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遺伝子組換えティラピアのゲノムワイド探索:養殖における水資源管理への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22KF0282
補助金の研究課題番号 22F22786 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分外国
審査区分 小区分64040:自然共生システム関連
研究機関愛媛大学

研究代表者

渡辺 幸三  愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 教授 (80634435)

研究分担者 CRUZ KHRISTINA JUDAN  愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2024年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2023年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2022年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
キーワードティラピア / SNP / ゲノム / ゲノムスキャン / ddRAD / 養殖 / フィリピン
研究開始時の研究の概要

フィリピン等の発展途上国では、繁殖力が高く現地に生息する淡水魚ティラピアは重要な養殖資源となっている。本研究では、5品種のティラピアからゲノム情報を収集し、体サイズ、成長速度、免疫力、ストレス耐性などの優良形質に寄与している遺伝子をゲノムから特定し、効率的な交雑試験に活用する情報基盤とする。多くの途上国の水産業を支えるティラピアの商品価値や生産性に関係する遺伝子が見つかれば、これまで膨大な時間を要していた交雑育種の効率化に貢献することが期待される。

研究実績の概要

フィリピンの養殖で活用されている遺伝的に改良されたハイブリッドティラピア個体群における一塩基多型(SNP)解析により、これらの個体群の生物学、エコロジー、適応に重要な役割を果たす複数の遺伝子機能と経路が特定された。これらの遺伝子は、形質変異や環境変化への適応性、生物的および非生物的ストレス要因への応答に影響を与えるメカニズムへの洞察を提供する。また、アノテーション解析により、ティラピアの健康、成長、養殖の持続可能性に重要な影響を与える遺伝子群がゲノム上でクラスターを形成していることが発見された。これらの遺伝的変異は、病気抵抗性、ストレス耐性、代謝効率を向上させ、ティラピアの性能と全体的な養殖成功を助長していると考えられる。
この研究の成果として、ティラピア養殖における系統選択を改善するために、成長速度、免疫機能、代謝効率に関連する特定の遺伝子群が特定されたことが挙げられる。これらの遺伝子をマーカーとすることで、成長の速いハイブリッドティラピア個体群をゲノム情報に基づいて選別できるようになるため、飼育期間の短縮や水や飼料といった重要な資源の節約が可能となる。さらに、病気に対する耐性が強化されたハイブリッドティラピア個体群は、メンテナンスコストや抗生物質の使用を削減することができる。このような遺伝的に改良されたティラピアのハイブリッドティラピア個体群から得られたゲノム配列は、養殖実践に対する潜在的な影響を示しており、改善された系統選択、遺伝的多様性を管理するための目標を定めた育種戦略、環境ストレス要因に対する耐性の強化に活用できる基盤情報となる。

報告書

(3件)
  • 2024 実績報告書
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2024 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] 中央ルソン州立大学/デラサール大学(フィリピン)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] 中央ルソン州立大学(フィリピン)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Natural compound-induced downregulation of antimicrobial resistance and biofilm-linked genes in wastewater Aeromonas species2024

    • 著者名/発表者名
      Judan Cruz Khristina G.、Takumi Okamoto、Bongulto Kenneth A.、Gandalera Emmanuel E.、Kagia Ngure、Watanabe Kozo
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 14 ページ: 1456700-1456700

    • DOI

      10.3389/fcimb.2024.1456700

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genotyping of red tilapia strains in Central Luzon Philippines targeting ESR1 gene2024

    • 著者名/発表者名
      de Guia Arren Christian、Judan Cruz Khristina、Almuete Karl Danielle、Uy Mary Rose
    • 雑誌名

      The Palawan Scientist

      巻: 16 号: 1 ページ: 8-14

    • DOI

      10.69721/tps.j.2024.16.1.02

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genotyping of red tilapia strains in Central Luzon Philippines targeting ESR1 gene2024

    • 著者名/発表者名
      Almuete KDD and Uy MR de Guia ACM, Cruz KJ
    • 雑誌名

      The Palawan Scientist

      巻: 16 (1) ページ: 8-14

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [備考] 愛媛大学沿岸環境科学研究センター分子生態・保健研究室HP

    • URL

      https://www.mecohlab.com/news/ehime-university-initiates-establishment-of-an-eu-satellite-office-at-central-luzon-state-university-philippines

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-11-17   更新日: 2025-12-26  

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