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多様なアミロイド構造形成を誘起するクロスシーディングの伝播機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ2255
補助金の研究課題番号 22J10017 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

柚 佳祐  神戸大学, 理学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2023年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2022年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードタンパク質 / アミロイド線維 / シーディング / クロスシーディング / 構造伝播
研究開始時の研究の概要

アミロイド線維はタンパク質凝集体の一種であり、様々な疾患の発症に関わる。アミロイド線維には構造多様性が存在し、構造に依存して異なる病態をもたらすと考えられている。しかし、このような構造多様性が生じる機構の詳細は明らかでない。本研究では、アミロイド線維のシーディング反応における構造伝播の観点から、構造多様性が生じる機構の解明を試みる。特に、異種のタンパク質種間で生じるクロスシーディングに着目し、アミロイド線維の伝播過程における構造変化および多様な構造形成のメカニズムを明らかにする。

研究実績の概要

アミロイド線維はタンパク質の異常凝集体の一種であり、様々な疾患の発症に関わる。アミロイド線維の基本構造はクロスβ構造であるが、微視的に構造多様性が存在し、構造に依存して異なる病態を発症すると考えられている。同種のタンパク質間で生じるセルフシーディングでは線維の構造は複製されることが報告されているが、異種のタンパク質種間で生じるクロスシーディングについての詳細は明らかでない。本研究では、主にトランスサイレチン (TTR) に着目し、クロスシーディングの伝播機構の解明を試みた。
まずクロスシーディングを行うための線維形成条件の検討を行った。TTRは中性で安定なため線維化しにくいが、N末端側の配列を欠損したTTR49-127断片について、再現性の良い線維化条件を見出したので、これを解析に用いることにした。試験管内での線維化の再現が難しい全長TTRに対して、TTR49-127をシードとしてクロスシーディングを行ったが、中性ではシーディングは起こらなかった。しかし、研究の過程でTFEを加えることで、中性でも全長TTRが自発的に線維化することを見出した。この結果は、TTRの構造不安定化要因を加えたクロスシーディング反応を検討すれば、生体内での線維化機構に対しての新たな知見が得られることを示唆する。さらに、研究室内の修士学生と共同で、TTR49-127変異体の自発線維化、さらにシーディングの解析を行った。TTR49-127変異体は野生型と異なる線維構造を形成した。またTTR49-127のセルフ及びクロスシーディングでは、構造伝播過程で顕著な構造変化は生じず、おおよそ構造複製されることを明らかにした。以前のインスリンのクロスシーディングにおける多段階の構造変化も踏まえると、クロスシーディングの構造伝播はタンパク質の配列や反応条件に依存しており、多様な動態を示すことが明らかとなった。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Mechanistic Modeling of Amyloid Oligomer and Protofibril Formation in Bovine Insulin2024

    • 著者名/発表者名
      Yuzu Keisuke、Imamura Hiroshi、Nozaki Takuro、Fujii Yuki、Badawy Shaymaa Mohamed Mohamed、Morishima Ken、Okuda Aya、Inoue Rintaro、Sugiyama Masaaki、Chatani Eri
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 436 号: 6 ページ: 168461-168461

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2024.168461

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Oligomerization and aggregation of NAP-22 with several metal ions2024

    • 著者名/発表者名
      Maekawa, S., Yuzu, K., Chatani, E., Morigaki, K.
    • 雑誌名

      Neurosci. Lett.

      巻: 821 ページ: 137623-137623

    • DOI

      10.1016/j.neulet.2023.137623

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pathway Dependence of the Formation and Development of Prefibrillar Aggregates in Insulin B Chain2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa Yuki、Yuzu Keisuke、Yamamoto Naoki、Morishima Ken、Inoue Rintaro、Sugiyama Masaaki、Iwasaki Tetsushi、So Masatomo、Goto Yuji、Tamura Atsuo、Chatani Eri
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 27 号: 13 ページ: 3964-3964

    • DOI

      10.3390/molecules27133964

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Molecular mechanism of oligomer and protofibril formation of bovine insulin in amyloid nucleation2023

    • 著者名/発表者名
      柚佳祐, 今村比呂志, 野崎拓郎, 守島健, 奥田綾, 井上倫太郎, 杉山正明, 茶谷絵理
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Mechanistic modeling of amyloid oligomer and protofibril formation of bovine insulin2023

    • 著者名/発表者名
      柚佳祐, 今村比呂志, 野崎拓郎, 守島健, 奥田綾, 井上倫太郎, 杉山正明, 茶谷絵理
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 断片化したトランスサイレチンのアミロイド線維形成2022

    • 著者名/発表者名
      柚佳祐、松村美里、山本直樹、宗正智、山口圭一、茶谷絵理
    • 学会等名
      第 22 回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] トランスサイレチン断片のアミロイド線維形成2022

    • 著者名/発表者名
      柚佳祐、松村美里、山本直樹、宗正智、山口圭一、後藤祐児、茶谷絵理
    • 学会等名
      第 60 回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Amyloid fibril formation of transthyretin induced by fragmentation2022

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Yuzu, Misato Matsumura, Naoki Yamamoto, Masatomo So, Keiichi Yamaguchi, Yuji Goto, Eri Chatani
    • 学会等名
      The 4th Proteostasis and Disease Research Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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