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網羅的プロテオーム解析によるヒトの細胞種特異的リボソームタンパクの同定と機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K20627
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関京都大学

研究代表者

山川 達也  京都大学, iPS細胞研究所, 特定研究員 (20961197)

研究期間 (年度) 2022-08-31 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードリボソーム / リボソームタンパク質 / ヒト人工多能性幹細胞 / プロテオーム / 質量分析 / プロテオミクス / 翻訳 / Specialized ribosome
研究開始時の研究の概要

人の体の中には約10万種類のタンパク質が存在すると言われている。タンパク質は、mRNAから翻訳という過程を経て生成され、体内の様々な細胞の機能や生存といった重要な働きする。この翻訳に重要な働きをするのがリボソームである。
近年の研究で、このリボソームを構成するタンパク質が細胞の種類によって異なる事がわかってきた。そこで本研究では、当研究室で改良された新たな質量分析法を用いることで網羅的に、各種細胞におけるリボソームタンパク質の違いの同定を試みる。この研究は、原因が不明なリボソー ム病に対する新たな病態解明の手がかりや、リボソームの機能差による遺伝子発現制御という新たな知見に繋がると期待される。

研究成果の概要

三胚葉由来であるヒト初代細胞7種類の培養系の確立と、ヒトiPS細胞を用いた複数種の体細胞への分化誘導を習得した。これら、ヒト細胞において、各々RNAとタンパク質試料を回収した。翻訳が盛んに行われていると考えられるポリソーム分画を取得し、解析する必要があると考え、今回用いた細胞種すべてに対して、スクロースグラジエントによるポリソーム画分の回収と、そこからのタンパク質抽出を行った。これら試料を用いた網羅的マルチオミクス解析(トランスクリプトーム・プロテオーム)のためのmRNA-seq、質量分析器の扱いを習得し、引き続き解析を行っていく。

研究成果の学術的意義や社会的意義

リボソームは、遺伝子発現の最終段階であるタンパク質合成を担う細胞小器官である。80種のリボソームタンパク質(RP)の量的な不均一性からなるリボソームの機能特異性は発見当初から提唱されていたものの長らくその真偽は不明であった。 近年、細胞種特異的なリボソームの機能差因が報告されているものの、リボソームの主要な構成要素であるRPの量的な差についてヒト細胞での報告が限られている。ヒト細胞における細胞種特異的なRPの解析は、多くのリボソー ム病に対する新たな病態解明の手がかりとなるだけでなく、リボソームの機能差による遺伝子発現制御という分子生物学における新たな分野を開くことが期待される。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2023

すべて 学会発表 (2件) (うち招待講演 2件)

  • [学会発表] 誰もが安心してiPS細胞を用いた治療を受けられるようになるには、どのようなことが必要だろう?2023

    • 著者名/発表者名
      山川達也
    • 学会等名
      京都府未来の担い手育成プログラム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 直撃iPS細胞~実際の現場の声を聴こう~2023

    • 著者名/発表者名
      山川達也
    • 学会等名
      京都府未来の担い手育成プログラム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-09-01   更新日: 2025-01-30  

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