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空間記憶に関連した海馬細胞の発火特性と遺伝子発現プロファイルの解析

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0316
補助金の研究課題番号 22J22779 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分48020:生理学関連
研究機関東北大学

研究代表者

柳下 晴也  東北大学, 薬学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2024年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2023年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2022年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードjuxtacellular記録 / 単一細胞遺伝子発現解析 / Sharp wave ripple / 海馬 / 記憶 / 電気生理学 / SWR
研究開始時の研究の概要

脳の領域の1つである海馬は動物の空間記憶を担い、適切な行動を実行するために重要な領域である。海馬には場所や時間などを表現する様々な細胞が存在し、これが特徴的なパターンをもって活動することが空間記憶に重要である。しかし、こうした多様な細胞の性質が分子生物学的にどのようなメカニズムをもつかは未解明である。本研究では新たにin vivo生理計測を適用した神経細胞を可視化、回収する技術を確立し、神経細胞の生理計測法と遺伝子発現プロファイル解析法を融合した新規の手法(Spike-seq法)を開発する。これにより、動物の空間記憶を担う海馬神経細胞の分子基盤を明らかとし、記憶や空間認知メカニズムを解明する。

研究実績の概要

本年度は、昨年度に確立したSpike-seq法を用いて、ウレタン麻酔下の背側海馬CA1野神経細胞の発火活動とその細胞の単一細胞遺伝子発現プロファイルの関連を解析した。Spike-seq法は、in vivo条件で電気生理学的に発火活動を記録した神経細胞のもつ遺伝子発現プロファイルを、単一細胞RNAシーケンス解析により網羅的に解析する手法である。回収した48細胞のサンプルのうち、電気生理データと遺伝子発現データ双方で十分なクオリティであった海馬CA1野興奮性錐体細胞40細胞について複数の解析を行った。
まず、海馬の基本的な発火パターンと関連した遺伝子の探索を行った。その結果、短い時間に連続して発火する細胞では、エネルギー産生にかかわるATP5ファミリー遺伝子が一貫して高い発現を示すことを見いだした。また、神経細胞の脱分極の速度が、特定の電位依存性ナトリウムチャネル調節因子(SlmapとScn2b)の発現量と有意に相関していることを示した。
さらに、記憶の固定化に重要な脳波であるsharp-wave ripple (SWR)に着目した解析を実施した。本研究課題の特色である電気生理記録データと遺伝子発現データを関連付けた解析により、SWR中に発火しやすい細胞と発火しにくい細胞の間で有意に発現変動する数百の遺伝子セットを同定した。さらに、この遺伝子セットの中から1つのカリウムチャネルに着目し、その機能を詳細に解明するための実験アプローチを確立した。具体的には、このカリウムチャネルの発現を抑制するプラスミドベクターを作製した。作製したプラスミドベクターは、子宮内電気穿孔法により海馬CA1興奮性錐体細胞特異的に導入でき、生体内でカリウムチャネルの発現を抑制できることを確認した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本年度前半は、昨年度確立したSpike-seq法を用いることで、記憶に関連するシャープウェーブリップル(SWR)中の発火活動に関連する遺伝子の探索を行った。40細胞のSWR中の発火活動と遺伝子発現データから、SWR中の発火しやすさと相関する遺伝子セットを見出した。また、本年度の後半では見出した遺伝子がSWR中の発火活動に与える影響を検証する実験系を確立した。検証実験は候補遺伝子の発現を低下させたマウスを用いて行う。そのため、遺伝子導入実験により候補遺伝子の発現を低下させるマウスを用いる実験系と、Cre依存的に標的遺伝子を欠損させたマウスを用いる実験系を立ち上げた。追加で、これら2種類のマウスを用いた検証実験や、見出した遺伝子の機能を探る行動試験の検討を進めた。
当初の研究計画では、本年度は記憶に関連する海馬神経細胞の発火活動と関連する候補遺伝子を見出し、その発現を操作した検証実験系を立ち上げることを目標としていた。本年度はこれに加えて次年度に実施する予定であった行動実験の検討も行うことができた。さらに、国際学会や査読付き論文として研究内容を発表できたことから、本年度は研究計画を上回る研究の進展があり、最終年度の来年もさらなる進展が期待できると判断した。

今後の研究の推進方策

Spike-seq法により見出したSWR中の発火活動と関連して発現しているカリウムチャネルの機能を検証する。
まず初めに、見出したカリウムチャネルの発現量を抑制した細胞で、SWR中の発火活動がどう変化するかを検討する。昨年度構築した、標的遺伝子の遺伝子を抑制しつつ、その細胞にGFPを発現させるプラスミドベクターを用いる。子宮内電気穿孔法を用いて海馬CA1興奮細胞特異的にカリウムチャネル発現抑制プラスミドベクターを導入する。これにより、標的遺伝子の発現を抑制した細胞のみにGFPが発現するマウスを作成できる。本動物を用いてjuxtacellular記録を行うことで、カリウムチャネルの発現を抑制した細胞とそうでない細胞の間でSWR中の発火活動がどう異なるかを検討できる。
さらに、Cre依存的に標的遺伝子が欠損するcKOマウスを用いて、標的遺伝子が生体における記憶形成にどのような影響を与えるかを検討する。行動試験には新奇物体認識試験を利用する予定である。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] A method to analyze gene expression profiles from hippocampal neurons electrophysiologically recorded in vivo2024

    • 著者名/発表者名
      Yagishita Haruya、Go Yasuhiro、Okamoto Kazuki、Arimura Nariko、Ikegaya Yuji、Sasaki Takuya
    • 雑誌名

      Frontiers in Neuroscience

      巻: 18 ページ: 1360432-1360432

    • DOI

      10.3389/fnins.2024.1360432

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Neuronal DSCAM regulates the peri-synaptic localization of GLAST in Bergmann glia for functional synapse formation2024

    • 著者名/発表者名
      Dewa Ken-ichi、Arimura Nariko、Kakegawa Wataru et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 15 号: 1 ページ: 458-458

    • DOI

      10.1038/s41467-023-44579-z

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hippocampal sharp wave ripples underlie stress susceptibility in male mice2023

    • 著者名/発表者名
      Kuga Nahoko、Nakayama Ryota、Morikawa Shota、Yagishita Haruya、Konno Daichi、Shiozaki Hiromi、Honjoya Natsumi、Ikegaya Yuji、Sasaki Takuya
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 2105-2105

    • DOI

      10.1038/s41467-023-37736-x

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effects of novelty and temporal distance on post-experience reactivation of hippocampal place cells encoding multiple environments2023

    • 著者名/発表者名
      Yokoi Taiki、Shikano Yu、Yagishita Haruya、Ikegaya Yuji、Sasaki Takuya
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2023.12.17.572075

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] GENE EXPRESSIONS RELATED TO HIPPOCAMPAL RIPPLES2024

    • 著者名/発表者名
      Yagishita H, Okamoto K, Go Y, Arimura N, Ikegaya Y, Sasaki T
    • 学会等名
      FENS Forum 2024
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 海馬神経細胞のin vivo発火特性と関連して発現する遺伝子の探索2023

    • 著者名/発表者名
      柳下 晴也、岡本 和樹、郷 康広、有村 奈利子、池谷 裕二、佐々木 拓哉
    • 学会等名
      第29回海馬と高次機能学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 複数の環境を符号化した海馬 CA3 野及び CA1 野 place cell の経験後における再活性化2023

    • 著者名/発表者名
      横井太紀、鹿野悠、柳下晴也、池谷裕二、佐々木拓哉
    • 学会等名
      第29回海馬と高次機能学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 海馬シャープウェーブリップルと関連して発火する海馬神経細胞の遺伝子発現解析2023

    • 著者名/発表者名
      柳下晴也、岡本和樹、郷康広、池谷裕二、佐々木拓哉
    • 学会等名
      第46回神経科学大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 複数の空間記憶を符号化する海馬場所細胞の経験後における再活性化2023

    • 著者名/発表者名
      横井太紀、鹿野悠、柳下晴也、池谷裕二、佐々木拓哉
    • 学会等名
      第46回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] A method to analyze gene expression profiles of a hippocampal neuron recorded from head-fixed mice2023

    • 著者名/発表者名
      Yagishita H, Okamoto K, Go Y, Arimura N, Ikegaya Y, Sasaki T
    • 学会等名
      Society for Neuroscience (Washington, D.C.)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Post-experience reactivation of hippocampal CA1 and CA3 place cells encoding multiple environments2023

    • 著者名/発表者名
      Yokoi T, Shikano Y, Yagishita H, Ikegaya Y, Sasaki T
    • 学会等名
      Society for Neuroscience (Washington, D.C.)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 海馬のリップル波がストレス感受性に関与する2023

    • 著者名/発表者名
      久我奈穂子、中山亮太、森川勝太、柳下晴也、紺野大地、塩崎裕美、本庄谷夏摘、池谷裕二、佐々木拓哉
    • 学会等名
      第46回神経科学大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] A method to analyze gene expression profiles of a hippocampal neuron recorded from head-fixed mice2023

    • 著者名/発表者名
      柳下晴也、岡本和樹、郷康広、池谷裕二、佐々木拓哉
    • 学会等名
      生理研記憶研究会2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Gene expression profiles in neurons recorded by in vivo extracellular recordings2022

    • 著者名/発表者名
      柳下晴也、岡本和樹、郷康広、池谷裕二、佐々木拓哉
    • 学会等名
      NEURO2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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