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シロイヌナズナの初期胚発生における細胞運命の決定機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22KF0023
補助金の研究課題番号 21F21379 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分外国
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関東北大学

研究代表者

植田 美那子 (2021, 2023)  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20598726)

研究分担者 KAO PING  東北大学, 生命科学研究科, 外国人特別研究員
受入研究者 植田 美那子 (2022)  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20598726)
外国人特別研究員 KAO PING  東北大学, 生命科学研究科, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2023年度: 100千円 (直接経費: 100千円)
2022年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2021年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードArabidopsis thaliana / zygotic embryogenesis / transcriptome / cellular dynamics / embryogenesis
研究開始時の研究の概要

本研究では、シロイヌナズナの初期発生過程において、器官形成の鍵となる転写因子群を探索する。まず、初期胚での遺伝子発現データをクラスタリングし、胚発生中に形成される各組織で働くと考えられる候補遺伝子群を選抜する。こられについて、蛍光マーカーを用いた発現パターンの可視化や、遺伝子破壊株による機能解析を行うことで、胚発生における役割を推定する。これらの解析を通じ、多様な発生運命を規定する分子基盤を明らかにすることを目指す。

研究実績の概要

The goal of this study is to identify the key regulatory genes involved in embryogenesis in Arabidopsis thaliana (Arabidopsis). Zygotic embryogenesis is a fundamental developmental process in which a single-celled zygote goes through a series of cell divisions, patterning and cell type specifications to form a complex embryo during eukaryotic sexual reproduction. In the flowering plant Arabidopsis, zygotes divide stereotypically, allowing observation of embryo patterning events and tracing cell lineages. While decades of genetic analyses have identified a number of genes that play vital roles in embryogenesis, the genome-wide analyses were not feasible until recently due to technical difficulties. We utilized published embryonic transcriptome datasets to search for key regulatory genes of embryogenesis as well as to resolve the underlying regulatory networks. With bioinformatics approaches, we selected a number of candidate genes for further validations and analyses. Identifying the key factors involved in embryonic cell divisions and specifications will greatly improve our knowledge of flowering plant embryogenesis mechanisms, which is important for understanding the fundamental biological process enabling multicellular eukaryotic lives.

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Wageningen University(オランダ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] Wageningen University(オランダ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Wageningen University(オランダ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Constructing an Arabidopsis Embryonic Expression Atlas using snRNA-seq2023

    • 著者名/発表者名
      Ping Kao
    • 学会等名
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 東北大学生命科学研究科植物細胞動態分野

    • URL

      https://www.lifesci.tohoku.ac.jp/PlantCellDyn/?page_id=1408&lang=en

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-02-08   更新日: 2024-12-25  

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