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節外性リンパ腫における腫瘍細胞と微小環境の多様性の包括的探索

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0622
補助金の研究課題番号 21J21338 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分50010:腫瘍生物学関連
研究機関東京大学

研究代表者

湯淺 光博  東京大学, 大学院医学系研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード節外性び慢性大細胞型B細胞性リンパ腫 / 腫瘍微小環境 / 節外性リンパ腫
研究開始時の研究の概要

節外性リンパ腫の不均一性と腫瘍微小環境の多様性を単一細胞レベルで解析し、その意義を明らかにすることを目的とする。節外性リンパ腫の臨床検体を対象に、CITE-seq技術を用いて、多数の表面マーカー解析とトランスクリプトーム解析・TCR/BCRレパトア解析を行う。得られたデータを用いて、腫瘍細胞自体の多様性と腫瘍微小環境の網羅的探索を行う。また、臨床データや予後との関連について解析を行い、同定された特徴の臨床的意義を解明する。

研究実績の概要

節外性DLBCL(中枢神経原発び慢性大細胞型B細胞性リンパ腫)に対して, 臨床検体を用いたシングルセル解析を行なった。シングルセルRNA-seq・CITE-seq解析にTCR/BCRレパトア解析を組み合わせることで, 腫瘍細胞及び非腫瘍細胞の同定を行った。腫瘍細胞は, BCRレパトア解析によりクローン性増殖を示すことを確認した。また, 腫瘍細胞は, その変異解析に基づく細胞起源に依って, 正常B細胞とは異なる特徴的な発現プロファイルを示していることを確認した。非腫瘍細胞分画においては, 固形癌において近年整備されたT/NK/Myeloidの各細胞アトラスとの詳細な比較検討を行い, 多彩な細胞分画を同定した。特にT細胞においては、節外性DLBCLは, 反応性リンパ節とは異なるT細胞分画を有しており, 疲弊したCD8T及び細胞周期が亢進したCD8Tが, クローン拡大を伴って増加していることを明らかにした。また腫瘍微小環境に特徴的な制御性T細胞の増加も確認した。
節外性DLBCLマウスモデルを用いて, 腫瘍微小環境に作用する治療法が有用であることを明らかにした。
更に腫瘍細胞の変異解析により同定された腫瘍細胞の遺伝子変異パターンによっては, 細胞障害性を有するNK細胞が豊富に見られることを明らかにした。節外性DLBCLにおいて, 腫瘍細胞と腫瘍微小環境が密接に関連しあっていることを明らかにした。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Inter- and intra-tumor heterogeneity of genetic and immune profiles in inherited renal cell carcinoma2023

    • 著者名/発表者名
      Tabata Mariko、Sato Yusuke、Kogure Yasunori、McClure Marni B.、Oshikawa-Kumade Yuji、Saito Yuki、Shingaki Sumito、Ito Yuta、Yuasa Mitsuhiro、Koya Junji、Yoshida Kazushi、Kohno Takashi、Miyama Yu、Morikawa Teppei、Chiba Kenichi、Okada Ai、Ogawa Seishi、Ushiku Tetsuo、Shiraishi Yuichi、Kume Haruki、Kataoka Keisuke
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42 号: 7 ページ: 112736-112736

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112736

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tumor-promoting function and regulatory landscape of PD-L2 in B-cell lymphoma2022

    • 著者名/発表者名
      Shingaki S、Koya J、Yuasa M、Saito Y、Tabata M、McClure MB、Ogawa S、Katayama K、Togashi Y、Imoto S、Kogure Y、Kataoka K
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 37 号: 2 ページ: 492-496

    • DOI

      10.1038/s41375-022-01772-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-Cell Analysis of the Multicellular Ecosystem in Viral Carcinogenesis by HTLV-12021

    • 著者名/発表者名
      Koya J, Saito Y, Kameda T, Kogure Y, Yuasa M, Nagasaki J, McClure MB, Shingaki S, Tabata M, Tahira Y, Akizuki K, Kamiunten A, Sekine M, Shide K, Kubuki Y, Hidaka T, Kitanaka A, Nakano N, Utsunomiya A, Togashi Y, Ogawa S, Shimoda K, Kataoka K
    • 雑誌名

      Blood Cancer Discovery

      巻: 2 号: 5 ページ: 450-467

    • DOI

      10.1158/2643-3230.bcd-21-0044

    • NAID

      120007145001

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] A single-cell transcriptome and surface proteome analysis of the tumor and immune microenvironment in DLBCL2022

    • 著者名/発表者名
      湯淺 光博
    • 学会等名
      第84回日本血液学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] A single-cell transcriptome and surface proteome analysis of the tumor and immune microenvironment in DLBCL2022

    • 著者名/発表者名
      湯淺 光博
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Different post-transcriptional regulation of surface markers across cell types revealed by CITE-seq2021

    • 著者名/発表者名
      湯淺 光博
    • 学会等名
      第83回日本血液学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-12-25  

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