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集合力トポロジー制御を基軸としたシンプルなタンパク質集合構造設計

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1304
補助金の研究課題番号 22J13116 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関東京工業大学

研究代表者

菊池 幸祐  東京工業大学, 生命理工学院, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2023年度: 200千円 (直接経費: 200千円)
2022年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード自己集合設計 / タンパク質エンジニアリング / タンパク質分子針 / 高速原子間力顕微鏡 / モンテカルロシミュレーション / セルロースナノ結晶 / 構造色フィルム / ハイブリッド材料 / タンパク質集合体 / HS-AFM / 動的挙動 / 一分子観察 / 構造色 / 超分子化学
研究開始時の研究の概要

本研究ではタンパク質の集合化を駆動する相互作用配置を「集合力トポロジー」と定義し,その制御による自在なタンパク質ナノ集合構造制御や構造色フィルム物性制御を目指す.
そこで、研究期間内に以下の達成を目指す.
(1)タンパク質分子針を骨格とした三次元ピラミッド構造設計
(2)タンパク質分子針の群れ運動制御
(3)合成高分子との複合による液晶材料開発

研究実績の概要

タンパク質集合体は生体適合性と機能性から次世代超分子材料として期待されており,近年ではタンパク質工学や計算科学にもとづく集合構造の人工設計がさかんにおこなわれてきた.しかし,タンパク質の複雑な集合化反応を動的挙動にもとづき制御する指針は確立されていない.そこで本研究では,分子周りにおける,集合化を駆動する相互作用の配置を「集合力トポロジー」と定義し,その制御による,(1)二次元集積の設計,および(2)三次元複合化集積による液晶材料創出に挑戦した.
初年度はタンパク質分子針PNが有する異方形状に着目し,それらの自発的な二次元集合化の制御を試みた.PNの相互作用点を考慮したタンパク質を設計・合成し,高速原子間力顕微鏡観察を用いた二次元集合パターンの観察をおこなった.その結果,マイカ基板上特異的な四量体ユニットの形成を確認し,設計した二か所の相互作用点を使い分けたネットワーク状集合体を見出した.これにより,タンパク質のトポロジーを考慮したシンプルな設計による集合体設計が実現可能であることを示した.
最終年度である次年度は,セルロースナノ結晶(CNC)とタンパク質の複合化による構造色材料設計を目指した.ウシ血清アルブミンをはじめとする5種類のタンパク質をモデルとした実験系の確立を試みた.CNCとタンパク質とを混合した構造色フィルムの合成をおこない,光学顕微鏡とUV-Visスペクトル測定によって光学特性の変化を見出した.ここから,タンパク質―CNCハイブリッド系の利用により,自己集合材料の物性制御が実現可能であると提唱した.
以上より,異方形状分子の自己集合制御を実証し,タンパク質分子設計による生体由来ハイブリッド材料の創出への可能性を切り拓いた.

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (5件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of Cambridge(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Design of a Hierarchical Assembly at a Solid Liquid Interface Using an Asymmetric Protein Needle2023

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi Kosuke、Date Koki、Ueno Takafumi
    • 雑誌名

      Langmuir

      巻: 39 号: 6 ページ: 2389-2397

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.2c03146

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Modulating mechanical properties of structurally colored cellulose nanocrystal films by protein hybridization2023

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Kikuchi, Bruno Frka-Petesic, Silvia Vignolini, Takafumi Ueno
    • 学会等名
      第33回バイオ・高分子シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 動的伸縮タンパク質分子リボンR-bodyの組成解明2023

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Kikuchi, Koki Date, Pham Toan Thuc, Takafumi Ueno
    • 学会等名
      第72回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Developing protein-cellulose nanocrystal hybrid films for structural coloration,2023

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Kikuchi, Bruno Frka-Petesic, Silvia Vignolini, Takafumi Ueno
    • 学会等名
      103rd CSJAnnual Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Head-to-head and Tail-to-tail Dual Interactions by Head-tail Asymmetric Protein Needles for Designing Hierarchical Two-dimensional Assembly Networks Head-tail2022

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Kikuchi , Koki Date , Takafumi Ueno
    • 学会等名
      71st Symposium on Macromolecules
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] pH応答性伸縮タンパク質集合体の細胞内形成メカニズム2022

    • 著者名/発表者名
      伊達弘貴 , Thuc Toan Pham , Hyeonho Lee , 菊池幸祐 , 上野隆史
    • 学会等名
      12th CSJ Chemistry Festa
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 上野研究室の大学院生が「日本化学会第 103 春季年会(2023)」で学生講演賞を受賞

    • URL

      https://educ.titech.ac.jp/bio/news/2023_05/064248.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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