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X線μCTを用いたバイオフィルム中での特定微生物の分布の3次元可視化技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0182
補助金の研究課題番号 21J21027 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分22060:土木環境システム関連
研究機関東北大学

研究代表者

浦崎 幹八郎  東北大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2023年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2022年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2021年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワード廃水処理汚泥 / 放射光X線μCT / グラニュール汚泥 / L3吸収端 / 減算法 / 環境微生物 / バイオフィルム / X線検出 / SEM / X線μCT
研究開始時の研究の概要

本研究は、これまで光(蛍光)によって行われてきた廃水処理バイオフィルム中の微生物の可視化を、X線により実施する手法を開発するものである。廃水処理バイオフィルムは、最大数ミリメートスケールにもなる巨大なバイオフィルムであり、廃水中の汚濁物質除去を担っている。廃水処理の安定的維持・効率的運用を行うためには、これらバイオフィルムの中に生息する微生物生態を解明する必要があり、そのための最も基本的な手法が可視化である。本研究では、光が届かないバイオフィルム内部まで可視化可能な高分解能X線CT等により、特定の微生物を可視化する手法を開発する。

研究実績の概要

2023年度の研究実施計画の1点目は、2022年度までと同じく、対象とするバイオフィルムの微生物群集の調査であった。さまざまな廃水処理システム中に存在する汚泥を対象に調査を行った。また、2022年度までの研究進捗をもとに策定した、2023年度の研究実施計画は、放射光X線μCTによるL3吸収端上下のエネルギーを用いたサンプル測定と、減算法による染色元素の特異的可視化であった。微生物細胞への染色操作は、16S rRNAを標的とした核酸プローブおよびtyramide signal amplification反応を用いたプロトコルを用いて、金元素を系統学特異的に染色した。加えて、全微生物細胞の染色を目的としたオスミウム染色を実施した。放射光X線μCT撮影は、大型放射光施設SPring-8 BL47XUにおいて実施した。微生物細胞に対して標識した重元素(オスミウムおよび金)の特異的検出のために、X線吸収端の上下のエネルギーによるスキャンおよび減算法による元素の特異的検出を実施した。可視化の対象とした汚泥はグラニュール汚泥である。吸収端上下で撮影した画像の減算処理を実施した結果、顕著な差分が確認されたことから、オスミウムの特異的検出に成功した。一方で金は、gold-ISH法により特異的に標識した条件において、差分が明確には得られなかった。オスミウムにより染色したグラニュール汚泥を放射光X線μCT撮影に供し、特異的可視化を実施したところ、X線CTの再構成断面と、従来の蛍光観察により撮影したグラニュール汚泥の断面構造は、同じ結果を示した。このように、廃水処理汚泥を非破壊で3次元的に、かつ元素同定を組み合わせた可視化を実施したことにより、汚泥中で生じる微生物現象とその結果生じる物理的な性状の調査に対して、特定元素の標識と放射光X線μCTによる撮影による可視化手法が有益であることが示された。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Microbiological insights into anaerobic phenol degradation mechanisms and bulking phenomenon in a mesophilic upflow anaerobic sludge blanket reactor in long-term operation2024

    • 著者名/発表者名
      Kuroda Kyohei、Maeda Ryota、Shinshima Futaba、Urasaki Kampachiro、Kubota Kengo、Nobu Masaru K.、Noguchi Taro Q.P.、Satoh Hisashi、Yamauchi Masahito、Narihiro Takashi、Yamada Masayoshi
    • 雑誌名

      Water Research

      巻: 253 ページ: 121271-121271

    • DOI

      10.1016/j.watres.2024.121271

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel method for the whole-cell detection of environmental microorganisms using hemin and tyramide signal amplification (Hemin-TSA) with a desired fluorescent dye2023

    • 著者名/発表者名
      Urasaki Kampachiro、Li Yu-You、Kubota Kengo
    • 雑誌名

      Systematic and Applied Microbiology

      巻: 46 号: 6 ページ: 126473-126473

    • DOI

      10.1016/j.syapm.2023.126473

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Improved Properties and Enhancement Strategies of Hydroxyapatite-Based Functional Granular Sludge for a High-Rate Partial Nitritation/Anammox System2023

    • 著者名/発表者名
      Chen Yujie、Feng Gaoxuefeng、Guo Guangze、Urasaki Kampachiro、Kubota Kengo、Li Yu-You
    • 雑誌名

      Environmental Science & Technology

      巻: 57 号: 19 ページ: 7624-7633

    • DOI

      10.1021/acs.est.3c00491

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Key factors improving the stability and the loading capacity of nitrogen removal in a hydroxyapatite (HAP)-enhanced one-stage partial nitritation/anammox process2023

    • 著者名/発表者名
      Chen Yujie、Guo Yan、Feng Gaoxuefeng、Urasaki Kampachiro、Guo Guangze、Qin Yu、Kubota Kengo、Li Yu-You
    • 雑誌名

      Chemical Engineering Journal

      巻: 452 ページ: 139589-139589

    • DOI

      10.1016/j.cej.2022.139589

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Fast formation of anammox granules using a nitrification-denitrification sludge and transformation of microbial community2022

    • 著者名/発表者名
      Lin Lan、Luo Zibin、Ishida Kyuto、Urasaki Kampachiro、Kubota Kengo、Li Yu-You
    • 雑誌名

      Water Research

      巻: 221 ページ: 118751-118751

    • DOI

      10.1016/j.watres.2022.118751

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long term operation performance and membrane fouling mechanisms of anaerobic membrane bioreactor treating waste activated sludge at high solid concentration and high flux2022

    • 著者名/発表者名
      Guo Guangze、Li Yemei、Zhou Shitong、Chen Yujie、Urasaki Kampachiro、Qin Yu、Kubota Kengo、Li Yu-You
    • 雑誌名

      Science of The Total Environment

      巻: 846 ページ: 157435-157435

    • DOI

      10.1016/j.scitotenv.2022.157435

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Achieving superior nitrogen removal performance in low-strength ammonium wastewater treatment by cultivating concentrated, highly dispersive, and easily settleable granule sludge in a one-stage partial nitritation/anammox-HAP reactor.2021

    • 著者名/発表者名
      Yan Guo, Chenglei Xie, Yujie Chen, Kampachiro Urasaki, Yu Qin, Kengo Kubota, Yu-You Li
    • 雑誌名

      Water Research

      巻: 200 ページ: 117217-117217

    • DOI

      10.1016/j.watres.2021.117217

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 放射光X線μCTを用いた廃水処理汚泥の3次元可視化2024

    • 著者名/発表者名
      浦崎幹八郎、諸野祐樹、浦本豪一郎、上杉健太朗、安武正展、李玉友、久保田健吾
    • 学会等名
      第58回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Metagenomic analysis of novel fungi in sewage treatment processes2023

    • 著者名/発表者名
      [13]K. Kubota, S. Robbins, K. Dougan, K. Urasaki, M. Sato, Y.-Y. Li, C.X. Chan, P. Hugenholts
    • 学会等名
      10th IWA Microbial Ecology and Water Engineering Specialist Conference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A novel non-specific staining method for the detection of environmental microorganisms2022

    • 著者名/発表者名
      Kampachiro Urasaki, Yu-You Li, Kengo Kubota
    • 学会等名
      18th International Symposium on Microbial Ecology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] X線検出を想定した微生物へのフッ素/臭素の特異的標識手法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      浦崎幹八郎、李玉友、久保田健吾
    • 学会等名
      第35回微生物生態学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] PET原料製造廃水処理汚泥に優占する門レベル未培養系統群の代謝ポテンシャル2022

    • 著者名/発表者名
      前田稜太, 浦崎幹八郎, 久保田健吾, 野口太郎, 成廣隆, 黒田恭平
    • 学会等名
      第25回日本水環境学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 嫌気性廃水処理汚泥に優占する門レベル未培養系統群の代謝機能推定2022

    • 著者名/発表者名
      前田稜太, 浦崎幹八郎, 久保田健吾, 野口太郎, 成廣隆, 黒田恭平
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第35回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] PET原料製造廃水処理UASB反応器に優占する門レベル未培養系統群の実態解明2022

    • 著者名/発表者名
      前田稜太, 浦崎幹八郎, 久保田健吾, 野口太郎, 成廣隆, 黒田恭平
    • 学会等名
      第57回日本水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Heminを用いた微生物の新規全菌染色手法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      浦崎幹八郎、李玉友 久保田健吾
    • 学会等名
      第24回日本水環境学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Development of a BrISH for environmental microorganisms2021

    • 著者名/発表者名
      Kampachiro Urasaki, Yu-You Li, Kengo Kubota
    • 学会等名
      The 9th International Symposium on Water Environment Systems ----- with Perspective of Global Safety―
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-12-25  

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