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計量化学分子ネットワークを用いたベトナム産植物由来新規生理活性物質の迅速解析

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1499
補助金の研究課題番号 21J22604 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分40020:木質科学関連
研究機関岐阜大学

研究代表者

各務 裕也  岐阜大学, 連合農学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 採択後辞退 (2023年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード天然物化学 / LC-MS/MS / メタボローム解析 / インフォマティクス / 分子ネットワーク / バイオケモメトリックス / ジテルペノイド / 細胞増殖抑制活性 / 新規生物活性物質 / 構造解析 / 計算化学
研究開始時の研究の概要

タンデム質量分析を基軸とするインフォマティクスを駆使した天然物探索手法を確立し,植物由来新規生理活性物質の迅速な解析を目的とする。本研究では,ベトナム産薬用植物を研究対象として取り上げる。In vitroでの生物活性試験およびLC-MS/MS分析より,パターン認識から活性化合物を推測可能なバイオケモメトリックス解析,および構造的特徴を捉える分子ネットワーク解析を実施する。2つの解析を統合したネットワークから可視化される未知活性化合物を標的とした単離,構造解析により,これまでに見出されてこなかった新規二次代謝産物の発見を目指す。

研究実績の概要

近年著しく進歩しているLC-MS/MSを基盤としたメタボローム解析インフォマティクスを活用する迅速かつ効率的な有用天然物探索手法の構築と,それを利用したベトナム産薬用植物からの新規生物活性物質の発見を目的とした。本手法の確立によって、複雑多様な二次代謝産物を含む天然資源抽出エキスから有用分子をピンポイントで見出すことを可能にする。まず、多変量解析PLS-DAから得られるVIPスコアが生物活性とイオンピークに良好な相関を与えることが報告されていることから、これを分子ネットワーク解析と組み合わせるバイオケモメトリックスとして導入することを検討した。次いで、強力な細胞増殖抑制活性を示したトウダイグサ科植物エキスを対象に、LC-MS/MSデータを用いた分子ネットワーク解析とPLS-DA解析を統合したネットワークを構築、可視化した結果、テルペノイド類に相当するネットワークを構成する複数のクラスターの中でも、1つの未知化合物クラスターと1つの既知化合物クラスターが生物活性に大きく寄与することを見出した。そのうち、未知化合物クラスターを標的として分画を進め、これまでにない6/6/6/5/6/5/7/6/5縮環構造を有する一連の新規ジテルペノイド二量体を効率的に単離、構造決定することに成功した。いずれのジテルペン二量体においても、ヒト急性骨髄性白血病細胞株に対して顕著な細胞増殖抑制作用を示すことを確認し、確立した化合物探索手法の有用性を実証した。また、これら化合物が細胞周期に与える影響も明らかにした。

現在までの達成度 (段落)

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

今後の研究の推進方策

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] ハノイ工科大学(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] ハノイ工科大学(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] 分子ネットワーク解析による新規天然分子の発見2023

    • 著者名/発表者名
      各務裕也、光永徹
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 61 号: 1 ページ: 32-39

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.61.32

    • ISSN
      0453-073X, 1883-6852
    • 年月日
      2023-01-01
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular networking-based discovery of anti-inflammatory chromene dimers from Melicope pteleifolia2022

    • 著者名/発表者名
      Kakumu Yuya、Thi Nguyen Minh Tu、Mitsunaga Tohru
    • 雑誌名

      Phytochemistry

      巻: 202 ページ: 113322-113322

    • DOI

      10.1016/j.phytochem.2022.113322

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 分子ネットワークより見出した新規エクジステロイド-シナピン酸複合体の構造と生物活性2022

    • 著者名/発表者名
      各務 裕也、Nguyen Thi Minh Tu、柴田 貴広、光永 徹、服部 浩之
    • 学会等名
      第66回香料・テルペンおよび精油化学に関する討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 分子ネットワークを用いたベトナム産薬用植物由来新規抗炎症クロメン二量体の発見と構造決定2022

    • 著者名/発表者名
      各務裕也,Nguyen Thi Minh Tu,光永徹
    • 学会等名
      第72回日本木材学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Molecular Networking-based isolation of dimeric chromenes from leaves of Melicope pteleifolia2021

    • 著者名/発表者名
      Yuya Kakumu, Minh Tu Thi Nguyen, Tohru Mitsunaga
    • 学会等名
      The 11th JSP-CSP-KSP Joint Symposium on Pharmacognosy
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-03-26  

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