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共生型ウイルスの真の多様性をキノコで解く

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0440
補助金の研究課題番号 22J40078 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
研究機関筑波大学

研究代表者

趙 彦杰  筑波大学, 生命環境系, 特別研究員(RPD)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードきのこ、菌株、持続型ウイルス / マイコウイルス / きのこ / 環境ウイルス
研究開始時の研究の概要

生物は周囲の生物とともに、「生態系」というシステムの中で生きている。その生態系には動物、植物、微生物が主要な構成因子と考えられているが、近年の研究により、ウイルスが地球上のほぼ全ての生物に共生し、生態系の新たな構成因子と示唆された。さらに、共生型ウイルスは病原性ウイルスよりも自然環境中で優占している可能性が指摘されている。
そこで本研究では、真菌に感染するウイルスのほとんどが共生型であることに着目し、野外で取得したキノコの子実体を直接解析することで、培養の影響を受けていない天然のウイルス叢を明らかにし、生態系における「宿主とリンクした共生型ウイルス」の真の多様性に迫る。

研究実績の概要

2022年度はアガロースゲル電気泳動方法 (AGE)およびdsRNA シーケンシング(FLDS法)を組み合わせた方法を用いて、担子菌類のウイルススクリーニングに成功した。今年度は上記確立した方法でチャワンタケ (子嚢菌類)の57分離株からウイルススクリーニングを実施した。その結果、 5株はウイルスを保持することが解明した。さらに、FLDS法を用いて、ウイルス保持株からゲノム配列を取得した。それらのゲノム配列を分子進化学的に解析して、2種の二本鎖RNA(dsRNA)ウイルス(Quadrivirus 1種、Partitivius 1種)、5種のプラスセンス一本鎖RNA(+ssRNA)ウイルス (Mitovirus 3種、Endornavirus 1種、Virgavirus 1種)は全て新種であり、またすべての宿主は初めてマイコウイルスに感染することがわかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では、自然界生態系における「宿主と共生するウイルス」の真の多様性を解明することを目的としている。2023年度は子嚢菌57分離株からウイルススクリーニングより新規ウイルスを発見することに成功した。投稿論文としてデータ発表も行った。

今後の研究の推進方策

2023年度のウイルス探索の結果からスギ黒点枝枯病菌であるStromatinia cryptomeriaeの3株に2株でもStroMV1に感染するが確認出来た。S. cryptomeriaeはサンプリングしやすいの特徴であるため、今後はこの菌種に注目して、環境中におけるウイルスの機能に進む予定である。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Greetings from virologists to mycologists: A review outlining viruses that live in fungi2024

    • 著者名/発表者名
      Urayama Syun-ichi、Zhao Yan-jie、Kuroki Misa、Chiba Yuto、Ninomiya Akihiro、Hagiwara Daisuke
    • 雑誌名

      Mycoscience

      巻: 65 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.47371/mycosci.2023.11.004

    • ISSN
      1340-3540, 1618-2545
    • 年月日
      2024-01-31
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Seven new mycoviruses identified from isolated ascomycetous macrofungi2024

    • 著者名/発表者名
      Zhao YJ, Hosoya T, Urayama S, Hagiwara D
    • 雑誌名

      Virus Research

      巻: 339 ページ: 199290-199290

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2023.199290

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of novel RNA mycoviruses from wild mushroom isolates in Japan2023

    • 著者名/発表者名
      Zhao, Y., T. Shirouzu, Y. Chiba, K. Hosaka, H. Moriyama, S. Urayama and D. Hagiwara
    • 雑誌名

      Virus Research

      巻: 325 ページ: 199045-199045

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2023.199045

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Eukaryotic Microbial RNA Viruses—Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem2022

    • 著者名/発表者名
      Urayama Syun-ichi、Takaki Yoshihiro、Chiba Yuto、Zhao Yanjie、Kuroki Misa、Hagiwara Daisuke、Nunoura Takuro
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 37 号: 5 ページ: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME22034

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 子嚢菌分離株からRNAマイコウイルスの検出について2023

    • 著者名/発表者名
      趙彦杰, 細矢剛, 浦山俊一, 萩原大祐
    • 学会等名
      日本菌学会第67回年次大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 野生キノコの分離株から新たに検出できたRNAマイコウイルスの同定について2022

    • 著者名/発表者名
      趙彦杰, 白水貴, 千葉悠斗, 保坂健太郎, 森山裕充, 浦山俊一, 萩原大祐
    • 学会等名
      第66回日本菌学会年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 土壌環境における宿主とリンクした持続型RNAウイルスの研究基盤構築2022

    • 著者名/発表者名
      趙彦杰, 浦山俊一, 萩原大祐
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第34回年度学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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