| 研究課題/領域番号 |
22K20783
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| 研究種目 |
研究活動スタート支援
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
0901:腫瘍学およびその関連分野
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| 研究機関 | 筑波大学 |
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研究代表者 |
橋本 幸枝 筑波大学, 医学医療系, 講師 (70964063)
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| 研究期間 (年度) |
2022-08-31 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
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| キーワード | 妊娠関連乳癌 / 遺伝子発現解析 / 体細胞変異解析 / 網羅的遺伝子解析 / シングルセルRNA-seq |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では、妊娠関連乳癌の臨床・分子学的特徴を明らかに することを目的として、網羅的遺伝子解析(遺伝子発現解析・体細胞変異解析・シングルセ ルRNA-seq)を行う。これにより妊娠関連乳癌の病態解明や特異的な治療ターゲットの同定に至れば、妊娠関連乳癌の予後改善に繋がることが期待される。
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| 研究実績の概要 |
妊娠関連乳癌は予後不良な疾患であるが、妊娠関連乳癌の分子学的特徴に関して、過去にいくつか報告はあるものの総じてデータは少なく、特に日本人における妊娠関連乳癌の遺伝子解析に関する報告は過去にはない。本研究の目的は網羅的遺伝子解析(遺伝子発現解析・体細胞変異解析・シングルセルRNA-seq等)を通して妊娠関連乳癌の臨床・分子学的特徴を明らかにすることである。
本年度は筑波大学附属病院、および茨城県内の共同研究施設において診断・治療が行われた妊娠関連乳癌の臨床情報・FFPE検体の収集および核酸(DNA, RNA)抽出を行なった。現時点で妊娠期乳癌10例、授乳期乳癌17例、年齢および臨床的サブタイプをmatchさせた非妊娠関連乳癌27例の検体収集が終了している。
今後、nCounterによる遺伝子発現解析、および全エクソン解析による遺伝子変異解析を行い、bulkでの解析を進めると同時に新規発生の妊娠関連乳癌についても検体の収集を進める予定である。
その後、妊娠関連乳癌の検体を用いたシングルセルRNA-seq解析または空間的トランスクリプトーム解析を実施する予定である。当初シングルセルRNA-seqを施行する予定であったが、癌組織のheterogeneityも考慮するとFFPE検体を用いた空間的トランスクリプトーム解析も検討され、現在実験環境の整備を行っている。それらのデータとbulkの解析結果をまとめ、 妊娠関連乳癌の分子学的特徴を明らかにする。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
令和4年度は産前産後休暇および育児休業の取得のため実験を実施することができなかった。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和4年度に実施する予定であった、FFPE検体からの核酸抽出、 nCounterによる遺伝子発現解析、および全エクソン解析による遺伝子変異解析を令和5年度に実施する。
その翌年度にシングルセルRNA-seqを実施予定であったが、疾患の希少性から新鮮検体を採取するハードルが高いことや、癌組織のheterogeneityも考慮するとFFPE検体を用いた空間トランスクリプトーム解析も検討される。令和5年度に条件検討並びに実験環境の整備を行い、令和６年度にシングルセルRNA-seq解析または空間的トランスクリプトーム解析を実施する。
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