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植物の環境ストレスに応答した非AUG開始型uORFによる翻訳調節機構の研究

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0031
補助金の研究課題番号 21J21981 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分38060:応用分子細胞生物学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

平郡 雄太  北海道大学, 農学院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード非AUG開始コドン / 上流ORF / ポリアミン生合成 / 翻訳制御 / 上流オープンリーディングフレーム(uORF) / 非AUG開始型コドン / 環境ストレス応答 / 植物の環境応答
研究開始時の研究の概要

近年,真核生物の上流ORF(uORF)は非AUG開始コドンから翻訳されるものが多いことが明らかになってきた.研究代表者の研究により,シロイヌナズナの特定の非AUG開始型uORFでは乾燥ストレスに応答して翻訳開始効率が変化しタンパク質発現を調節することが示唆された.本研究では,種々の環境ストレス条件に応答して翻訳開始効率が変化することにより特定のタンパク質の発現を調節する非AUG開始型uORFをゲノムワイドに同定する.また,シス配列・トランス因子の同定によりその詳細なメカニズムを明らかにする.

研究実績の概要

ポリアミンは植物のストレス応答において重要な生体分子である.本研究では,シロイヌナズナにおけるゲノムワイドな探索によって同定された,ポリアミン合成酵素遺伝子に存在する非AUG開始コドンから始まる上流オープンリーディングフレーム(uORF)による翻訳制御機構とその生理学的役割について解析した.
令和3年度から4年度にかけて,葉肉プロトプラストを用いた一過的発現解析を行い,ポリアミン合成酵素遺伝子の非AUG開始型uORFが細胞内のポリアミンの濃度に応答してポリアミン合成酵素の翻訳を抑制するという負のフィードバック制御に関わることを明らかにした.また,このフィードバック制御には,最初に注目した非AUG開始型uORFのほかにも別の2つの非AUG開始型uORFとRNA二次構造が必要であることを明らかにした.さらに,これらのシス配列は他の植物種のオルソログにも見出され,オルソログの配列を用いた一過的発現解析により,他のいくつかの植物でも同様のフィードバック制御が存在することを明らかにした.
令和5年度はこの非AUG開始型uORFとRNA二次構造を破壊したシロイヌナズナを作出し,HPLC分析により内在のポリアミン量の測定を行った.その結果,このポリアミン合成酵素が直接関わる特定のポリアミン種のみが変異株において野生型株の約3.5倍に増加した.また,寒天培地での生育解析の結果,変異株の主根長および地上部の新鮮重量は有意に小さかった.これらのことは,非AUG開始型uORFとRNA二次構造が関わるフィードバック制御が特定のポリアミンの恒常性維持と植物体の正常な生育に必要であることを示唆するものである.
本研究の成果は,植物における非AUG開始型uORFによる翻訳制御機構とその生理学的意義についての知見を拡張し,また植物のストレス応答に重要なポリアミンの恒常性維持機構を明らかにしたことである.

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Upstream open reading frame-mediated upregulation of ANAC082 expression in response to nucleolar stress in Arabidopsis2023

    • 著者名/発表者名
      Sasaki S, Murakami T, Yasumuro M, Makita A, Oi Y, Hiragori Y, Watanabe S, Kudo R, Hayashi N, Ohbayashi I, Sugiyama M, Yamashita Y, Naito S, Onouchi H
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 40 号: 1 ページ: 21-30

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.22.1215a

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 年月日
      2023-03-25
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide identification of Arabidopsis non-AUG-initiated upstream ORFs with evolutionarily conserved regulatory sequences that control protein expression levels2022

    • 著者名/発表者名
      Hiragori Yuta、Takahashi Hiro、Karino Taihei、Kaido Atsushi、Hayashi Noriya、Sasaki Shun、Nakao Kodai、Motomura Taichiro、Yamashita Yui、Naito Satoshi、Onouchi Hitoshi
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology

      巻: 111 号: 1-2 ページ: 37-55

    • DOI

      10.1007/s11103-022-01309-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 非AUG開始型上流ORFとRNA二次構造による翻訳制御を介したシロイヌナズナにおけるポリアミン合成のフィードバック機構2024

    • 著者名/発表者名
      平郡雄太, 安室美陽, 狩野泰平, 海藤篤, 崎浜靖子, 後藤優弥, 山下由衣, 内藤哲, 尾之内均
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 非AUG開始型上流ORFとRNA二次構造による翻訳制御を介したポリアミン合成のフィードバック機構2023

    • 著者名/発表者名
      平郡雄太, 安室美陽, 狩野泰平, 海藤篤, 山下由衣, 内藤哲, 尾之内均
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide identification of Arabidopsis non-AUG-initiated upstream ORFs with evolutionarily conserved regulatory sequences that control protein expression levels2023

    • 著者名/発表者名
      Yuta Hiragori, Hiro Takahashi, Taihei Karino, Atsushi Kaido, Noriya Hayashi, Shun Sasaki, Kodai Nakao, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Hitoshi Onouchi
    • 学会等名
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 非AUG開始型上流ORFとRNA二次構造による翻訳制御を介したポリアミン合成のフィードバック機構2023

    • 著者名/発表者名
      平郡雄太,安室美陽,海藤篤,狩野泰平,山下由衣,内藤哲,尾之内均
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナのポリアミン合成酵素遺伝子の非AUG開始型uORFを介した翻訳制御2022

    • 著者名/発表者名
      平郡雄太,安室美陽,林憲哉,佐々木駿,山下由衣,内藤哲,尾之内均
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-12-25  

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