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がん抑制蛋白質PRELPの多重特異的相互作用に基づく腫瘍抑制機構の解明と分子設計

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0925
補助金の研究課題番号 22J13974 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関東京大学

研究代表者

小菅 啓史  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2023年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2022年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード多重特異性 / 蛋白質間相互作用 / シグナル伝達 / がん抑制蛋白質 / 蛋白質工学 / 計算科学 / 速度論 / 細胞接着
研究開始時の研究の概要

医薬品開発において、複数の標的分子に対して多重特異的に相互作用するmulti-target drugが注目されつつある。本研究では、生体内のがん抑制蛋白質PRELPの多重特異的相互作用を応用した新規抗がん治療薬の設計戦略を提案する。PRELPの相互作用蛋白質を同定し、組換え蛋白質を用いた物理化学的手法によってその相互作用機構を明らかにするとともに、細胞アッセイによってPRELPの多重特異的相互作用に基づく腫瘍抑制機能の創出機構を解明する。これらの知見をもとにPRELPに対して変異導入を行うことで、複数の相互作用およびシグナル伝達を同時に制御することができる機能蛋白質をデザインする。

研究実績の概要

本研究では、がん抑制蛋白質PRELPの多重特異的相互作用の分子機構とそれに基づく腫瘍抑制メカニズムを明らかにし、PRELPの多重特異性を応用した新規抗がん治療薬の設計戦略を提案することを目的として研究を実施した。前年度までにPRELPの多重特異的な標的結合を介して細胞接着分子の発現が変動し、がん細胞の増殖が抑制されることが示唆されている。さらに本年度においてはPRELPによるシグナル伝達制御の解析を実施し、組換えPRELP蛋白質をA549肺癌細胞へ添加することによって、がん細胞の増殖に関わるAktのリン酸化が抑制されることが明らかとなった。
また、前年度に得られた知見を踏まえて、野生型とは異なる多重特異性を示すPRELP変異体の設計を実施した。前年度において、PRELPがTGFβ1、IGFI-R、p75NTRに対してロイシンリッチリピート(LRR)ドメイン内の異なる領域を介して結合することが示唆されている。本年度においては、まずPRELPのモデリング構造を用いたSpatial Aggregation Propensity(SAP)計算を行うことでLRRドメインに疎水性領域が存在していることが明らかとなった。その疎水性領域が一部の標的蛋白質との相互作用界面の形成に寄与していると予測し、SAP計算における疎水性スコアが高いアミノ酸残基に対して、Rosettaソフトウェアを用いて構造安定性を損なわないような変異を導入した複数のコンストラクトを設計した。これらの変異体に関して組換え蛋白質を発現・精製して表面プラズモン共鳴法による各標的蛋白質との相互作用解析を行ったところ、TGFβ1に対する親和性が大きく低下する一方でIGFI-Rとp75NTRに対する親和性は野生型と同等であるPRELP変異体の取得に成功し、多重特異性の制御に基づく分子設計戦略の提案へと繋がる結果が得られた。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 3件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University College London(英国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] University College London(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] PRELP secreted from mural cells protects the function of blood brain barrier through regulation of endothelial cell-cell integrity2023

    • 著者名/発表者名
      Davaapil Hongorzul、Hopkins Jack、Bonnin Nadia、Papadaki Vasiliki、Leung Alex、Kosuge Hirofumi、Tashima Takumi、Nakakido Makoto、Sekido Ryohei、Tsumoto Kouhei、Sagoo Mandeep S.、Ohnuma Shin-Ichi
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 11 ページ: 1147625-1147625

    • DOI

      10.3389/fcell.2023.1147625

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] PRELP Regulates Cell-Cell Adhesion and EMT and Inhibits Retinoblastoma Progression2022

    • 著者名/発表者名
      Hopkins Jack、Asada Ken、Leung Alex、Papadaki Vasiliki、Davaapil Hongorzul、Morrison Matthew、Orita Tomoko、Sekido Ryohei、Kosuge Hirofumi、Reddy M. Ashwin、Kimura Kazuhiro、Mitani Akihisa、Tsumoto Kouhei、Hamamoto Ryuji、Sagoo Mandeep S.、Ohnuma Shin-ichi
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 14 号: 19 ページ: 4926-4926

    • DOI

      10.3390/cancers14194926

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Repression of the PRELP gene is relieved by histone deacetylase inhibitors through acetylation of histone H2B lysine 5 in bladder cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Shozu Kanto、Kaneko Syuzo、Shinkai Norio、Dozen Ai、Kosuge Hirofumi、Nakakido Makoto、Machino Hidenori、Takasawa Ken、Asada Ken、Komatsu Masaaki、Tsumoto Kouhei、Ohnuma Shin-Ichi、Hamamoto Ryuji
    • 雑誌名

      Clinical Epigenetics

      巻: 14 号: 1 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1186/s13148-022-01370-z

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biophysical Characterization of the Contribution of the Fab Region to the IgG-FcγRIIIa Interaction2022

    • 著者名/発表者名
      Kosuge Hirofumi、Nagatoishi Satoru、Kiyoshi Masato、Ishii-Watabe Akiko、Terao Yosuke、Ide Teruhiko、Tsumoto Kouhei
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 62 号: 2 ページ: 262-269

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.1c00832

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Characterization of modulation system of multi-specific interactions of PRELP with intrinsically weak affinity through ECM localization2023

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Kosuge, Makoto Nakakido, Susana de Vega, Satoru Nagatoishi, Tetsuya Fukuda, Yasuhiko Bando, Shin-ichi Ohnuma, Kouhei Tsumoto
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 細胞外マトリクスへの局在を介した多重特異性蛋白質PRELPの弱い相互作用の制御機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      小菅 啓史、中木戸 誠、Susana de Vega、長門石 曉、福田 哲也、板東 泰彦、大沼 信一、津本 浩平
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Monomer-Dimer Equilibrium of a Tumor Suppressor PRELP Driven by the Hydrophobic Interface Regulates the Multi-Specific Interactions2022

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Kosuge, Makoto Nakakido, Satoru Nagatoishi, Tetsuya Fukuda, Yasuhiko Bando, Shin-ichi Ohnuma, Kouhei Tsumoto
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Identification and validation of multi-specific interactions of a tumor suppressor protein PRELP2022

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Kosuge, Makoto Nakakido, Satoru Nagatoishi, Tetsuya Fukuda, Yasuhiko Bando, Shin-ichi Ohnuma, Kouhei Tsumoto
    • 学会等名
      The 17th International Symposium of the Institute Network for Biomedical Sciences & International Symposium on Tumor Biology in Kanazawa 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 津本研究室ホームページ

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/phys-biochem/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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