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水素結合を駆使したペプチド結晶の構造と電子物性の制御

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1321
補助金の研究課題番号 22J14973 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分28010:ナノ構造化学関連
研究機関東京工業大学

研究代表者

茂田井 和紀  東京工業大学, 物質理工学院, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2023年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2022年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードペプチド / 自己組織化 / 振動分光 / 結晶 / 金属イオン / エレクトロニクス
研究開始時の研究の概要

これまで、自己組織化ペプチドを機能性材料として利用する試みがなされてきた。例えば、Gazit らは2個のアミノ酸からなるジペプチドの自己組織化構造が、触媒・圧電素子・発光素子として機能することを発表した(Tao, Kai, et al. Science 358.6365 (2017): eaam9756.)。ペプチドの応用として、その生体分子との親和性から、バイオセンサの活性層として使用できる可能性がある。
これまでの有機半導体を使用したバイオセンサー開発の知見を活かすことにより、より生体親和型のバイオセンサの実現が可能になると期待できる。

研究実績の概要

ペプチドの自己組織化機構の理解は、生命科学および材料科学の分野にとって極めて重要な課題であり、これによって新しい材料の開発に発展する可能性がある。これまでに、アルツハイマー病の原因として知られるA-βペプチド、肌を構成するコラーゲン、筋肉の伸縮運動を司るアクチンフィラメント、血糖値を調節するインスリンなど、多くの生体分子の自己組織化機構が研究されてきた。中でも、アミロイドβペプチドの研究では、複数のアミロイドβ配列からのフラグメント分子の結晶化および構造解析によって、ペプチドの結晶構造を対称性に基づいて分類し一定の規則性を見出そういう試みがなされてきた。しかしながら、これらのペプチドが形成する結晶構造とアミノ酸配列との間の普遍的な関係は、未だ完全には解明されていない。
本研究では、比較的短い残基数を持つテトラペプチドを用いて、ペプチドの自己組織化プロセスを理解することを目的とした。フェニルアラニンとグルタミン酸を含むテトラペプチドの配列を異なる順序で設計し、それらの結晶化を試みた。これより、水素結合ネットワークが部分的にβシート状の構造を形成することにより、ペプチド結晶の成長が促進されることが示された。さらに、ペプチドのアミド結合中のN-Hが、向い合うアミド結合のC=Oと水素結合を形成するだけでなく、グルタミン酸のC=Oとも水素結合を形成し、結果的に分岐した水素結合を形成していることが分かった。これらの結果は、第一原理計算および量子化学計算を用いてさらに検証され、分子レベルでの分子間相互作用の詳細が明らかになった。
また、テトラペプチド中のフェニルアラニンとグルタミン酸の配列組み合わせを変えた3種類のペプチドFEFE、FEEF、FFEEを設計・合成し、結晶化を試みたところ、アミノ酸の配列によって全く異なる水素結合ネットワークや分子間相互作用の様式を形成することが明らかとなった。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Bifurcated Hydrogen Bonds in a Peptide Crystal Unveiled by X-ray Diffraction and Polarized Raman Spectroscopy2023

    • 著者名/発表者名
      K. Motai, N. Koishihara, T. Narimatsu, H. Ohtsu, M. Kawano, Y. Wada, K. Akisawa, K. Okuwaki, T. Mori, J-S. Kim, Y. Mochizuki, and Y. Hayamizu
    • 雑誌名

      Cryst. Growth Des.

      巻: - 号: 6 ページ: 4556-4561

    • DOI

      10.1021/acs.cgd.3c00302

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ラマン分光に見るテトラペプチドと金属イオンの分子間相互作用2023

    • 著者名/発表者名
      茂田井和紀
    • 学会等名
      第84 回応用物理 学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] X線結晶構造解析と角度分解ラマン測定に見たペプチド結晶中の分岐した水素結合の影響2023

    • 著者名/発表者名
      茂田井和紀
    • 学会等名
      2023年度日本結晶学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] テトラペプチドの結晶の配列の順番が与える結晶構造への影響と自己組織化過程の理解2022

    • 著者名/発表者名
      茂田井和紀
    • 学会等名
      日本応用物理学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Hydrogen bond network in a tetrapeptide crystal characterized by X-ray diffraction and Raman spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      茂田井和紀
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Hydrogen bond network in a tetrapeptide crystal characterized by X-ray diffraction and Raman spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Kazunori Motai
    • 学会等名
      Material Research Society
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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