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マラリア原虫の新規アルテミシニン強耐性株の解析と耐性遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1203
補助金の研究課題番号 22J12522 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分49040:寄生虫学関連
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

窪田 理恵  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2023年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2022年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードマラリア原虫 / アルテミシニン / 薬剤耐性 / 熱帯熱マラリア原虫
研究開始時の研究の概要

現在、熱帯熱マラリア原虫の治療で広く使用されている抗マラリア薬であるアルテミシニンは、Kelch13遺伝子の変異によって耐性を獲得することが明らかとなっている。本研究では、Kelch13遺伝子の変異をもたないアルテミシニン耐性を示す臨床分離株を樹立することに成功したため、性状解析ならびに遺伝学的手法を用いて新規アルテミシニン耐性遺伝子の同定を行う。本研究成果は、アルテミシニン耐性機構の全貌解明を目的とする。

研究実績の概要

マラリアの治療薬であるアルテミシニンの耐性遺伝子が同定されたが、いまだにアルテミシニンを用いたマラリア治療に難渋する例が多数報告され、アルテミシニン耐性をめぐる状況が混沌としている。本研究は、タイのマラリア流行地のフィールドワークによって分離した既知アルテミシン耐性遺伝子変異(Kelch13変異)をもたないアルテミシニン耐性株Thai-R株を対象として、新規アルテミシニン耐性遺伝子の同定を目的とした。本年度は、ショートリードシーケンサーとロングリードシーケンサーを組み合わせたハイブリッドシーケンスによって、Thai-R株の全ゲノム塩基配列を決定し、一塩基多型解析およびコピー数多型解析を行った。その結果、制御領域を含めたKelch13遺伝子領域全体に渡って塩基置換は認められず、他の抗マラリア薬の耐性に関連する既知の遺伝子に、変異あるいはコピー数が上昇していたことから、多剤耐性株であることがゲノム解析からも明らかになった。
続いて、Thai-R株の新規薬剤耐性遺伝子同定のために、マラリア原虫人工染色体を用いたゲノムDNAスクリーニングを実施した。断片化Thai-R株ゲノムDNAを組み込んだ人工染色体プラスミドを作出し、アルテミシニン高感受性株へ遺伝子導入を行うことで、Thai-Rゲノムをランダムに保持する原虫集団(ライブラリー)を作出した。本年度は遺伝子導入を繰り返した結果、遺伝子領域全体の50%を超えるゲノムカバレッジを持つライブラリーが構築できた。続いてこのライブラリーに薬剤処理を行い、薬剤抵抗性と関連するThai-R株ゲノムDNAを保持する原虫の選択を試みた。その結果、アルテミシニンおよびルメファントリンに対して、わずかに抵抗性の上昇と関連する原虫集団を選択し、抵抗性の上昇と関連する遺伝子リストを作成した。これらの遺伝子は薬剤耐性に関連する遺伝子群であることが予想された。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [雑誌論文] Genome-wide functional screening of drug-resistance genes in Plasmodium falciparum2022

    • 著者名/発表者名
      Iwanaga Shiroh、Kubota Rie、Nishi Tsubasa、Kamchonwongpaisan Sumalee、Srichairatanakool Somdet、Shinzawa Naoaki、Syafruddin Din、Yuda Masao、Uthaipibull Chairat
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41467-022-33804-w

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation of the Effect of Gene Duplication by Genome Editing on Drug Resistance in Plasmodium falciparum2022

    • 著者名/発表者名
      Kubota Rie、Ishino Tomoko、Iwanaga Shiroh、Shinzawa Naoaki
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 12

    • DOI

      10.3389/fcimb.2022.915656

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 新規ビオチン化酵素AirIDを用いた近位依存性ビオチン標識法によるRON4相互作用分子の同定2024

    • 著者名/発表者名
      新澤直明,窪田理恵,関根崇,ADDO GYAN DANIEL KWEKU,小迫英尊,澤崎達也,石野智子
    • 学会等名
      第93回日本寄生虫学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 新規ビオチン化酵素AirIDを用いたマラリア原虫のタンパク質インタラクトーム解析2023

    • 著者名/発表者名
      窪田理恵,関根崇,ADDO GYAN DANIEL KWEKU,小迫英尊,澤崎達也,新澤直明,石野智子
    • 学会等名
      第92回日本寄生虫学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 新規ビオチン化酵素AirIDによるマラリア原虫のタンパク質相互作用解析2022

    • 著者名/発表者名
      窪田理恵
    • 学会等名
      第28回分子寄生虫学ワークショップ
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation of the Effect of Gene Duplication by Genome Editing on Drug Resistance in Plasmodium falciparum2022

    • 著者名/発表者名
      Rie Kubota, Tomoko Ishino, Shiroh Iwanaga, Naoaki Shinzawa
    • 学会等名
      The 20th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会・シンポジウム開催] The 20th Awaji International Forum on Infection and Immunity2022

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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