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抗がん剤応用を志向した環状ピロール-イミダゾールポリアミドの開発と機能評価

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1695
補助金の研究課題番号 21J22276 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
研究機関京都大学

研究代表者

廣瀬 優希  京都大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワードピロール-イミダゾールポリアミド / 環状ピロール-イミダゾールポリアミド / 抗がん剤 / DNAアルキル化剤 / 二本鎖DNA結合性分子 / 環状ペプチド / 遺伝子発現制御 / トリプレットリピート / 細胞透過性
研究開始時の研究の概要

ピロール-イミダゾールポリアミド(PIP)はDNAの塩基配列(A,T,G,C)を特異的に認識して結合する分子である。その高い塩基配列特異性や結合能を活かして、遺伝子発現制御スイッチや蛍光プローブ、抗がん剤としての応用を目指した研究が行われてきた。中でも環状構造を持つPIP(cPIP)は従来のヘアピン型PIPに比べて高い結合能・配列特異性を示すことが知られている。
本研究課題では、がんをはじめとする様々な疾患の治療薬としての応用を目指してcPIPの機能評価・改善を行う。

研究実績の概要

ピロール-イミダゾールポリアミド (PIP) はDNAに塩基配列特異的に結合する分子であり、本研究課題では特に、従来のヘアピン型PIP (hPIP) に比べて高い結合能・特異性を示すことが知られている環状構造を持つPIP (cPIP) の機能評価・改善を行うことを目標としている。これまでの研究で、CAG/CTG反復配列に強く特異的に結合するcPIPが疾患細胞およびモデルマウスで異常遺伝子選択的な発現抑制および病態の改善を示しDNAリピート病の治療薬として応用が期待されている。一方でがん関連転写因子の結合配列を標的としたcPIPがhPIPよりも低い細胞内取り込み効率を示し、それにより細胞内活性が低下していることが示唆された。今年度は前年度に続きこのcPIPの細胞取り込み効率の低さの要因の解明とその改善を目指した。前年度に得られた、cPIPと細胞膜との相互作用様式に関する知見に基づき特定の部位に疎水性修飾を加えたcPIPを合成し、細胞取り込み効率の改善を試みたが改善は見られなかった。一方でエンドソーム脱出促進試薬を用いた実験により、cPIPの細胞内活性の低さが細胞内への取り込み段階ではなくエンドソーム脱出の滞りにより生じていることが示唆された。
上述の研究に加え、今年度は抗がん剤応用を目指したhPIPの機能評価を行った。転写因子RUNXの結合配列を標的としたhPIPにDNAアルキル化剤を導入した化合物についてp53変異を持つすい癌細胞PANC-1に対する活性とその作用機序を評価した。その結果、各化合物によるアポトーシスの誘起や、そのアポトーシス誘起に関連する経路に関するいくつかの知見を得た。さらにRUNXのノックダウンがアポトーシスを誘導することも分かった。これらの結果は論文として報告し、加えてPANC-1と異なるp53変異をもつがん細胞への活性についても論文を投稿した。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 5件) 備考 (3件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] クイーンズランド大学(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural studies of a complex of a CAG/CTG repeat sequence-specific binding molecule and A-A-mismatch-containing DNA2024

    • 著者名/発表者名
      Abe Katsuhiko、Hirose Yuki、Kumagai Tomotaka、Hashiya Kaori、Hidaka Kumi、Emura Tomoko、Bando Toshikazu、Takeda Kazuki、Sugiyama Hiroshi
    • 雑誌名

      JACS Au

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A cyclic pyrrole-imidazole polyamide reduces pathogenic RNA in CAG/CTG triplet repeat neurological disease models2023

    • 著者名/発表者名
      Ikenoshita Susumu、Matsuo Kazuya、Yabuki Yasushi、Kawakubo Kosuke、Asamitsu Sefan、Hori Karin、Usuki Shingo、Hirose Yuki、Bando Toshikazu、Araki Kimi、Ueda Mitsuharu、Sugiyama Hiroshi、Shioda Norifumi
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Investigation

      巻: 133 号: 22

    • DOI

      10.1172/jci164792

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Anticancer Activities of DNA-Alkylating Pyrrole?Imidazole Polyamide Analogs Targeting RUNX Transcription Factors against <i>p53</i>-Mutated Pancreatic Cancer PANC-1 Cells2023

    • 著者名/発表者名
      Hirose Yuki、Sato Shinsuke、Hashiya Kaori、Bando Toshikazu、Sugiyama Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 66 号: 17 ページ: 12059-12068

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.3c00613

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA G-quadruplex organizes stress granule assembly through DNAPTP6 in neurons2023

    • 著者名/発表者名
      Asamitsu Sefan、Yabuki Yasushi、Matsuo Kazuya、Kawasaki Moe、Hirose Yuki、Kashiwazaki Gengo、Chandran Anandhakumar、Bando Toshikazu、Wang Dan Ohtan、Sugiyama Hiroshi、Shioda Norifumi
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 9 号: 8

    • DOI

      10.1126/sciadv.ade2035

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] N-terminal Cationic Modification of Linear Pyrrole-Imidazole Polyamide Improves Its Binding to DNA.2022

    • 著者名/発表者名
      Junnosuke Hatanaka and Yuki Hirose and Kaori Hashiya and Toshikazu Bando and Hiroshi Sugiyama
    • 雑誌名

      Chembiochem : a European journal of chemical biology

      巻: 23 号: 14

    • DOI

      10.1002/cbic.202200124

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Inhibition of GLI-mediated transcription by cyclic pyrrole-imidazole polyamide in cancer stem cells.2022

    • 著者名/発表者名
      V.J. Sahayasheela, Z. Yu, Y. Hirose, Ganesh N. Pandian*, T. Bando and H. Sugiyama
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      巻: - 号: 4 ページ: 693-699

    • DOI

      10.1246/bcsj.20210453

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Strong and Specific Recognition of CAG/CTG Repeat DNA (5’‐dWGCWGCW‐3’) by a Cyclic Pyrrole‐Imidazole Polyamide2021

    • 著者名/発表者名
      Hirose Yuki、Ohno Tomo、Asamitsu Sefan、Hashiya Kaori、Bando Toshikazu、Sugiyama Hiroshi
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 23 号: 2

    • DOI

      10.1002/cbic.202100533

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] RUNX 転写因子の結合配列に特異的な DNA アルキル化剤はすい臓がんに対して抗がん活性を示す2023

    • 著者名/発表者名
      廣瀬優希
    • 学会等名
      生体機能関連化学部会若手の会 第34回サマースクール
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation of Anti-Pancreatic Cancer Activities of DNA-Alkylating Peptides Specific for RUNX-Binding Sequence2023

    • 著者名/発表者名
      Yuki Hirose, Shinsuke Sato, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      13th International Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparing the Properties of DNA Binding Pyrrole-Imidazole Polyamides with Different Structures (Linear versus Cyclic)2023

    • 著者名/発表者名
      廣瀬優希、Huy Hoang、橋谷かおり、板東俊和、杉山弘、David Fairlie
    • 学会等名
      日本化学会 第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] CAG/CTG 反復配列を標的とした環状ピロールイミダゾールポリアミドによる遺伝子発現制御2022

    • 著者名/発表者名
      廣瀬優希、大野智、朝光世煌、橋谷かおり、板東俊和、杉山弘
    • 学会等名
      生体機能関連化学部会若手の会 第33回サマースクール
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Structural Differences (Cyclic versus Linear) Affect the Activity of DNA-Binding Pyrrole-Imidazole Polyamides2022

    • 著者名/発表者名
      Yuki Hirose, Huy N. Hoang, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama, David P. Fairlie
    • 学会等名
      CIPPS 1st annual conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural differences (cyclic versus linear) affect the activity of DNA-binding pyrrole-imidazole polyamides2022

    • 著者名/発表者名
      Yuki Hirose, Huy N. Hoang, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama, David P. Fairlie
    • 学会等名
      11th Annual Conference of the International Chemical Biology Society
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of the properties of a cyclic pyrrole-imidazole polyamide, which specifically binds to CAG/CTG repeat DNA2022

    • 著者名/発表者名
      Yuki Hirose, Tomo Ohno, Sefan Asamitsu, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会(2022)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Development of a Cyclic Pyrrole-Imidazole Polyamide that Strongly and Specifically Binds to CAG/CTG Repeats2021

    • 著者名/発表者名
      Yuki Hirose, Tomo Ohno, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Sequence specific alkylation by a cyclic pyrrole-imidazole polyamide-chlorambucil conjugate2021

    • 著者名/発表者名
      Yuki Hirose, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] Chemical Biology Laboratory

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書 2021 実績報告書
  • [備考] ORCID_Yuki Hirose

    • URL

      https://orcid.org/0000-0002-2956-071X

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
  • [備考] ResearchMap_Yuki Hirose

    • URL

      https://researchmap.jp/yhrs

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] 13th International Peptide Symposium2023

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

URL: 

公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-12-25  

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