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ハビタット選択と海水面変化がもたらすサンゴ礁性カニ類の遺伝的多様性と進化

研究課題

研究課題/領域番号 22KF0319
補助金の研究課題番号 22F22078 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分外国
審査区分 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
研究機関琉球大学

研究代表者

成瀬 貫 (2023)  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 准教授 (30398309)

研究分担者 EVANS NATHANIEL  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 外国人特別研究員
受入研究者 成瀬 貫 (2022)  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 准教授 (30398309)
外国人特別研究員 EVANS NATHANIEL  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2024年度: 100千円 (直接経費: 100千円)
2023年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2022年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードPopulation Genomics / Ecological Speciation / Habitat preference / Coral Reefs / Crustaceans
研究開始時の研究の概要

Habitat preference is hypothesized to affect the population genetics and evolution of coral reef fauna. To test this, we will conduct significant fieldwork and genomic analyses of 10 reef-associated crab species. Our findings will be published in two impactful publications.

研究実績の概要

This year we completed all of our field collections, generated all our genetic data, and begun our analyses and writing. Genetic work included: (1) the generation of 96 sequences of CO1, 16s, and H3 loci; (2) securing >300 unpublished, CO1 sequences from American collaborators for 30 target species sampled from across the Indo-Pacific; and (3) the generation of 590 million bps of GRAS-Di genomic sequence data for 188 specimens (11 species for population genomics, 66 species for phylogenomic comparative analyses). Combined, these efforts have significantly advanced our aim to investigate the correlation between habitat preference, population genetics, and patterns of diversification across multiple evolutionary radiations of common reef-associated taxa.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

We successfully generated significant genetic data sufficient for investigating our major research questions. Securing this data took a little longer than we hoped, but we have made excellent progress in our analyses and we expect to publish several significant manuscripts from this work.

今後の研究の推進方策

In FY 2024 we will continue our analyses and writing in order to submit two manuscripts to internationally recognized, peer reviewed journals in the area of ecology and evolutionary biology. In May of 2024 we will present some of our findings at an international professional meeting of The Crustacean Society held at Academia Sinica, Taiwan.

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [国際共同研究] University of Florida(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] First record of the Harlequin crab Lissocarcinus orbicularis, an obligate symbiont of sea cucumbers, from the Red Sea2023

    • 著者名/発表者名
      Lasley Robert、Evans Nathaniel、Paulay Gustav、Uyeno Daisuke、Carvalho Susana
    • 雑誌名

      Specimen

      巻: 15 ページ: 2-2

    • DOI

      10.56222/28166531.2023.15

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Allopatric mosaics in the Indo-West Pacific crab subfamily Chlorodiellinae reveal correlated patterns of sympatry, genetic divergence, and genitalic disparity2023

    • 著者名/発表者名
      Lasley Robert M.、Evans Nathaniel、Paulay Gustav、Michonneau Francois、Windsor Amanda、Irwansyah、Ng Peter K.L.
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution

      巻: 181 ページ: 107710-107710

    • DOI

      10.1016/j.ympev.2023.107710

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Habitat preference, speciation and phylogenetic niche conservatism in Thalamita swimming crabs (Portunidae, Thalamitinae).2023

    • 著者名/発表者名
      Evans, N., Sato, T., Naruse, T.
    • 学会等名
      日本甲殻類学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2022-07-28   更新日: 2024-12-25  

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