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ブランチポイントを標的とした新たなエクソンスキップ法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 22K20710
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0801:薬学およびその関連分野
研究機関日本赤十字社和歌山医療センター(臨床研究センター) (2023)
京都大学 (2022)

研究代表者

大原 寛明  日本赤十字社和歌山医療センター(臨床研究センター), 脳神経内科部, 医長 (20964018)

研究期間 (年度) 2022-08-31 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードスプライシング / ブランチポイント / アンチセンス核酸
研究開始時の研究の概要

アンチセンス核酸(AON)によるエクソンスキップ法の標的はエクソン内スプライシング促進配列やスプライス部位が主流であり、スプライシング制御機構の重要なエレメントであるブランチポイント(BP)は標的とされていない。本研究ではその知見を発展させ、どのような配列的特徴を持つBPが標的として有効か他の遺伝性疾患でも解析し、BPがAONによるエクソンスキップ法の新たな選択肢となることを提唱する。

研究実績の概要

本研究の目的は、アンチセンス核酸(AON)によるエクソンスキップ法の標的配列として、スプライシング制御機構の重要なエレメントであるブランチポイント(BP)を活用する方法論を確立することである。AONによるエクソンスキップ法の標的はエクソン内スプライシング促進配列やスプライス部位が主流であり、スプライシング制御機構の重要なエレメントであるBPは標的とされていない。申請者らは福山型先天性筋ジストロフィーの異常スプライシングを来す変異で、BPもAONの標的配列の有用な候補であることを見出した。本研究ではその知見を発展させ、どのような配列的特徴を持つBPが標的として有効か他の遺伝性疾患においても解析している。
本年度はin silicoツールで予測されたBPを標的としたAONを用いて、細胞実験・RT-PCRを実施し、AONのエクソンスキップ評価を行い、有効なエクソンの分類・抽出を行った。
現在も分類・抽出を行っており、今後さらに実施例を追加し、有効なAONではどのような規則性があるのかを明らかにする。
本研究の成果は、エクソンスキップ法の標的候補配列を増やし、様々な遺伝子疾患に対し、副作用のより少ない治療に繋がる可能性に期待できる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

研究代表者が研究期間中にその他の業務を行う必要が生じ、研究を一時期中断していたため。

今後の研究の推進方策

有効なエクソンの分類・抽出をさらに実施していく。エクソンスキップすることができるAONにおいて、BPとスプライス部位のスコアの比較、有効なエクソン・BPの配列の特徴の解析を行い、規則性を見つけて、有効なBPのルール化を行う。
ルール化ができたら今後の展望として、実際の遺伝子疾患の治療に向けたエクソンで有効性の検証を行い、BPをエクソンスキップ法の新たな標的配列として確立させる。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件) 産業財産権 (2件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Branchpoints as potential targets of exon-skipping therapies for genetic disorders2023

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Ohara, Motoyasu Hosokawa, Tomonari Awaya, Atsuko Hagiwara, Ryo Kurosawa, Yukiya Sako, Megumu Ogawa, Masashi Ogasawara, Satoru Noguchi, Yuichi Goto, Ryosuke Takahashi, Ichizo Nishino, Masatoshi Hagiwara
    • 雑誌名

      Molecular Therapy-Nucleic Acids

      巻: 33 ページ: 404-412

    • DOI

      10.1016/j.omtn.2023.07.011

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Branch points as potential targets of exon-skipping therapies for genetic disorders2023

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Ohara, Motoyasu Hosokawa, Tomonari Awaya, Atsuko Hagiwara, Ryo Kurosawa, Yukiya Sako, Megumu Ogawa, Masashi Ogasawara, Satoru Noguchi, Yuichi Goto, Ryosuke Takahashi, Ichizo Nishino, Masatoshi Hagiwara
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting "Eukaryotic mRNA Processing"
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [産業財産権] ブランチポイントを標的とする偽エクソン型異常スプライシングを是正するためのアンチセンス核酸2023

    • 発明者名
      萩原正敏、粟屋智 就、大原寛明
    • 権利者名
      萩原正敏、粟屋智 就、大原寛明
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 外国
  • [産業財産権] ブランチポイントを標的とする偽エクソン型異常スプライシングを是正するためのアンチセンス核酸2022

    • 発明者名
      萩原正敏、粟屋智就、大原寛明
    • 権利者名
      萩原正敏、粟屋智就、大原寛明
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2022-188542
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-09-01   更新日: 2024-12-25  

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