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果実成熟におけるエピジェネティック制御システムの解明と検証

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ1715
補助金の研究課題番号 21J22977 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分39030:園芸科学関連
研究機関京都大学

研究代表者

大森 真史  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード果実成熟 / ブルーベリー / ゲノム編集 / エピジェネティクス
研究開始時の研究の概要

ブルーベリーは房内で不均一に成熟が進むため成熟果実を手摘みする必要があり、生産効率を低下させる要因となっている。先行研究において脱メチル化剤処理により果実成熟が促進すること、成熟が進むにつれてグローバルな脱メチル化が起こることが明らかとなっている。本研究では着色遺伝子近傍に挿入されたトランスポゾンの挙動を観察し果実成熟との関係を考察する。また、効率的な遺伝子機能評価系を確立しDNAメチル化を制御する因子の機能解析を行う。以上の実験から果実成熟におけるDNAメチル化の役割を解明し、収穫作業の効率化につながる果実成熟の人為的制御技術の開発につなげる。

研究実績の概要

ブルーベリーは房内で不均一に成熟が進むため成熟果実を手摘みする必要がある。果実成熟を人為的に制御できれば、収穫作業を効率化できる。本研究は果実成熟におけるDNAメチル化の役割の解明,および機能検証のための基盤整備を行った。
DNAメチル化阻害剤5-AzacytidineとABAを果実に処理すると,成熟が急速に進行した。無処理果実では成熟期にグローバルなDNA脱メチル化が発生した。またAGO4等RdDM経路に関わる因子の遺伝子発現がメチル化レベルに影響していること、5-Azacytidine処理がABAシグナル伝達を強化することでVcMYBA1等の成熟関連の遺伝子発現を促進することが示唆された。以上より,果実成熟においてDNAメチル化が重要な役割を果たすと考えられた。本事象に関する重要な因子の機能検証のため、以下の3つのアプローチから機能解析技術の確立を目指した。
1形質転換のボトルネックとなる再分化の分子メカニズム解明:RNA-seq解析によりオーキシンシグナリングが品種間差に寄与している可能性を示した。さらにVcESRの過剰発現によりブルーベリーの再分化が促進され、形質転換効率化ツールとしての使用が期待できる。
2ゲノム編集による早期開花系統の作出:花成抑制遺伝子VcCENをノックアウトし早期開花および連続開花を示す系統を獲得した。これにより幼若相が長い果樹においても遺伝子機能解析を迅速かつ通年で実施できる。
3果実における一過性発現系の開発:高発現ベクターつくばシステムを用いて果実における一過性発現系を確立した。ブルーベリーにおけるVcMYBA1の過剰発現により着色が確認され、VcMYBA1がアントシアニン生合成を促進することが示唆された。成熟期のメチル化変動を制御する候補遺伝子について、ゲノム編集および一過性発現による機能解析を試みたが研究実施期間内に結果を得られなかった。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 8件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Comparative transcriptome and functional analyses provide insights into the key factors regulating shoot regeneration in highbush blueberry2024

    • 著者名/発表者名
      M. Omori, H. Yamane, R. Tao
    • 雑誌名

      Horticulture Research

      巻: - 号: 6

    • DOI

      10.1093/hr/uhae114

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Efficient Transient Expression for Functional Analysis in Fruit Using the Tsukuba System Vector2023

    • 著者名/発表者名
      Omori Masafumi、Fujiwara Yosuke、Yamane Hisayo、Miura Kenji、Tao Ryutaro
    • 雑誌名

      The Horticulture Journal

      巻: 92 号: 3 ページ: 261-268

    • DOI

      10.2503/hortj.QH-062

    • ISSN
      2189-0102, 2189-0110
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The evaluation of CRISPR-Cas9-mediated editing efficiency using endogenous promoters in tetraploid blueberry2023

    • 著者名/発表者名
      Omori M.、Yamane H.、Osakabe K.、Osakabe Y.、Tao R.
    • 雑誌名

      Acta Horticulturae

      巻: 1362 号: 1362 ページ: 49-56

    • DOI

      10.17660/actahortic.2023.1362.8

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient transient gene expression for functional analysis in fruit using the Tsukuba system vector.2023

    • 著者名/発表者名
      M. Omori, Y. Fujiwara, H. Yamane, K. Miura, and R. Tao.
    • 雑誌名

      The Horticulture Journal

      巻: -

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Off-season flowering and expression of flowering-related genes during floral bud differentiation of rabbiteye blueberry in a subtropical climate2022

    • 著者名/発表者名
      Omori Masafumi、Cheng Chieh-Chi、Hsu Fu-Chiun、Chen Shiang-Jiuun、Yamane Hisayo、Tao Ryutaro、Li Kuo-Tan
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 306 ページ: 111458-111458

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2022.111458

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Generation of early flowering blueberry by CRISPR-Cas9-mediated mutagenesis of a flowering repressor gene, VcCENTRORADIALIS (VcCEN).2024

    • 著者名/発表者名
      M. Omori
    • 学会等名
      HZAU & KU Bilateral Workshop for Horticultural Plant Biology
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparative transcriptome and functional analyses provide insights into the key factors regulating shoot regeneration in highbush blueberry.2024

    • 著者名/発表者名
      M. Omori
    • 学会等名
      HZAU & KU Bilateral Workshop for Horticultural Plant Biology
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Establishment of the tools to evaluate the gene function in blueberry.2024

    • 著者名/発表者名
      M. Omori, H. Yamane and R. Tao.
    • 学会等名
      XIII International Vaccinium symposium
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] つくばシステムを用いた様々な果実における一過性発現系の開発2024

    • 著者名/発表者名
      大森真史, 藤原陽介, 山根久代, 三浦謙治,田尾龍太郎.
    • 学会等名
      園芸学会令和6年度春季大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] The use of FPX and developmental genes to improve regeneration efficiency from leaf explants of European pear (Pyrus communis L.).2023

    • 著者名/発表者名
      F. Dai, M. Kikunaga, K. Ono, M. Omori and R. Tao.
    • 学会等名
      4th Asian Horticultural Congress
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification and expression analyses of the CENTRORADIALIS (CEN) gene family involved in flowering regulation in persimmon (Diospyros kaki).2023

    • 著者名/発表者名
      C. Iwami, M. Omori, T-F. Hsiang, S. Sugano, T. Akagi and R. Tao.
    • 学会等名
      4th Asian Horticultural Congress
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Targeted mutagenesis of CENTRORADIALIS using CRISPR/Cas9 system in highbush blueberry.2022

    • 著者名/発表者名
      M. Omori, H. Yamane, K. Osakabe, Y. Osakabe, and R. Tao.
    • 学会等名
      31st International Horticultural Congress
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ブルーベリー再分化メカニズムに関するトランスクリ プトーム解析2022

    • 著者名/発表者名
      大森真史, 山根久代, 田尾龍太郎.
    • 学会等名
      園芸学会令和4年度秋季大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集によるブルーベリー 早期開花系統の作出2022

    • 著者名/発表者名
      大森真史,山根久代, 田尾龍太郎
    • 学会等名
      園芸学会令和5年度春季大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 内在性プロモーターを用いたブルーベリーにおけるゲノム編集効率の向上2022

    • 著者名/発表者名
      大森真史,山根久代,刑部敬史,刑部祐里子, 田尾龍太郎.
    • 学会等名
      園芸学会令和4年度春季大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Pollination compatibility and parthenocarpic fruit set in autumn-bloom rabbiteye blueberry cultivars and breeding lines.2021

    • 著者名/発表者名
      Omori Masafumi, H. Yamane, R. Tao and K-T Li.
    • 学会等名
      XII International Vaccnium symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Environmental regulations on flowering and expression of flowering genes in southern highbush blueberry.2021

    • 著者名/発表者名
      Tseng, W-C., M. Omori, F-C. Hsu, H. Yamane, R. Tao and K-T. Li.
    • 学会等名
      XII International Vaccnium symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 効率的な再分化系開発に向けたブルーベリーENHANCER OF SHOOT REGENERATION (VcESR)遺伝子の機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      大森真史,山根久代, 田尾龍太郎
    • 学会等名
      園芸学会令和3年度秋季大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] ブルーベリーの形質転換とゲノム編集(分担執筆)「ひとりではじめる植物バイオテクノロジー入門 組織培養からゲノム編集まで」2022

    • 著者名/発表者名
      大森真史、山根久代
    • 総ページ数
      413
    • 出版者
      国際文献社
    • ISBN
      9784910603032
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 京都大学果樹園芸学研究室HP

    • URL

      http://www.pomology.kais.kyoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書

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公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-12-25  

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