生化学分野のホームページ

    • URL

      http://seika.ag.saga-u.ac.jp

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [備考] 佐賀大学農学部生化学分野のホームページ

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 佐賀大学発ベンチャーの称号を授与

    • URL

      https://www.saga-u.ac.jp/koho/press/2022092627531

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [産業財産権] 不斉炭素をもたない含窒素環状化合物又はその塩2024

    • 発明者名
      川口 真一, 辻田 忠志,濱田 悠菜
    • 権利者名
      川口 真一, 辻田 忠志,濱田 悠菜
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2024-199969
    • 出願年月日
      2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-07-05   更新日: 2026-01-16  

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