| 研究課題/領域番号 |
22KJ0490
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| 補助金の研究課題番号 |
22J40062 (2022)
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 基金 (2023)
補助金 (2022) |
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| 応募区分 | 国内 |
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| 審査区分 |
小区分45030:多様性生物学および分類学関連
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| 研究機関 | 千葉大学 |
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研究代表者 |
片山 なつ 千葉大学, 理学研究院, 特別研究員(RPD)
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| 研究期間 (年度) |
2023-03-08 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
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| キーワード | 分子進化速度 / 被子植物 / 生態的特性 / 突然変異率 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では、被子植物全体において分子進化速度の変更パターンと生態的特性との関連性を解明することで、植物の多様化メカニズムの一端を理解する。
1.植物の大規模系統解析データセットを用いて、被子植物全体における分子進化速度の多様性を俯瞰し、分子進化速度の変更パターンを明らかにする。
2.さまざまな生態的特性（生活様式、生息環境、繁殖様式など）と分子進化速度との関連性を解明する。
3.被子植物の平均的な分子進化速度と選択圧の軸を作成し、各生態の特殊化において分子進化速度の多様性が生じた歴史を理解する。
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| 研究実績の概要 |
本研究は、被子植物全体において、分子進化速度の変更パターンと生態的特性との関連性を解明することを目的としている。第一年度は、本解析のベースとなる被子植物大規模系統情報と生態的形態的表現型データセットの取得と整備をおこなった。被子植物の大規模系系統情報については、Zanne et al. (2014)と1KP (2019)、Ramirez-Barahona et al. (2020)の系統解析データを取得し解析を進めている。表現型データセットについては、Zanne et al. (2014)とRamirez-Barahona et al. (2020)が使用している形質データに加え、TRY Plant Trait データベースに公開されているデータを使用することとした。系統解析で使用された種とTRY Plant Trait データベースに形質が登録されている種が一致しないことが多いため、使用する形態データの選別に加え、種レベルではなく属レベルでの解析が可能かを検討している。その結果、種レベルでは３つの系統解析の種数の50%以上をカバーするTRY trait 形質データはいずれの系統解析についても一桁以下しか得ることができなかったが、属レベルでは1KP (2019)については39形質得ることができた。また、TRY Plant Trait データベースは、公開されている多数のデータベースを集約したデータベースであることから、形質データ値の統一を行なっている。第二年度以降、引き続きデータセットを整備し、分子進化速度の変更パターンと生態的特性との関連性の解析を実施する。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
第一年度は、予定通り、本解析のベースとなる被子植物大規模系統情報と生態的形態的表現型データセットの取得と整備をおこなった。被子植物の大規模系系統情報については、Zanne et al. (2014)と1KP (2019)、Ramirez-Barahona et al. (2020)の系統解析データ、生態形質データについてはTRY Plant Trait データベースに公開されているデータを使用することとした。これまでに、３つの系統解析のデータとTRY trait 形質データの統合を進めることができた。
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| 今後の研究の推進方策 |
被子植物の大規模系系統情報（Zanne et al. (2014)と1KP (2019)、Ramirez-Barahona et al. (2020)）と表現型データセット（TRY Plant Trait データベース）の種が一致しないため、種レベルに加えて属レベル、あるいは科レベルでの解析を進める。
また、TRY Plant Trait データベースの形質データ値の統一を行なっている。引き続きデータセットを整備し、分子進化速度の変更パターンと生態的特性との関連性の解析を実施する。
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