• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

三次元骨格を基盤としたペプチド模倣分子の開発とPPI阻害剤への展開

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1298
補助金の研究課題番号 22J10875 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
研究機関東京工業大学

研究代表者

梅寺 倖平  東京工業大学, 生命理工学院, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワード三次元骨格 / ケミカルスペース / ペプチド模倣分子
研究開始時の研究の概要

酵素や受容体の基質結合部位を標的とした低分子医薬品は、芳香族化合物を基盤として開発されてきており、直線的・平面的な分子構造に偏っている。近年、注目を集めるタンパク質間相互作用阻害剤の開発においては、より複雑な置換基配置を可能にする母骨格の開発が望まれる。本研究では、芳香族化合物に代わり、三次元性の高い複雑な医薬品母骨格を開発し、複雑な置換地配置を可能にすることを目指す。さらには、タンパク質間相互作用面におけるペプチドの結合様式の模倣を可能とすることで、低分子阻害剤の創出に挑戦する。

研究実績の概要

本研究は、芳香族化合物を脱却した分子設計により、低分子医薬品のケミカルスペースの拡大を目的とした。従来の低分子医薬品は、芳香族化合物を母骨格として開発されてきており、その構造は直線的で平面的なものに偏っている。分子の構造的特徴の偏りは、低分子医薬品の創薬標的を酵素や受容体に制限する一因となっている。タンパク質間相互作用を始めとする新たな創薬標的に対する低分子医薬品の開発を目指すため、より三次元性の高い骨格に基づく分子設計が求められる。三次元性の高い骨格の中でも、架橋構造をもつ籠型骨格は、分子の立体配座が固定されることで標的選択的な分子設計が期待でき、特に医薬品設計において有用であると考えられる。また、オキソピペラジン骨格は多様な天然物に含まれることから、生物活性分子の創出に有用であるが、その籠型骨格については、医薬品設計への応用が十分に検討されていない。本研究では、籠型のオキソピペラジン骨格を新たに開発し、ペプチド模倣分子の設計へと応用することで、低分子タンパク質間阻害剤の開発を目指した。
本年度においては、医薬品開発に有用な籠型オキソピペラジン骨格の開発を目指した。医薬品開発においては、母骨格構造を固定し、部分構造を改変していくことで、活性や物性の改善を図る。そこで、三つの置換基の導入を可能にする籠型オキソピペラジン骨格の開発に取り組んだ。開発した籠型骨格は、アミノ酸を出発原料とすることで不斉合成が達成された。そして、得られた籠型骨格に、アミノ酸側鎖を模倣した置換基構造を導入することで、ペプチド模倣分子の設計を行った。しかしながら、設計したペプチド模倣分子は、顕著な生物活性を示さなかったことから、さらなる構造変換が要求される。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] ボン大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] DeepCubist: Molecular Generator for Designing Peptidomimetics based on Complex three-dimensional scaffolds2023

    • 著者名/発表者名
      Umedera Kohei、Yoshimori Atsushi、Chen Hengwei、Kouji Hiroyuki、Nakamura Hiroyuki、Bajorath J?rgen
    • 雑誌名

      Journal of Computer-Aided Molecular Design

      巻: 37 号: 2 ページ: 107-115

    • DOI

      10.1007/s10822-022-00493-y

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Asymmetric construction of densely functionalized three-dimensional aza-tetracyclic scaffolds for drug discovery2022

    • 著者名/発表者名
      Umedera Kohei、Morita Taiki、Nakamura Hiroyuki
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 58 号: 98 ページ: 13592-13595

    • DOI

      10.1039/d2cc05700j

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design of MMP-1 inhibitors via SAR transfer and experimental validation2022

    • 著者名/発表者名
      Umedera Kohei、Yoshimori Atsushi、Bajorath J?rgen、Nakamura Hiroyuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 20915-20915

    • DOI

      10.1038/s41598-022-25079-4

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] DeepCubist: Molecular generator for designing peptidomimetics2023

    • 著者名/発表者名
      梅寺倖平
    • 学会等名
      The 28th International SPACC Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] SAR転移によるMMP-1阻害剤の設計と実験的実証2023

    • 著者名/発表者名
      梅寺倖平
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi